More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf787 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf787  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
553 aa  1116    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  48.63 
 
 
732 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  46.81 
 
 
739 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl295  translation initiation factor IF-2  47.31 
 
 
629 aa  496  1e-139  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000364465  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0326  translation initiation factor IF-2  48.75 
 
 
614 aa  495  1e-139  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  47.27 
 
 
834 aa  491  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  45.44 
 
 
883 aa  478  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  44.71 
 
 
884 aa  475  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0333  translation initiation factor IF-2  46.4 
 
 
620 aa  477  1e-133  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.792261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  45.6 
 
 
822 aa  474  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  44.91 
 
 
921 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0131  translation initiation factor IF-2  44.91 
 
 
871 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  46.27 
 
 
686 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  43.72 
 
 
945 aa  470  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  44.78 
 
 
947 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  46.08 
 
 
686 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  46.27 
 
 
686 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  43.04 
 
 
903 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  45.82 
 
 
882 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  44.36 
 
 
980 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0171  translation initiation factor IF-2  44.55 
 
 
871 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00654664  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0149  translation initiation factor IF-2  44.91 
 
 
854 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00379745  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  44.18 
 
 
986 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  45.9 
 
 
686 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  46.08 
 
 
686 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  46.08 
 
 
686 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  45.9 
 
 
686 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  45.62 
 
 
692 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  44.5 
 
 
924 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  45.9 
 
 
688 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  45.42 
 
 
860 aa  466  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  43.35 
 
 
875 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  45.59 
 
 
885 aa  463  1e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  45.11 
 
 
689 aa  463  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  43.35 
 
 
875 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  45.6 
 
 
914 aa  462  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  44.55 
 
 
877 aa  464  1e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  44.3 
 
 
752 aa  462  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  45.67 
 
 
882 aa  463  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  46 
 
 
927 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  44.86 
 
 
888 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  45.29 
 
 
688 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  45.11 
 
 
720 aa  456  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  46.1 
 
 
943 aa  455  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  46.53 
 
 
896 aa  452  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  42.18 
 
 
943 aa  455  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  43.19 
 
 
856 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  45.29 
 
 
949 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  42.65 
 
 
1079 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  43.41 
 
 
1029 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  43.64 
 
 
829 aa  454  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  44.67 
 
 
838 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  48.77 
 
 
928 aa  451  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  42.62 
 
 
873 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  44.3 
 
 
962 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  47.51 
 
 
774 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  47.31 
 
 
922 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  43.84 
 
 
705 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  43.84 
 
 
705 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  43.42 
 
 
903 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  43.19 
 
 
907 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  41.8 
 
 
711 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  43.42 
 
 
888 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  42.75 
 
 
885 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0983  translation initiation factor IF-2  43.14 
 
 
593 aa  445  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  43.37 
 
 
979 aa  442  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  42.23 
 
 
892 aa  444  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  42.11 
 
 
959 aa  443  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  42.29 
 
 
964 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  41.09 
 
 
1005 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  46.46 
 
 
868 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  46.98 
 
 
868 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  44.01 
 
 
917 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  41.92 
 
 
848 aa  445  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  42.91 
 
 
956 aa  442  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  41.85 
 
 
898 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  46.53 
 
 
920 aa  442  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  42.62 
 
 
984 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0874  translation initiation factor IF-2  42.37 
 
 
593 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0133057  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  45.82 
 
 
879 aa  442  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  42.88 
 
 
951 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  42.7 
 
 
882 aa  442  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  43.61 
 
 
686 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  42.52 
 
 
970 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  42.88 
 
 
946 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  42.21 
 
 
868 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  41.95 
 
 
889 aa  441  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  43.82 
 
 
848 aa  439  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0139  translation initiation factor IF-2  41.76 
 
 
908 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  42.81 
 
 
1128 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  44.3 
 
 
917 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  44.65 
 
 
1131 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0141  translation initiation factor IF-2  41.92 
 
 
1010 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  46.82 
 
 
845 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  42.5 
 
 
1042 aa  440  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  47.26 
 
 
964 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  45.74 
 
 
971 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  43.45 
 
 
738 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  42.11 
 
 
990 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  40.33 
 
 
883 aa  439  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0536071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>