212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1124 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1124  squalene synthase HpnC  100 
 
 		 296 aa  584  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0153874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1205  squalene/phytoene synthase  98.31 
 
 		 296 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178977  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1463  squalene/phytoene synthase  71.48 
 
 		 345 aa  377  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2573  squalene synthase HpnC  68.75 
 
 		 294 aa  350  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4369  squalene/phytoene synthase  66.56 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1550  squalene/phytoene synthase  60.54 
 
 		 294 aa  317  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  61.7 
 
 		 296 aa  314  9e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1288  putative terpenoid synthase-related protein  66.42 
 
 		 276 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2506  squalene synthase HpnC  61.54 
 
 		 285 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2961  squalene/phytoene synthase  59.51 
 
 		 297 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277039  hitchhiker  0.00507473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2548  squalene synthase HpnC  59.71 
 
 		 276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0126311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2705  squalene/phytoene synthase  52.92 
 
 		 269 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000135521  hitchhiker  0.00000104011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  53.96 
 
 		 282 aa  242  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  48.16 
 
 		 281 aa  228  9e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  44.28 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0019  putative squalene/phytoene synthase  43.8 
 
 		 288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7037  squalene synthase HpnC  43.43 
 
 		 288 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  45.32 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  42.19 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  41.41 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  35.27 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  35.36 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  37.14 
 
 		 291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  35.05 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0819  squalene/phytoene synthase  36.54 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5717  squalene/phytoene synthase  38.08 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6668  squalene synthase HpnC  37.23 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3153  squalene synthase HpnC  41.71 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23120  squalene synthase HpnC  36.75 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47471  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  39.01 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1832  squalene synthase HpnC  35.29 
 
 		 299 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2217  squalene synthase HpnC  35.59 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1941  squalene synthase HpnC  35.14 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.692084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6350  squalene synthase HpnC  41.15 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0219835  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3240  squalene synthase HpnC  38.84 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113337 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0065  squalene/phytoene synthase  35.29 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.114754  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1828  squalene synthase HpnC  38.92 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2272  squalene/phytoene synthase  33.2 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.267768  normal  0.247445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  32.49 
 
 		 310 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4264  squalene synthase HpnC  34.82 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2685  squalene/phytoene synthase  34.76 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1723  squalene/phytoene synthase  35.16 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7143  squalene synthase HpnC  38.14 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5423  squalene synthase HpnC  41.1 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3576  squalene/phytoene synthase  34.01 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0119  squalene/phytoene synthase  41.1 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  35.4 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  33.68 
 
 		 282 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  32.25 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  32.25 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  32.25 
 
 		 316 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  36.15 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  30.58 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  34.24 
 
 		 333 aa  82.4  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  33.85 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2966  putative phytoene synthase  40.85 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1717  squalene/phytoene synthase  35.71 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38263  normal  0.104213 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  32.81 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  35.51 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  27.27 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2218  squalene synthase HpnD  33.73 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  37.84 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  33.33 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1942  squalene synthase HpnD  33.73 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.802248 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  28.06 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  26.77 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  35.29 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  33.14 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  32.82 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  34.92 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  29.15 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  31.91 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6349  squalene synthase HpnD  34.43 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00743094  normal  0.0909411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  29.13 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  28.35 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  30.71 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  31.6 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  25.33 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  31.25 
 
 		 283 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  26.4 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.63 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  28.09 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  34.69 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2102  putative phytoene synthase  32.32 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  30.21 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1491  squalene/phytoene synthase  32.32 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116412  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  26.32 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1131  putative phytoene synthase  32.32 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0886071  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1411  putative phytoene synthase  32.32 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3277  squalene/phytoene synthase family protein  32.32 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3163  squalene/phytoene synthase family protein  32.32 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.395921  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  28.09 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4953  squalene/phytoene synthase  33.85 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  31.03 
 
 		 324 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  31.96 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  31.46 
 
 		 354 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  25.93 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  27.69 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  30.61 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>