114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3172 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3172  protein of unknown function ATP binding protein  100 
 
 
203 aa  407  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216462  normal  0.253397 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0275  protein of unknown function ATP binding  83.58 
 
 
205 aa  351  5e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.550996 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0174  protein of unknown function ATP binding protein  90.66 
 
 
310 aa  348  3e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01830  predicted GTPase  92.27 
 
 
189 aa  347  9e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0313  protein of unknown function ATP binding  80.39 
 
 
207 aa  324  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0533217  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5993  protein of unknown function ATP binding  62.56 
 
 
198 aa  242  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222654  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0641  protein of unknown function, ATP binding  62.31 
 
 
198 aa  240  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.437609  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5416  protein of unknown function ATP binding  64.32 
 
 
195 aa  237  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7865  protein of unknown function ATP binding  66.67 
 
 
202 aa  235  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0461  protein of unknown function ATP binding  62.57 
 
 
202 aa  232  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02280  predicted GTPase  62.86 
 
 
197 aa  227  8e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.650431  normal  0.614387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0973  hypothetical protein  64 
 
 
194 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.617604  normal  0.248176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24580  predicted GTPase  63.28 
 
 
204 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37500  predicted GTPase  59.67 
 
 
190 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.287948  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3811  protein of unknown function ATP binding protein  60.11 
 
 
197 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2447  putative ATP/GTP-binding protein  60.11 
 
 
195 aa  225  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0977  hypothetical protein  63.43 
 
 
208 aa  225  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.235397  normal  0.429497 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0819  protein of unknown function, ATP binding  59.11 
 
 
203 aa  225  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0763  protein of unknown function ATP binding  58.13 
 
 
196 aa  224  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3252  hypothetical protein  59.55 
 
 
195 aa  224  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129642  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0816  protein of unknown function ATP binding protein  63.43 
 
 
197 aa  224  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0322936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2857  protein of unknown function, ATP binding  59.24 
 
 
206 aa  222  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3666  protein of unknown function ATP binding protein  59.59 
 
 
205 aa  222  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132662  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3225  protein of unknown function ATP binding  60.66 
 
 
201 aa  222  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0153  hypothetical protein  58 
 
 
191 aa  221  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2387  protein of unknown function ATP binding  61.24 
 
 
207 aa  220  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0943  putative ATP/GTP-binding protein  62.29 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1824  hypothetical protein  61.41 
 
 
197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3051  protein of unknown function ATP binding protein  62.21 
 
 
198 aa  218  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1292  protein of unknown function ATP binding  57.61 
 
 
203 aa  219  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980215  hitchhiker  0.00348486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34260  predicted GTPase  58.92 
 
 
195 aa  219  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63353  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3802  protein of unknown function ATP binding protein  60.57 
 
 
202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.575457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1791  hypothetical protein  63.95 
 
 
195 aa  218  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1192  protein of unknown function, ATP binding protein  58.99 
 
 
193 aa  217  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1209  protein of unknown function, ATP binding  58.99 
 
 
193 aa  217  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.762798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1219  protein of unknown function, ATP binding  58.99 
 
 
193 aa  217  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0760  putative ATP/GTP-binding protein  60.33 
 
 
196 aa  216  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2047  putative ATP/GTP-binding protein  58.43 
 
 
197 aa  216  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1811  hypothetical protein  63.37 
 
 
179 aa  215  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0275  protein of unknown function ATP binding protein  56.42 
 
 
193 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2069  protein of unknown function ATP binding  58.1 
 
 
197 aa  214  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1806  protein of unknown function ATP binding protein  67.43 
 
 
192 aa  214  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110416  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4886  protein of unknown function, ATP binding  60.57 
 
 
192 aa  214  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5992  normal  0.0181219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1539  protein of unknown function, ATP binding  62.29 
 
 
188 aa  214  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3123  protein of unknown function ATP binding protein  58.89 
 
 
199 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3340  protein of unknown function ATP binding protein  59.2 
 
 
193 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.294578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0359  protein of unknown function ATP binding protein  53 
 
