59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40171 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_40171  predicted protein  100 
 
 		 364 aa  765    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280697  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  28.95 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  31.18 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  30.41 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  27.98 
 
 		 215 aa  75.5  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  29.35 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32671  GTP-binding protein  28.18 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  30.94 
 
 		 214 aa  68.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.495831 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  30.77 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  29.57 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  29.82 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  29.89 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  28 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  25.29 
 
 		 885 aa  57.4  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  28.93 
 
 		 240 aa  57  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  26.09 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  27.78 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  25.62 
 
 		 203 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  26.25 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  26.88 
 
 		 203 aa  54.3  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  24.85 
 
 		 183 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.359872 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  27.49 
 
 		 184 aa  53.9  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  29.19 
 
 		 229 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  23.75 
 
 		 214 aa  52.8  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  25.62 
 
 		 210 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  21.12 
 
 		 213 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  27.33 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  27.84 
 
 		 230 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  23.9 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  25.62 
 
 		 208 aa  50.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  24.88 
 
 		 236 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  22.49 
 
 		 220 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  24.53 
 
 		 208 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  27.17 
 
 		 213 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  24.71 
 
 		 211 aa  50.4  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  27.88 
 
 		 205 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  24.38 
 
 		 205 aa  50.1  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  24.12 
 
 		 205 aa  49.7  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44586  predicted protein  29.81 
 
 		 178 aa  49.7  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395695  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  23.24 
 
 		 206 aa  49.3  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40841  predicted protein  22.7 
 
 		 254 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  24.38 
 
 		 201 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  22.6 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  25.62 
 
 		 203 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  24.07 
 
 		 218 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45953  predicted protein  24.87 
 
 		 857 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535873  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  20.62 
 
 		 214 aa  47.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.514091 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  20.62 
 
 		 215 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  28.12 
 
 		 233 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  26.25 
 
 		 597 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  26.25 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  26.95 
 
 		 210 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  28.48 
 
 		 600 aa  44.3  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0956  small GTP-binding protein  25.47 
 
 		 157 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740927  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  25.15 
 
 		 201 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  23.81 
 
 		 199 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  25.48 
 
 		 200 aa  43.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.26784 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02890  RAN small monomeric GTPase, putative  22.29 
 
 		 211 aa  42.7  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  21.38 
 
 		 220 aa  42.7  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>