19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00870 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006682  CNM00870  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  570  1.0000000000000001e-162  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00043  conserved hypothetical protein  27.19 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33737  predicted protein  21.48 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.605326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5923  predicted protein  24.18 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2858  Squalene/phytoene synthase  24.91 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0793384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2279  squalene/phytoene synthase  26.04 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1498  phytoene synthase protein  25.72 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2191  Squalene/phytoene synthase  25.19 
 
 		 289 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33756  predicted protein  25.09 
 
 		 711 aa  49.3  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2656  phytoene synthase  22.76 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2494  squalene/phytoene synthase  26.64 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1696  Squalene/phytoene synthase  25.09 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4744  Squalene/phytoene synthase  24.26 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0251048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4225  squalene/phytoene synthase  25.32 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4595  Squalene/phytoene synthase  25.32 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0988127 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0889  hypothetical protein  25.25 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1794  squalene/phytoene synthase  23.81 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830515  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0893  hypothetical protein  25.25 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  23.59 
 
 		 2198 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>