 
191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635716  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4263  protein of unknown function ATP binding  59.66 
 
 
205 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0392  protein of unknown function ATP binding  59.78 
 
 
197 aa  211  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.494311  normal  0.506956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3872  protein of unknown function, ATP binding  59.66 
 
 
205 aa  211  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.21835  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2803  protein of unknown function ATP binding protein  57.8 
 
 
204 aa  210  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000564845  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5269  hypothetical protein  58.56 
 
 
197 aa  210  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3196  GTPase-like protein  55.93 
 
 
207 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3596  protein of unknown function, ATP binding  57.63 
 
 
199 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3977  protein of unknown function ATP binding  55.85 
 
 
200 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2448  protein of unknown function ATP binding  57.22 
 
 
194 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1430  putative ATP/GTP-binding protein  55.37 
 
 
190 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3316  protein of unknown function ATP binding  55.31 
 
 
195 aa  203  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1148  hypothetical protein  56.65 
 
 
199 aa  202  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371751  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2203  protein of unknown function ATP binding protein  60 
 
 
191 aa  201  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.000213997 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13398  ATP/GTP-binding protein  56.57 
 
 
193 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00758  normal  0.0959612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2006  protein of unknown function ATP binding  56.42 
 
 
186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.959688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3607  protein of unknown function ATP binding protein  57.78 
 
 
204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5473  protein of unknown function ATP binding  55.67 
 
 
204 aa  195  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  0.984202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3845  protein of unknown function ATP binding  57.78 
 
 
203 aa  194  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0366  protein of unknown function ATP binding  55.75 
 
 
211 aa  188  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5185  protein of unknown function ATP binding  51.63 
 
 
195 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.729225  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4333  protein of unknown function, ATP binding  57.39 
 
 
214 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2752  protein of unknown function ATP binding protein  56.07 
 
 
218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5489  protein of unknown function ATP binding  52.3 
 
 
206 aa  178  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448291  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4183  protein of unknown function ATP binding  52 
 
 
197 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.578204  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06970  predicted GTPase  51.96 
 
 
191 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0253092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4813  protein of unknown function ATP binding  56.22 
 
 
202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1063  protein of unknown function ATP binding  54.02 
 
 
186 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33540  predicted GTPase  47.29 
 
 
199 aa  171  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168507  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0492  protein of unknown function ATP binding protein  54.24 
 
 
201 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2531  protein of unknown function ATP binding  47.7 
 
 
213 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2804  putative ATP/GTP-binding protein  50.28 
 
 
188 aa  154  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197811  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1141  protein of unknown function ATP binding protein  50.26 
 
 
236 aa  148  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289074  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1434  protein of unknown function ATP binding protein  46.7 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3915  protein of unknown function, ATP binding  43.39 
 
 
177 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  42.46 
 
 
176 aa  124  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3230  small GTP-binding protein  42.54 
 
 
177 aa  124  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.137976 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  41.9 
 
 
176 aa  124  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1323  small GTP-binding protein  41.11 
 
 
193 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.415004  normal  0.083818 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0080  small GTP-binding protein  41.9 
 
 
177 aa  123  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0120715  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  41.34 
 
 
176 aa  121  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0846  small GTP-binding protein  40.78 
 
 
176 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0656  small GTP-binding protein  37.78 
 
 
178 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0379  small GTP-binding protein  34.42 
 
 
191 aa  89  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2401  protein of unknown function ATP binding  34.24 
 
 
185 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.37736  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  31.25 
 
 
187 aa  85.9  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0370  protein of unknown function, ATP binding  35.91 
 
 
187 aa  84.7  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.610277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0776  protein of unknown function ATP binding  41.35 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3682  protein of unknown function ATP binding  36.59 
 
 
182 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109872  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2206  small GTP-binding protein  31.55 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  normal  0.0744426 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2576  small GTP-binding protein  31.55 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4502  small GTP-binding protein  33.73 
 
 
172 aa  82  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.475752  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0253  protein of unknown function, ATP binding  35.33 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0133  ATP binding protein  32.32 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>