113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1498 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1498  phytoene synthase protein  100 
 
 		 285 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1696  Squalene/phytoene synthase  91.93 
 
 		 285 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2656  phytoene synthase  64.75 
 
 		 270 aa  334  7.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1176  putative phytoene synthase protein  59.71 
 
 		 280 aa  325  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691183  normal  0.0670648 
 
 
-
 
NC_004310  BR0893  hypothetical protein  58.5 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0889  hypothetical protein  58.1 
 
 		 277 aa  286  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2334  phytoene synthase  56.18 
 
 		 277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1794  squalene/phytoene synthase  55.51 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2279  squalene/phytoene synthase  47.39 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2494  squalene/phytoene synthase  51.42 
 
 		 289 aa  191  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0526  hypothetical protein  38.97 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2858  Squalene/phytoene synthase  41.35 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0793384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4312  squalene/phytoene synthase  50.7 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2191  Squalene/phytoene synthase  50.63 
 
 		 289 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4225  squalene/phytoene synthase  47.97 
 
 		 298 aa  185  9e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4595  Squalene/phytoene synthase  47.97 
 
 		 298 aa  185  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0988127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4744  Squalene/phytoene synthase  45.12 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0251048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1004  squalene/phytoene synthase  38.87 
 
 		 295 aa  175  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3169  putative phytoene synthase  43.22 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1802  squalene/phytoene synthase  39.42 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.283074  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4403  putative phytoene synthase (terpenoid synthase)  38.67 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617477  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2729  phytoene synthase  41.13 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2774  phytoene synthase  39.44 
 
 		 288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1766  squalene/phytoene synthase  39.04 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567631  normal  0.0104629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3040  putative phytoene synthase  36.01 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2773  phytoene synthase  40 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.186675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1759  putative phytoene synthase protein  34.55 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1695  hypothetical protein  33.9 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305402  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1383  putative phytoene/squalene synthetase  34.66 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0024751  normal  0.842438 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00043  conserved hypothetical protein  28.92 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1180  phytoene/squalene synthetase-like protein  32.2 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2074  phytoene/squalene synthetase-like protein  33.65 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.219879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3104  hypothetical protein  36.05 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0665725  normal  0.469934 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2725  phytoene/squalene synthetase  34.86 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.629616  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1155  hypothetical protein  32.62 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0425779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  27.91 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  28.65 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  25.9 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1894  hypothetical protein  28.33 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4061  hypothetical protein  37.5 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0386  hypothetical protein  28.9 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200827  normal  0.576494 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  25.55 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0906  squalene/phytoene synthase  28.41 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5923  predicted protein  27.16 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1962  hypothetical protein  30.81 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000465234  normal  0.472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  28.63 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  21.76 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  24.7 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33756  predicted protein  27.27 
 
 		 711 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1944  squalene/phytoene synthase  28.5 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  24.73 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  23.67 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  24.14 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  22.93 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  24.34 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  23.02 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  22.78 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  27.92 
 
 		 364 aa  53.9  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  26.34 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  21.05 
 
 		 311 aa  52.4  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  29.03 
 
 		 687 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00870  conserved hypothetical protein  25.18 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  24.82 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  22.59 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  23.81 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  26.34 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  23.5 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  21.35 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  24.64 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  25.52 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  22.58 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  24.75 
 
 		 303 aa  49.3  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  19.54 
 
 		 309 aa  49.3  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  30.5 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  28.14 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  27.37 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  23.46 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  22.9 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  21.35 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  21.09 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  21.61 
 
 		 309 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  20.28 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  23.94 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  28.3 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.77 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  27.72 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  27.64 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  25.53 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  25.12 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  22.26 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  22.71 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  25.77 
 
 		 361 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  22.75 
 
 		 310 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  21.72 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  21.69 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  24.71 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  24.91 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  22.06 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>