210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2494 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2494  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 289 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2191  Squalene/phytoene synthase  87.18 
 
 		 289 aa  407  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2279  squalene/phytoene synthase  70.74 
 
 		 292 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4744  Squalene/phytoene synthase  74.81 
 
 		 298 aa  359  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0251048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4595  Squalene/phytoene synthase  74.81 
 
 		 298 aa  346  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0988127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4225  squalene/phytoene synthase  74.81 
 
 		 298 aa  346  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2858  Squalene/phytoene synthase  52.31 
 
 		 287 aa  289  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0793384 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2334  phytoene synthase  50.74 
 
 		 277 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0889  hypothetical protein  51.64 
 
 		 277 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0893  hypothetical protein  51.64 
 
 		 277 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1004  squalene/phytoene synthase  44.17 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1696  Squalene/phytoene synthase  48.7 
 
 		 285 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1794  squalene/phytoene synthase  50.93 
 
 		 274 aa  232  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830515  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1498  phytoene synthase protein  47.92 
 
 		 285 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2656  phytoene synthase  49.07 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1176  putative phytoene synthase protein  46.64 
 
 		 280 aa  225  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691183  normal  0.0670648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4312  squalene/phytoene synthase  53.03 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3169  putative phytoene synthase  44.28 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4403  putative phytoene synthase (terpenoid synthase)  42.03 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617477  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2774  phytoene synthase  41.16 
 
 		 288 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2729  phytoene synthase  41.48 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0526  hypothetical protein  34.31 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3040  putative phytoene synthase  42.42 
 
 		 281 aa  173  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1802  squalene/phytoene synthase  37.91 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.283074  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2773  phytoene synthase  42.96 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.186675 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1766  squalene/phytoene synthase  37.63 
 
 		 286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567631  normal  0.0104629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1759  putative phytoene synthase protein  38.87 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1180  phytoene/squalene synthetase-like protein  39.88 
 
 		 236 aa  99.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1894  hypothetical protein  34.41 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  27.27 
 
 		 278 aa  95.5  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  29.14 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  27.55 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1695  hypothetical protein  36.45 
 
 		 256 aa  92.8  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305402  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  28.9 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0906  squalene/phytoene synthase  30.77 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  25.64 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  30.18 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1155  hypothetical protein  38.85 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0425779 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5923  predicted protein  27.78 
 
 		 293 aa  86.3  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1383  putative phytoene/squalene synthetase  37.7 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0024751  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  26.24 
 
 		 286 aa  86.3  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00043  conserved hypothetical protein  28.02 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  25.35 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2074  phytoene/squalene synthetase-like protein  39.66 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.219879 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  26.1 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3104  hypothetical protein  37.64 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0665725  normal  0.469934 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.66 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0386  hypothetical protein  30.63 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200827  normal  0.576494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2725  phytoene/squalene synthetase  36.32 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.629616  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  32.69 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  28.64 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  29.26 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1962  hypothetical protein  38.29 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000465234  normal  0.472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  29.72 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  25.23 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  32.12 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33756  predicted protein  28.37 
 
 		 711 aa  73.2  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  26.42 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  31.13 
 
 		 687 aa  72.8  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  26.01 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  31.12 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  30.04 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  31.31 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  25.76 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  30.15 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  22.39 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  23.23 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  26.32 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  24.17 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.43 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  22.73 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2347  putative phytoene synthase  28.25 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2389  putative phytoene synthase  28.25 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1958  squalene synthase HpnD  28.16 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0340477  normal  0.450684 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  23.18 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  23.3 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1849  squalene synthase HpnD  27.37 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  hitchhiker  0.00598695 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2098  phytoene synthase, putative  27.7 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389143  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1922  squalene/phytoene synthase  27.37 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  29.5 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5245  squalene/phytoene synthase  28.21 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1337  squalene synthase HpnD  27.84 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058937 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  22.68 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1975  putative phytoene synthase  28 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3330  putative phytoene synthase  28 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1248  putative phytoene synthase  28 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245345  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1482  phytoene synthase, putative  28.84 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2502  phytoene synthase, putative  28.84 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  24.54 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3154  squalene synthase HpnD  29.39 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00870  conserved hypothetical protein  25.09 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  30.65 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  26.11 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0010  putative squalene/phytoene synthase  28.31 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  29.91 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  30 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  21.56 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  24.31 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  26.4 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.3 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>