116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3872 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3872  protein of unknown function, ATP binding  100 
 
 		 205 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.21835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4263  protein of unknown function ATP binding  98.05 
 
 		 205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0819  protein of unknown function, ATP binding  66.84 
 
 		 203 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0763  protein of unknown function ATP binding  66.12 
 
 		 196 aa  261  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7865  protein of unknown function ATP binding  64.29 
 
 		 202 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.348128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3316  protein of unknown function ATP binding  61.46 
 
 		 195 aa  254  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24580  predicted GTPase  59.7 
 
 		 204 aa  251  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0461  protein of unknown function ATP binding  62.05 
 
 		 202 aa  250  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5416  protein of unknown function ATP binding  63.93 
 
 		 195 aa  249  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0977  hypothetical protein  60.41 
 
 		 208 aa  248  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.235397  normal  0.429497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5185  protein of unknown function ATP binding  64.84 
 
 		 195 aa  247  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.729225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0973  hypothetical protein  61.86 
 
 		 194 aa  246  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.617604  normal  0.248176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5269  hypothetical protein  64.2 
 
 		 197 aa  245  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34260  predicted GTPase  64 
 
 		 195 aa  242  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5993  protein of unknown function ATP binding  59.18 
 
 		 198 aa  241  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222654  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0943  putative ATP/GTP-binding protein  59.57 
 
 		 195 aa  239  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0641  protein of unknown function, ATP binding  58.67 
 
 		 198 aa  239  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.437609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2857  protein of unknown function, ATP binding  61.5 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1791  hypothetical protein  61.73 
 
 		 195 aa  238  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3666  protein of unknown function ATP binding protein  61.2 
 
 		 205 aa  238  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1811  hypothetical protein  65.52 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0816  protein of unknown function ATP binding protein  58.64 
 
 		 197 aa  238  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0322936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2387  protein of unknown function ATP binding  61.08 
 
 		 207 aa  236  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1824  hypothetical protein  61.34 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2006  protein of unknown function ATP binding  64.74 
 
 		 186 aa  235  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.959688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1192  protein of unknown function, ATP binding protein  56.7 
 
 		 193 aa  234  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1209  protein of unknown function, ATP binding  56.7 
 
 		 193 aa  234  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.762798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1219  protein of unknown function, ATP binding  56.7 
 
 		 193 aa  234  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1539  protein of unknown function, ATP binding  60.44 
 
 		 188 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4886  protein of unknown function, ATP binding  60.22 
 
 		 192 aa  232  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5992  normal  0.0181219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0359  protein of unknown function ATP binding protein  59.18 
 
 		 191 aa  230  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3811  protein of unknown function ATP binding protein  58.12 
 
 		 197 aa  228  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2047  putative ATP/GTP-binding protein  57.78 
 
 		 197 aa  226  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3051  protein of unknown function ATP binding protein  60.92 
 
 		 198 aa  226  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13398  ATP/GTP-binding protein  58.19 
 
 		 193 aa  226  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00758  normal  0.0959612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0153  hypothetical protein  61.08 
 
 		 191 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2803  protein of unknown function ATP binding protein  61.2 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000564845  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3196  GTPase-like protein  62.79 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3802  protein of unknown function ATP binding protein  56.77 
 
 		 202 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.575457  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1292  protein of unknown function ATP binding  61.05 
 
 		 203 aa  225  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980215  hitchhiker  0.00348486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1806  protein of unknown function ATP binding protein  65.34 
 
 		 192 aa  225  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110416  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2447  putative ATP/GTP-binding protein  58.96 
 
 		 195 aa  224  9e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5473  protein of unknown function ATP binding  60.1 
 
 		 204 aa  223  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  0.984202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3977  protein of unknown function ATP binding  56.1 
 
 		 200 aa  223  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3340  protein of unknown function ATP binding protein  58.05 
 
