132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2892 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2892  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 304 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0910578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3492  Squalene/phytoene synthase  54.3 
 
 		 303 aa  244  9e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13840  phytoene/squalene synthetase  51.9 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000498285  normal  0.916013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12760  phytoene/squalene synthetase  51.07 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.614964 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04440  phytoene/squalene synthetase  52.86 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2544  Squalene/phytoene synthase  50.93 
 
 		 307 aa  212  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.11325  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0341  Squalene/phytoene synthase  47.4 
 
 		 312 aa  202  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  35.4 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0472  Squalene/phytoene synthase  49.04 
 
 		 269 aa  192  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21230  phytoene/squalene synthetase  45.2 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5619  Squalene/phytoene synthase  35.04 
 
 		 275 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2036  phytoene synthase  33.09 
 
 		 278 aa  175  8e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0058  squalene/phytoene synthase  33.94 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5959  Squalene/phytoene synthase  35.51 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.581126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2031  Squalene/phytoene synthase  34.67 
 
 		 278 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2092  Phytoene synthase  33.82 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  32.87 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  34.46 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  42.11 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  34.2 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  35.14 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5076  phytoene synthase  34.59 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5164  phytoene synthase  34.59 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0939779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5455  phytoene synthase  34.77 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0351935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  35.96 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  38.38 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  26.98 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1579  squalene/phytoene synthase  33.22 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212502  normal  0.0425272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  34.05 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  37.43 
 
 		 332 aa  87  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  35.03 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1075  squalene/phytoene synthase  28.88 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  33.33 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  34.78 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  39.43 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  31.8 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  37.91 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  35.26 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  34.24 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0117  squalene/phytoene synthase  32.29 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  34.59 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  33.86 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  34.43 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  28.77 
 
 		 505 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  31.18 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  27.71 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  27.94 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  29.45 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  31.25 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  25.35 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  32.17 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5132  squalene/phytoene synthase  31.53 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126114  normal  0.060719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  29.76 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  33.67 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  28.89 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  27.78 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  31.48 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  30.42 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  29.64 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  23.16 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  30.58 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  31.66 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  31.87 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  34.92 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  25.72 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  27.43 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  29.43 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  28.83 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  30.03 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  31.02 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  26.1 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  29.39 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  30.92 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  29.83 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  24.42 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  31.77 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  29.57 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  27.85 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  25.19 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  23.64 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  27.64 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  23.64 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  29.2 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  32.11 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.32 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  29.73 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  32.83 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  29.8 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  30.15 
 
 		 302 aa  52.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  26.29 
 
 		 575 aa  52.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  28.06 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  28.57 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  29.08 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  28.23 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  29.64 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  29.55 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  28.98 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  26.5 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  28.16 
 
 		 355 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1828  squalene synthase HpnC  29.57 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>