More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0956 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0956  small GTP-binding protein  100 
 
 		 157 aa  313  5e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740927  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0990  small GTP-binding protein  94.27 
 
 		 157 aa  296  5e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1691  small GTP-binding protein  91.72 
 
 		 157 aa  287  4e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1017  small GTP-binding protein  75.32 
 
 		 158 aa  236  9e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0457  small GTP-binding protein  35.85 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0486938 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2190  small GTP-binding protein  37.4 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1323  small GTP-binding protein  34.25 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.415004  normal  0.083818 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  35.11 
 
 		 692 aa  68.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1430  putative ATP/GTP-binding protein  36.72 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0326  translation initiation factor IF-2  32.08 
 
 		 614 aa  67  0.0000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2531  protein of unknown function ATP binding  30.26 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2203  protein of unknown function ATP binding protein  36.92 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.000213997 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  30.77 
 
 		 658 aa  66.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  33.85 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  34.88 
 
 		 690 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1192  protein of unknown function, ATP binding protein  36.15 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  34.88 
 
 		 693 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1209  protein of unknown function, ATP binding  36.15 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.762798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1219  protein of unknown function, ATP binding  36.15 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  38.89 
 
 		 656 aa  64.7  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01830  predicted GTPase  36.92 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0275  protein of unknown function ATP binding  36.15 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.550996 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1441  translation initiation factor IF-2  33.08 
 
 		 685 aa  63.9  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.155659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  32.35 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  31.62 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0174  protein of unknown function ATP binding protein  35.38 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0313  protein of unknown function ATP binding  34.85 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0533217  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  32.35 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0983  translation initiation factor IF-2  30.82 
 
 		 593 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3682  protein of unknown function ATP binding  37.23 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_855  translation initiation factor 2 (IF-2)  30.82 
 
 		 593 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00962289  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  36.11 
 
 		 679 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  36.11 
 
 		 679 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  33.59 
 
 		 971 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2803  protein of unknown function ATP binding protein  31.36 
 
 		 204 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000564845  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0275  protein of unknown function ATP binding protein  32.19 
 
 		 193 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5269  hypothetical protein  31.58 
 
 		 197 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3225  protein of unknown function ATP binding  30.34 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  35.19 
 
 		 985 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3172  protein of unknown function ATP binding protein  34.85 
 
 		 203 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216462  normal  0.253397 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0255  translation initiation factor IF-2  32.82 
 
 		 700 aa  61.6  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.405261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  35.19 
 
 		 822 aa  61.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  35.85 
 
 		 928 aa  61.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0253  protein of unknown function, ATP binding  37.36 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1539  protein of unknown function, ATP binding  33.08 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0846  small GTP-binding protein  33.85 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4502  small GTP-binding protein  28.91 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.475752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2448  protein of unknown function ATP binding  33.08 
 
 		 194 aa  60.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0874  translation initiation factor IF-2  34.26 
 
 		 593 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0133057  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0139  translation initiation factor IF-2  32.89 
 
 		 908 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0819  protein of unknown function, ATP binding  33.11 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl295  translation initiation factor IF-2  38.18 
 
 		 629 aa  58.9  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000364465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  34.26 
 
 		 732 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0392  protein of unknown function ATP binding  25.73 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.494311  normal  0.506956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3123  protein of unknown function ATP binding protein  31.51 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  33.33 
 
 		 860 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1042  translation elongation factor G, putative  30.95 
 
 		 646 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000207187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0776  protein of unknown function ATP binding  38.04 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0080  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0120715  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  34.82 
 
 		 1124 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0656  small GTP-binding protein  41.76 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  29.68 
 
 		 729 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2558  translation initiation factor IF-2  33.94 
 
 		 1031 aa  58.9  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413996  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0816  protein of unknown function ATP binding protein  30.82 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0322936 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  33.33 
 
 		 845 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2206  small GTP-binding protein  30.56 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  normal  0.0744426 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  33.33 
 
 		 874 aa  58.9  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  33.94 
 
 		 920 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3340  protein of unknown function ATP binding protein  29.07 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.294578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1233  putative tetracycline resistance protein  30.16 
 
 		 646 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.139219  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  27.44 
 
 		 1029 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf787  translation initiation factor IF-2  34.78 
 
 		 553 aa  58.9  0.00000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2576  small GTP-binding protein  30.56 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  35.78 
 
 		 854 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  37.5 
 
 		 1183 aa  58.9  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  35.65 
 
 		 1131 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34260  predicted GTPase  34.09 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0943  putative ATP/GTP-binding protein  29.49 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  37.5 
 
 		 1183 aa  58.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2069  protein of unknown function ATP binding  32.19 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0763  protein of unknown function ATP binding  32.43 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  36.28 
 
 		 1012 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5489  protein of unknown function ATP binding  34.38 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448291  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3051  protein of unknown function ATP binding protein  30.83 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4886  protein of unknown function, ATP binding  31.54 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5992  normal  0.0181219 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  34.86 
 
 		 692 aa  58.2  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2047  putative ATP/GTP-binding protein  30.5 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4263  protein of unknown function ATP binding  31.94 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  31.97 
 
 		 739 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37500  predicted GTPase  30.14 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.287948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  28.12 
 
 		 1045 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3196  GTPase-like protein  35.07 
 
 		 207 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0563  translation initiation factor IF-2  32.05 
 
 		 830 aa  57.4  0.00000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.114537  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13398  ATP/GTP-binding protein  30.77 
 
 		 193 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00758  normal  0.0959612 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  31.53 
 
 		 877 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2447  putative ATP/GTP-binding protein  30.37 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204882  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  29.2 
 
 		 774 aa  57.4  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  29.03 
 
 		 738 aa  57.4  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5993  protein of unknown function ATP binding  32.82 
 
 		 198 aa  57.4  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222654  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  28.85 
 
 		 903 aa  57.4  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>