More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0990 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0990  small GTP-binding protein  100 
 
 		 157 aa  313  5e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1691  small GTP-binding protein  94.27 
 
 		 157 aa  299  1e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0956  small GTP-binding protein  94.27 
 
 		 157 aa  296  5e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740927  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1017  small GTP-binding protein  77.22 
 
 		 158 aa  244  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0457  small GTP-binding protein  34.59 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0486938 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2190  small GTP-binding protein  37.4 
 
 		 161 aa  87.4  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1323  small GTP-binding protein  32.53 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.415004  normal  0.083818 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0326  translation initiation factor IF-2  33.33 
 
 		 614 aa  68.2  0.00000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1430  putative ATP/GTP-binding protein  35.94 
 
 		 190 aa  67  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  32.14 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  32.86 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  33.85 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4502  small GTP-binding protein  32.03 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.475752  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1192  protein of unknown function, ATP binding protein  34.62 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1209  protein of unknown function, ATP binding  34.62 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.762798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2531  protein of unknown function ATP binding  33.87 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  32.86 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1219  protein of unknown function, ATP binding  34.62 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0846  small GTP-binding protein  30.54 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  30.13 
 
 		 658 aa  63.9  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3225  protein of unknown function ATP binding  27.81 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  32.82 
 
 		 692 aa  63.9  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0080  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0120715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2203  protein of unknown function ATP binding protein  37.69 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.000213997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0819  protein of unknown function, ATP binding  31.43 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  37.04 
 
 		 732 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5269  hypothetical protein  33.08 
 
 		 197 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  28.05 
 
 		 1029 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1539  protein of unknown function, ATP binding  27.74 
 
 		 188 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0275  protein of unknown function ATP binding protein  30.82 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0943  putative ATP/GTP-binding protein  31.61 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0763  protein of unknown function ATP binding  30.86 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4263  protein of unknown function ATP binding  28.57 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3682  protein of unknown function ATP binding  36.17 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  36.11 
 
 		 656 aa  60.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  28.3 
 
 		 693 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  35.78 
 
 		 692 aa  60.8  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  28.3 
 
 		 690 aa  60.5  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0656  small GTP-binding protein  42.86 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  33.61 
 
 		 739 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3607  protein of unknown function ATP binding protein  31.41 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0816  protein of unknown function ATP binding protein  31.51 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0322936 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0255  translation initiation factor IF-2  31.37 
 
 		 700 aa  59.7  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.405261  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  36.11 
 
 		 985 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  36.7 
 
 		 686 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  36.7 
 
 		 686 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  36.7 
 
 		 686 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0275  protein of unknown function ATP binding  34.62 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.550996 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3825  translation initiation factor IF-2  36.7 
 
 		 430 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.29796e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  36.7 
 
 		 686 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13398  ATP/GTP-binding protein  28.28 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00758  normal  0.0959612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2448  protein of unknown function ATP binding  32.33 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0563  translation initiation factor IF-2  32.05 
 
 		 830 aa  59.7  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.114537  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  36.7 
 
 		 689 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3340  protein of unknown function ATP binding protein  30.18 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.294578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  36.7 
 
 		 688 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0776  protein of unknown function ATP binding  36.96 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  36.7 
 
 		 686 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4886  protein of unknown function, ATP binding  28.39 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5992  normal  0.0181219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3123  protein of unknown function ATP binding protein  32.19 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2803  protein of unknown function ATP binding protein  28.82 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000564845  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  34.82 
 
 		 1124 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1441  translation initiation factor IF-2  30.53 
 
 		 685 aa  59.7  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.155659  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01830  predicted GTPase  33.85 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0760  putative ATP/GTP-binding protein  30.18 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2047  putative ATP/GTP-binding protein  27.81 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2558  translation initiation factor IF-2  32.41 
 
 		 1031 aa  58.9  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413996  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2576  small GTP-binding protein  30.2 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2069  protein of unknown function ATP binding  32.19 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  34.26 
 
 		 822 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2006  protein of unknown function ATP binding  32.31 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.959688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4333  protein of unknown function, ATP binding  37.65 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  28.48 
 
 		 673 aa  58.9  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2206  small GTP-binding protein  30.2 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  normal  0.0744426 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  34.26 
 
 		 679 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1042  translation elongation factor G, putative  31.75 
 
 		 646 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000207187  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  34.26 
 
 		 679 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3872  protein of unknown function, ATP binding  31.25 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.21835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0174  protein of unknown function ATP binding protein  33.85 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  28.39 
 
 		 387 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  27.74 
 
 		 774 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0831  translation initiation factor IF-2  34.68 
 
 		 882 aa  58.5  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.857351  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10835  predicted protein  29.03 
 
 		 579 aa  58.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  35.78 
 
 		 686 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34260  predicted GTPase  34.09 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4183  protein of unknown function ATP binding  26.85 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.578204  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3051  protein of unknown function ATP binding protein  25.86 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  35.78 
 
 		 686 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  28.21 
 
 		 903 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  33.93 
 
 		 1113 aa  58.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0313  protein of unknown function ATP binding  29.49 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0533217  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  34.91 
 
 		 928 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  27.5 
 
 		 1045 aa  58.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  35.71 
 
 		 1183 aa  58.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  33.33 
 
 		 971 aa  58.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  35.71 
 
 		 1183 aa  58.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  34.26 
 
 		 874 aa  58.2  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2857  protein of unknown function, ATP binding  30.82 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1233  putative tetracycline resistance protein  30.95 
 
 		 646 aa  58.2  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.139219  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16851  translation initiation factor IF-2  35.71 
 
 		 1114 aa  58.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>