217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2191 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2191  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 289 aa  560  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2494  squalene/phytoene synthase  87.18 
 
 		 289 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2279  squalene/phytoene synthase  73.26 
 
 		 292 aa  378  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4744  Squalene/phytoene synthase  77.21 
 
 		 298 aa  360  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0251048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4225  squalene/phytoene synthase  76.84 
 
 		 298 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4595  Squalene/phytoene synthase  76.84 
 
 		 298 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0988127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2858  Squalene/phytoene synthase  53.38 
 
 		 287 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0793384 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0889  hypothetical protein  50.72 
 
 		 277 aa  269  4e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0893  hypothetical protein  50.72 
 
 		 277 aa  268  8e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2334  phytoene synthase  49.45 
 
 		 277 aa  265  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1004  squalene/phytoene synthase  44.76 
 
 		 295 aa  252  5.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1794  squalene/phytoene synthase  52.71 
 
 		 274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830515  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1696  Squalene/phytoene synthase  49.06 
 
 		 285 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2656  phytoene synthase  48.52 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4312  squalene/phytoene synthase  53.03 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1498  phytoene synthase protein  47.94 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1176  putative phytoene synthase protein  46.64 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691183  normal  0.0670648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3169  putative phytoene synthase  45.76 
 
 		 290 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4403  putative phytoene synthase (terpenoid synthase)  41.39 
 
 		 288 aa  195  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617477  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2774  phytoene synthase  41.67 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0526  hypothetical protein  36.29 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2729  phytoene synthase  41.57 
 
 		 287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1802  squalene/phytoene synthase  37.87 
 
 		 287 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.283074  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3040  putative phytoene synthase  40.81 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2773  phytoene synthase  42.34 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.186675 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1766  squalene/phytoene synthase  37.23 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567631  normal  0.0104629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1759  putative phytoene synthase protein  37.84 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5923  predicted protein  30.19 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1180  phytoene/squalene synthetase-like protein  38.73 
 
 		 236 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1894  hypothetical protein  34.63 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  29.73 
 
 		 278 aa  95.9  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0906  squalene/phytoene synthase  31.58 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1695  hypothetical protein  35.47 
 
 		 256 aa  92.8  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305402  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  27.94 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  29.03 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  31.29 
 
 		 330 aa  89.4  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  28.68 
 
 		 293 aa  89.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  29 
 
 		 280 aa  89  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  25.68 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  26.62 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1383  putative phytoene/squalene synthetase  38.51 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0024751  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  26.91 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1155  hypothetical protein  32.39 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0425779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0386  hypothetical protein  31.95 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200827  normal  0.576494 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2074  phytoene/squalene synthetase-like protein  39.66 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.219879 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  24.91 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  30.36 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  33.67 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.4 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00043  conserved hypothetical protein  27.57 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  30.05 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3104  hypothetical protein  35.03 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0665725  normal  0.469934 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  24.81 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  24.04 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  24.04 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  24.4 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2725  phytoene/squalene synthetase  40.48 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.629616  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1962  hypothetical protein  38.29 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000465234  normal  0.472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  30.07 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  24.48 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  24.44 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  24.81 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  30.56 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  24.14 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  24.57 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  28.62 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  24.81 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33756  predicted protein  28.85 
 
 		 711 aa  73.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  24.74 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  29.76 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  28.25 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  30.48 
 
 		 687 aa  72.4  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  24.57 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  22.34 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  26.05 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  30.38 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  22.34 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  22.99 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  26.02 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  27.08 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  31.22 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  26.37 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  21.61 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.14 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  27.37 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4139  squalene synthase HpnD  27.59 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00870  conserved hypothetical protein  25.35 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  23.57 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  24.88 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1724  squalene/phytoene synthase  30.24 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1958  squalene synthase HpnD  27.54 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0340477  normal  0.450684 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  22.18 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3154  squalene synthase HpnD  31.77 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  26.89 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  30.42 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  33.85 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  28.22 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2684  squalene/phytoene synthase  31.68 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2347  putative phytoene synthase  30.81 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>