137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2309 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 350 aa  712    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1173  Squalene/phytoene synthase  84 
 
 		 348 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1206  Squalene/phytoene synthase  53.3 
 
 		 355 aa  388  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000204086  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0934  Squalene/phytoene synthase  55.03 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0902  Squalene/phytoene synthase  48.3 
 
 		 351 aa  294  1e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.883554  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1321  squalene/phytoene synthase  28.96 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4822  Squalene/phytoene synthase  31.23 
 
 		 360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2280  squalene/phytoene synthase  33.12 
 
 		 359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0813  squalene synthase  29.64 
 
 		 362 aa  116  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2125  phytoene/squalene synthetase family protein  30.59 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1784  Squalene synthase  29.93 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31144  predicted protein  26.54 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20770  Squalene/phytoene synthase  31.6 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00645323  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2690  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.1 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286545  normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0892  Squalene/phytoene synthase  32.08 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000100627  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15920  Squalene synthase  23.51 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0957  squalene/phytoene synthase  26.17 
 
 		 380 aa  95.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0189  squalene/phytoene synthase  27.95 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433494  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0124  hypothetical protein  26.47 
 
 		 345 aa  89.4  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0110  hypothetical protein  25.64 
 
 		 345 aa  86.3  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3686  squalene/phytoene synthase  27.1 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4159  squalene/phytoene synthase  26.79 
 
 		 354 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283896  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83429  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  23.77 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.274803  normal  0.0738823 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10396  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01220)  24.37 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2156  squalene/phytoene synthase family protein  28.76 
 
 		 564 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05660  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative  25.16 
 
 		 542 aa  76.3  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148096  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0365  Squalene/phytoene synthase  25.65 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5450  squalene/phytoene synthase  24.15 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035034 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4328  squalene/phytoene synthase  25.63 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0106814  normal  0.0939133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1749  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.77 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364934  normal  0.191421 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1133  squalene/phytoene synthase family protein  27.88 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1840  squalene/phytoene synthase family protein  27.88 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156378  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1762  squalene/phytoene synthase family protein  27.88 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5617  Squalene/phytoene synthase  25.1 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0843  squalene/phytoene synthase family protein  27.88 
 
 		 516 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336434  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0418  squalene/phytoene synthase family protein  27.88 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0327  squalene/phytoene synthase family protein  27.88 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479613  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2107  squalene/phytoene synthase family protein  27.88 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3084  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.23 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4104  squalene/phytoene synthase  26.48 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132439  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4262  squalene/phytoene synthase  26.48 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0172457  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3255  squalene/phytoene synthase  26.48 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0169  squalene/phytoene synthase  21 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  normal  0.0348824 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2584  squalene/phytoene synthase  26.75 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2638  squalene/phytoene synthase  26.75 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.444406  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13160  predicted protein  23.69 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0485  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.03 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  35.61 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4026  Squalene/phytoene synthase  28.57 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.600735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  26.47 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1894  Squalene/phytoene synthase  25.97 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0502  Squalene/phytoene synthase  26.05 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0519  Squalene/phytoene synthase  26.05 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  24.45 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  29.67 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  21.99 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  30.43 
 
 		 364 aa  57  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1814  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.04 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  31.65 
 
 		 505 aa  56.2  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  22.58 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  28.25 
 
 		 325 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  23.9 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  32.14 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  26.95 
 
 		 321 aa  53.1  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2069  Squalene/phytoene synthase  30.32 
 
 		 355 aa  52.8  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910011 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2272  squalene/phytoene synthase  25.74 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.267768  normal  0.247445 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  25.29 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  26.03 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  35.96 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  26.03 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0064  phytoene/squalene synthetase  23.98 
 
 		 236 aa  51.6  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  38.24 
 
 		 281 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  28.93 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  25.53 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  33.98 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  26 
 
 		 292 aa  51.2  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  38.89 
 
 		 277 aa  50.8  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  25.11 
 
 		 299 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  24.48 
 
 		 302 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3132  squalene/phytoene synthase  22.98 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  30.59 
 
 		 324 aa  50.1  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  26.22 
 
 		 342 aa  50.1  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  25 
 
 		 302 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  25.71 
 
 		 304 aa  49.7  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  25 
 
 		 302 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  28.08 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0065  squalene/phytoene synthase  28.07 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.114754  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  33.65 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  31.25 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  26.79 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  23.5 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1047  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.03 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.477192  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  25.69 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  27.27 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  26.85 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  28.17 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  32.43 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7143  squalene synthase HpnC  26.85 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>