165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12760  phytoene/squalene synthetase  100 
 
 		 297 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.614964 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04440  phytoene/squalene synthetase  59.71 
 
 		 298 aa  275  6e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21230  phytoene/squalene synthetase  53.96 
 
 		 298 aa  238  8e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13840  phytoene/squalene synthetase  55.85 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000498285  normal  0.916013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2544  Squalene/phytoene synthase  53.76 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.11325  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2892  Squalene/phytoene synthase  51.11 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0910578 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0341  Squalene/phytoene synthase  50.36 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0472  Squalene/phytoene synthase  49.45 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  37.13 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0058  squalene/phytoene synthase  36.03 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3492  Squalene/phytoene synthase  43.79 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2036  phytoene synthase  36.23 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5959  Squalene/phytoene synthase  37.27 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.581126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2092  Phytoene synthase  36.36 
 
 		 278 aa  175  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2031  Squalene/phytoene synthase  37.84 
 
 		 278 aa  172  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5619  Squalene/phytoene synthase  35.27 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  32.84 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  37.44 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  40.84 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  35.1 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  34.93 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  34.8 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  33.57 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  33.57 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  28.29 
 
 		 277 aa  93.2  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  34.88 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  38.71 
 
 		 279 aa  92.4  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  35 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  37.93 
 
 		 330 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  29.69 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  35.27 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  38.22 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  37.69 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  31.69 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  32.53 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  37.23 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  33.71 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  33.2 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  29.93 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  33.48 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  36.13 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  33.79 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  30.18 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  33.33 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  31.6 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  31.87 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0117  squalene/phytoene synthase  32.29 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  30.18 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  27.65 
 
 		 505 aa  68.9  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  29.32 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  30.84 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  30.4 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  30.84 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  31.17 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  28.81 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  30.55 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  28.28 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  27.38 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  31.38 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  27.73 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  30.77 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  28.42 
 
 		 575 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  29.33 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  29.66 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  26.51 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  27.96 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  27.66 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  35.33 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  29.61 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  28.33 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  28.91 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  32.11 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  29.6 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  29.84 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.38 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  31.08 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  28.34 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  28.08 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  32.8 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  26.64 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  30.32 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  31.49 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  29.79 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  29.78 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  24.9 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.88 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  29.06 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  29.67 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  29.1 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3154  squalene synthase HpnD  33.33 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  32.65 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  29.08 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  26.89 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  27.63 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6668  squalene synthase HpnC  30.14 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  30.65 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  27.27 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5717  squalene/phytoene synthase  30.49 
 
 		 379 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.56 
 
 		 316 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>