More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0333 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl295  translation initiation factor IF-2  70.48 
 
 		 629 aa  904    Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000364465  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0333  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 620 aa  1239    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.792261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  54.25 
 
 		 739 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  54.33 
 
 		 732 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0326  translation initiation factor IF-2  53.61 
 
 		 614 aa  613  9.999999999999999e-175  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  51.72 
 
 		 686 aa  589  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  51.72 
 
 		 686 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  51.55 
 
 		 688 aa  588  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 686 aa  585  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 686 aa  586  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 686 aa  586  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  51.8 
 
 		 689 aa  585  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 686 aa  586  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 686 aa  585  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 		 688 aa  586  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 720 aa  579  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  49.32 
 
 		 752 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 1029 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 705 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 705 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 971 aa  569  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 692 aa  566  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 		 943 aa  567  1e-160  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 		 927 aa  562  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 860 aa  559  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  47.44 
 
 		 903 aa  561  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  48.01 
 
 		 985 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  48.29 
 
 		 882 aa  553  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  49.31 
 
 		 686 aa  551  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  49.09 
 
 		 829 aa  549  1e-155  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  48.1 
 
 		 822 aa  545  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  46 
 
 		 884 aa  545  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  47.21 
 
 		 882 aa  542  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  47.28 
 
 		 834 aa  542  1e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  47.41 
 
 		 1161 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  49.17 
 
 		 845 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  48.47 
 
 		 1116 aa  541  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  46 
 
 		 986 aa  538  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  45.83 
 
 		 882 aa  538  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0817  translation initiation factor IF-2  49.05 
 
 		 950 aa  537  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  45.49 
 
 		 883 aa  534  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  45.66 
 
 		 980 aa  535  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  47.02 
 
 		 921 aa  535  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  47.16 
 
 		 679 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  47.16 
 
 		 679 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  49.23 
 
 		 938 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  46.03 
 
 		 854 aa  524  1e-147  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0476  translation initiation factor IF-2  45.93 
 
 		 602 aa  522  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258534  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  53.25 
 
 		 928 aa  520  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  46.03 
 
 		 738 aa  521  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  44.92 
 
 		 949 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  47.01 
 
 		 673 aa  516  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  45.45 
 
 		 888 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  45.52 
 
 		 729 aa  518  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  45.5 
 
 		 920 aa  512  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  45.47 
 
 		 949 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  44.46 
 
 		 711 aa  511  1e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0770  translation initiation factor IF-2  47.1 
 
 		 894 aa  509  1e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  45.76 
 
 		 879 aa  511  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  46.44 
 
 		 992 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  46.21 
 
 		 922 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  43.72 
 
 		 947 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  44.75 
 
 		 1051 aa  508  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  48.1 
 
 		 879 aa  506  9.999999999999999e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  49.9 
 
 		 656 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  46.14 
 
 		 1005 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  44.19 
 
 		 943 aa  507  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  47.77 
 
 		 1131 aa  504  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  45.88 
 
 		 975 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  46.27 
 
 		 997 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  49.65 
 
 		 1035 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  45.88 
 
 		 975 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  44.52 
 
 		 887 aa  503  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  45.88 
 
 		 975 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  45 
 
 		 907 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  45.3 
 
 		 945 aa  504  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  46.26 
 
 		 956 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  45.21 
 
 		 856 aa  505  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  47.67 
 
 		 962 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  44.88 
 
 		 991 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  45.88 
 
 		 975 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  45.67 
 
 		 924 aa  505  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  45.7 
 
 		 975 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  45.26 
 
 		 896 aa  498  1e-140  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  45.55 
 
 		 936 aa  500  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  43.97 
 
 		 886 aa  502  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  45.7 
 
 		 975 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  44.27 
 
 		 952 aa  499  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  45.7 
 
 		 971 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  43.08 
 
 		 873 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  45.7 
 
 		 976 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  45.88 
 
 		 969 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  45.45 
 
 		 979 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  45.7 
 
 		 971 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  45.53 
 
 		 971 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  45.7 
 
 		 971 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  45.7 
 
 		 975 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  45.36 
 
 		 972 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1047  translation initiation factor IF-2  44.79 
 
 		 1053 aa  495  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  45.25 
 
 		 948 aa  498  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>