82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0408 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0408  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.18 
 
 
1107 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  31.21 
 
 
1263 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.82 
 
 
1041 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30.26 
 
 
354 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  26.44 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  27.27 
 
 
482 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  29.51 
 
 
867 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  28.78 
 
 
937 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  28.78 
 
 
937 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  29.79 
 
 
242 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  28.91 
 
 
713 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  34.57 
 
 
892 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  32.73 
 
 
757 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  30.19 
 
 
1344 aa  58.2  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0946  hypothetical protein  21.51 
 
 
333 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000225711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  27.92 
 
 
508 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1475  hypothetical protein  30.77 
 
 
225 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.661845  normal  0.169207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  25.69 
 
 
416 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  29.75 
 
 
448 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  34.52 
 
 
2324 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  30.43 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  27.45 
 
 
863 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  30.1 
 
 
149 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  28.26 
 
 
1749 aa  54.7  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  27.91 
 
 
443 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  26.85 
 
 
453 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  24.03 
 
 
1015 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  24.56 
 
 
436 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  27.59 
 
 
761 aa  53.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  26.5 
 
 
307 aa  52.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  30.77 
 
 
293 aa  52.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 
436 aa  52.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  27.21 
 
 
204 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  26.36 
 
 
396 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  22.56 
 
 
472 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  27.27 
 
 
478 aa  50.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  24.51 
 
 
444 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1269  leucine-rich repeat-containing protein  23.65 
 
 
360 aa  49.7  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.407419  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4538  leucine-rich repeat protein  27.78 
 
 
225 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  29.55 
 
 
528 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  24 
 
 
434 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  29.63 
 
 
1744 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  30.23 
 
 
886 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  21.05 
 
 
476 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  23.74 
 
 
648 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2365  leucine-rich repeat-containing protein  27.47 
 
 
569 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.505593  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  25.93 
 
 
451 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  26.58 
 
 
445 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  24.56 
 
 
490 aa  45.8  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  27.17 
 
 
528 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 
439 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04070  conserved hypothetical protein  22.33 
 
 
1281 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  28.03 
 
 
441 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  24.18 
 
 
467 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  31.97 
 
 
569 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  21.28 
 
 
447 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 
440 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  24 
 
 
446 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  29.76 
 
 
675 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  25.89 
 
 
440 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 
653 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2354  leucine-rich repeat protein  25.83 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.6201199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  25 
 
 
438 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  20.18 
 
 
558 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  23.45 
 
 
580 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 
469 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  26.14 
 
 
1024 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  25.56 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  21.84 
 
 
437 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  26.04 
 
 
980 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  21.84 
 
 
437 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  21.28 
 
 
447 aa  42.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  28.24 
 
 
925 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 
471 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  30.43 
 
 
1017 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  27.78 
 
 
447 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  20.57 
 
 
447 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  20.57 
 
 
446 aa  42.4  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  21.84 
 
 
437 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>