226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00920 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  100 
 
 		 279 aa  566  1e-160  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0058  squalene/phytoene synthase  64.87 
 
 		 279 aa  360  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2036  phytoene synthase  52.33 
 
 		 278 aa  296  3e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5619  Squalene/phytoene synthase  52.96 
 
 		 275 aa  291  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5959  Squalene/phytoene synthase  49.82 
 
 		 278 aa  279  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.581126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2092  Phytoene synthase  53.05 
 
 		 278 aa  273  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2031  Squalene/phytoene synthase  48.75 
 
 		 278 aa  271  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2892  Squalene/phytoene synthase  35.61 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0910578 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21230  phytoene/squalene synthetase  35.11 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12760  phytoene/squalene synthetase  37.84 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.614964 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04440  phytoene/squalene synthetase  36.1 
 
 		 298 aa  181  9.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13840  phytoene/squalene synthetase  35.11 
 
 		 326 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000498285  normal  0.916013 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0341  Squalene/phytoene synthase  35.82 
 
 		 312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2544  Squalene/phytoene synthase  36.84 
 
 		 307 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.11325  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0472  Squalene/phytoene synthase  36.73 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3492  Squalene/phytoene synthase  34.8 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  31.82 
 
 		 318 aa  123  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  34.59 
 
 		 313 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  30.53 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  26.85 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  26.97 
 
 		 330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  26.99 
 
 		 312 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  34.97 
 
 		 321 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  29.39 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  29.86 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  28.46 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  31.91 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  29.1 
 
 		 326 aa  104  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  28.22 
 
 		 316 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  28.74 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  28.57 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  34.57 
 
 		 314 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  33.71 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  33.69 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  33.69 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  33.69 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  31.02 
 
 		 317 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  28.31 
 
 		 339 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  28.63 
 
 		 324 aa  96.3  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  26.19 
 
 		 321 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  35.45 
 
 		 315 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  26.39 
 
 		 310 aa  92  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  28 
 
 		 310 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  30.43 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  28.33 
 
 		 289 aa  85.9  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  26.41 
 
 		 326 aa  85.9  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  27.64 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0117  squalene/phytoene synthase  31.4 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  26.82 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  27.08 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  29.84 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  28.07 
 
 		 505 aa  82.4  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  26.49 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  26.74 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  22.27 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  26.49 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  28.27 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  26.06 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  27.17 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  26.16 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  25.54 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  27.05 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  24.23 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2442  squalene synthase HpnC  28.64 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.337802  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  25.5 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  25.24 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  24.81 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  23.83 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0142  phytoene synthase  27.57 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  25.63 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  24.4 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  31.79 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  26.32 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  25.1 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  25.67 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  25.7 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  25.17 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  28.73 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  24.72 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  25.09 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  23.23 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  24.65 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  24.29 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3237  Squalene/phytoene synthase  25.7 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  26.04 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  25.57 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3012  squalene/phytoene synthase  26.33 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.352634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  25.65 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5449  predicted protein  28.72 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  24.53 
 
 		 355 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  28.11 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  22.91 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3153  squalene synthase HpnC  27.59 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  23.62 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  25 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  23.91 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  24.23 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  23.11 
 
 		 575 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>