159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_21230 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_21230  phytoene/squalene synthetase  100 
 
 		 298 aa  583  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13840  phytoene/squalene synthetase  51.55 
 
 		 326 aa  238  8e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000498285  normal  0.916013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12760  phytoene/squalene synthetase  54.51 
 
 		 297 aa  231  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.614964 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04440  phytoene/squalene synthetase  48.76 
 
 		 298 aa  209  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0472  Squalene/phytoene synthase  50.37 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0341  Squalene/phytoene synthase  47.96 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2544  Squalene/phytoene synthase  48.36 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.11325  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2892  Squalene/phytoene synthase  46.27 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0910578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  35.11 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3492  Squalene/phytoene synthase  42.91 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2092  Phytoene synthase  33.57 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0058  squalene/phytoene synthase  34.41 
 
 		 279 aa  172  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5959  Squalene/phytoene synthase  35.92 
 
 		 278 aa  172  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.581126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2031  Squalene/phytoene synthase  37.59 
 
 		 278 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5619  Squalene/phytoene synthase  34.64 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2036  phytoene synthase  32.86 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  36.33 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  33.12 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  34.83 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  31.48 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  33.33 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  34.25 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  32.4 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  33.69 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  33 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  33 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  32.67 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  32.89 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0117  squalene/phytoene synthase  35.48 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  34.63 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  36.29 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  30.9 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  34.92 
 
 		 318 aa  86.3  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  33.2 
 
 		 321 aa  85.9  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  32.98 
 
 		 283 aa  85.9  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  31.55 
 
 		 277 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  28.88 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  31.01 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  32.45 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  31.23 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  29.8 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  36.46 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  25.45 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  32.29 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  31.31 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  31.56 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  28.98 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  28.33 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  29.47 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  28.48 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  28.95 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  34.92 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  26.21 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5449  predicted protein  31.55 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  28.57 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  26.64 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  27.69 
 
 		 575 aa  66.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.05 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  28.72 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  21.45 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  31.77 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  30 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  30.65 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  22.22 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  30 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  35.03 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  21.71 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.6 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  27.67 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  28.8 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  28.68 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  29.81 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  29.81 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  23.2 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  35.79 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  32.34 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  28.06 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  31.82 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  31.31 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  21.13 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  26.92 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  25.51 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  29.35 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  31.91 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  28.47 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  31.28 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  25.84 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  26.88 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2069  Squalene/phytoene synthase  30.21 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  31.1 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  26.55 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  27.95 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  25.54 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  23.72 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  32.38 
 
 		 687 aa  56.2  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  27.3 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  31.67 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  31.67 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>