192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2573 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2573  squalene synthase HpnC  100 
 
 		 294 aa  582  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1124  squalene synthase HpnC  68.75 
 
 		 296 aa  354  8.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0153874  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1463  squalene/phytoene synthase  66.55 
 
 		 345 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1205  squalene/phytoene synthase  67.71 
 
 		 296 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178977  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2506  squalene synthase HpnC  65.22 
 
 		 285 aa  335  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1550  squalene/phytoene synthase  61.15 
 
 		 294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4369  squalene/phytoene synthase  64.91 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1288  putative terpenoid synthase-related protein  63.57 
 
 		 276 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  58.22 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2961  squalene/phytoene synthase  57.79 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277039  hitchhiker  0.00507473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2548  squalene synthase HpnC  58.16 
 
 		 276 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2705  squalene/phytoene synthase  51.42 
 
 		 269 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000135521  hitchhiker  0.00000104011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  52.84 
 
 		 282 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  48.81 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  44.4 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7037  squalene synthase HpnC  42.11 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0019  putative squalene/phytoene synthase  43.8 
 
 		 288 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  46.21 
 
 		 299 aa  188  9e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  43.06 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  39.77 
 
 		 294 aa  155  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  38.21 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  35.02 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0819  squalene/phytoene synthase  37.31 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  36.73 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5717  squalene/phytoene synthase  39.77 
 
 		 379 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  38.87 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3153  squalene synthase HpnC  43.32 
 
 		 298 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23120  squalene synthase HpnC  39.39 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47471  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6350  squalene synthase HpnC  42.23 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0219835  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2685  squalene/phytoene synthase  35.29 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1832  squalene synthase HpnC  35.96 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  38.43 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6668  squalene synthase HpnC  36.25 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2217  squalene synthase HpnC  36.84 
 
 		 299 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7143  squalene synthase HpnC  40.78 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3240  squalene synthase HpnC  39.42 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1941  squalene synthase HpnC  36.4 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.692084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4264  squalene synthase HpnC  36.03 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1828  squalene synthase HpnC  39.52 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3576  squalene/phytoene synthase  36.03 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0065  squalene/phytoene synthase  37.8 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.114754  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1723  squalene/phytoene synthase  35.63 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5423  squalene synthase HpnC  42.86 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2272  squalene/phytoene synthase  34.03 
 
 		 292 aa  99  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.267768  normal  0.247445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2966  putative phytoene synthase  40.31 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0119  squalene/phytoene synthase  37.3 
 
 		 278 aa  93.6  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  36.11 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1717  squalene/phytoene synthase  38.22 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38263  normal  0.104213 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  31.58 
 
 		 310 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  34.21 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  32.25 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  32.25 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  32.25 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  30.33 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  30.93 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  30.4 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  30.4 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  35.29 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  29.96 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  31.14 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  32.36 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  35.71 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  33 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  33.64 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  30 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  30.48 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0142  phytoene synthase  29.78 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4953  squalene/phytoene synthase  34 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251638  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  34.48 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  31.31 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  29.58 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  28.02 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  31.17 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  30.81 
 
 		 575 aa  65.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  31.78 
 
 		 564 aa  65.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  27.75 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  31.43 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  26.69 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  25.49 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0270  phytoene synthase  30.58 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1913  squalene/phytoene synthase  30.58 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  30.61 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  31.61 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  31.77 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  31.09 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  28.14 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  32.61 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  29.75 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  29.72 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  30.93 
 
 		 364 aa  62.4  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  27.51 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3154  squalene synthase HpnD  31.9 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  32.02 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  27.85 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  29.21 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  30.45 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  32.11 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>