104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_5923 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009362  OSTLU_5923  predicted protein  100 
 
 		 293 aa  587  1e-166  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.918435 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00043  conserved hypothetical protein  27.53 
 
 		 392 aa  106  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1766  squalene/phytoene synthase  30.43 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567631  normal  0.0104629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4403  putative phytoene synthase (terpenoid synthase)  31.32 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617477  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3040  putative phytoene synthase  32.18 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1802  squalene/phytoene synthase  27.44 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.283074  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4744  Squalene/phytoene synthase  30.69 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0251048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3169  putative phytoene synthase  27.67 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33756  predicted protein  29.07 
 
 		 711 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2191  Squalene/phytoene synthase  29.89 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2729  phytoene synthase  28.8 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2774  phytoene synthase  27.69 
 
 		 288 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4312  squalene/phytoene synthase  32.73 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4225  squalene/phytoene synthase  29.96 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4595  Squalene/phytoene synthase  29.96 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0988127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2773  phytoene synthase  29.59 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.186675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2334  phytoene synthase  28.8 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2279  squalene/phytoene synthase  28.68 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2858  Squalene/phytoene synthase  27.07 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0793384 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0889  hypothetical protein  27.49 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0893  hypothetical protein  27.49 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2494  squalene/phytoene synthase  29.36 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1004  squalene/phytoene synthase  25.75 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1794  squalene/phytoene synthase  29.18 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830515  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00870  conserved hypothetical protein  24.18 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  26 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33737  predicted protein  21.63 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.605326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0526  hypothetical protein  25.7 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1498  phytoene synthase protein  27.16 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  24.73 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  24.27 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  26.81 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1696  Squalene/phytoene synthase  27.16 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  24.06 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1176  putative phytoene synthase protein  27.73 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691183  normal  0.0670648 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  25.33 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  22.57 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0386  hypothetical protein  31.44 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200827  normal  0.576494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2656  phytoene synthase  26.56 
 
 		 270 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.83 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  27.31 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  25.17 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  25.09 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  22.57 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  22.14 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  25.8 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  24.04 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  31.54 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  25.7 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4139  squalene synthase HpnD  26.48 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  23.26 
 
 		 2198 aa  49.3  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1759  putative phytoene synthase protein  30.73 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  21.38 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  24.84 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  27.81 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0010  putative squalene/phytoene synthase  27.34 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1975  putative phytoene synthase  25.66 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3330  putative phytoene synthase  25.66 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1248  putative phytoene synthase  25.66 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245345  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7027  squalene synthase HpnD  25.7 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.597423  hitchhiker  0.000000555779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  29.43 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1482  phytoene synthase, putative  27.32 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2502  phytoene synthase, putative  27.32 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  25.9 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2347  putative phytoene synthase  25.44 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2389  putative phytoene synthase  25.44 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  26.44 
 
 		 332 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  24.12 
 
 		 294 aa  46.6  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  23.61 
 
 		 324 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2098  phytoene synthase, putative  27.17 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389143  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  22.83 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1944  squalene/phytoene synthase  24.49 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  25.6 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  29.73 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  27.42 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  24 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0906  squalene/phytoene synthase  24.14 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26420  phytoene synthase  27.14 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  28.23 
 
 		 350 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3084  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.69 
 
 		 350 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2303  putative phytoene synthase  25.24 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  22.68 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  25.09 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  25.28 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  26.17 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  25.63 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1724  squalene/phytoene synthase  24.76 
 
 		 279 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5506  squalene synthase HpnD  27.32 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6145  squalene/phytoene synthase  24.42 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1934  squalene/phytoene synthase  24.42 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1958  squalene synthase HpnD  24.42 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0340477  normal  0.450684 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0017  squalene/phytoene synthase  29.08 
 
 		 282 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  25.93 
 
 		 505 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  23.15 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.65 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5245  squalene/phytoene synthase  24.42 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1922  squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3173  squalene synthase HpnD  27.53 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3104  hypothetical protein  32.2 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0665725  normal  0.469934 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>