 		 193 aa  223  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.294578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3607  protein of unknown function ATP binding protein  54.73 
 
 		 204 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3252  hypothetical protein  55.15 
 
 		 195 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37500  predicted GTPase  58.05 
 
 		 190 aa  222  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.287948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0275  protein of unknown function ATP binding  57.67 
 
 		 205 aa  221  6e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.550996 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0760  putative ATP/GTP-binding protein  56.74 
 
 		 196 aa  221  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0275  protein of unknown function ATP binding protein  60.23 
 
 		 193 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02280  predicted GTPase  58.96 
 
 		 197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.650431  normal  0.614387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0392  protein of unknown function ATP binding  57.22 
 
 		 197 aa  218  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.494311  normal  0.506956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3123  protein of unknown function ATP binding protein  53.43 
 
 		 199 aa  218  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3596  protein of unknown function, ATP binding  53.66 
 
 		 199 aa  217  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2069  protein of unknown function ATP binding  57.95 
 
 		 197 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3225  protein of unknown function ATP binding  55.68 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0366  protein of unknown function ATP binding  58.96 
 
 		 211 aa  212  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01830  predicted GTPase  58.19 
 
 		 189 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3172  protein of unknown function ATP binding protein  59.66 
 
 		 203 aa  211  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216462  normal  0.253397 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0174  protein of unknown function ATP binding protein  57.06 
 
 		 310 aa  209  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0492  protein of unknown function ATP binding protein  56.02 
 
 		 201 aa  208  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0313  protein of unknown function ATP binding  56.82 
 
 		 207 aa  205  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0533217  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5489  protein of unknown function ATP binding  54.44 
 
 		 206 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448291  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1430  putative ATP/GTP-binding protein  56.14 
 
 		 190 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33540  predicted GTPase  51.58 
 
 		 199 aa  198  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168507  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1148  hypothetical protein  54.97 
 
 		 199 aa  198  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371751  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2448  protein of unknown function ATP binding  52.75 
 
 		 194 aa  194  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2752  protein of unknown function ATP binding protein  56.21 
 
 		 218 aa  191  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06970  predicted GTPase  54.29 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0253092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2203  protein of unknown function ATP binding protein  57.5 
 
 		 191 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.000213997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1063  protein of unknown function ATP binding  54.19 
 
 		 186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4813  protein of unknown function ATP binding  53.8 
 
 		 202 aa  181  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4183  protein of unknown function ATP binding  51.61 
 
 		 197 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.578204  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3845  protein of unknown function ATP binding  52.75 
 
 		 203 aa  178  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2804  putative ATP/GTP-binding protein  52.41 
 
 		 188 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197811  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4333  protein of unknown function, ATP binding  53.16 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1141  protein of unknown function ATP binding protein  52.02 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2531  protein of unknown function ATP binding  49.71 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1434  protein of unknown function ATP binding protein  48.63 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473916  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1323  small GTP-binding protein  44.51 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.415004  normal  0.083818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0846  small GTP-binding protein  41.9 
 
 		 176 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  39.66 
 
 		 176 aa  118  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  39.11 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3915  protein of unknown function, ATP binding  38.04 
 
 		 177 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  38.73 
 
 		 176 aa  111  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0080  small GTP-binding protein  39.31 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0120715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3230  small GTP-binding protein  37.08 
 
 		 177 aa  108  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.137976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4502  small GTP-binding protein  34.73 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.475752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0776  protein of unknown function ATP binding  40 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  31.21 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0379  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2401  protein of unknown function ATP binding  35.39 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.37736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5250  protein of unknown function ATP binding  30.27 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3682  protein of unknown function ATP binding  34.62 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2206  small GTP-binding protein  31.15 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  normal  0.0744426 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2576  small GTP-binding protein  31.15 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0656  small GTP-binding protein  38.28 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0133  ATP binding protein  28.41 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0253  protein of unknown function, ATP binding  36.72 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>