113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2752 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2752  protein of unknown function ATP binding protein  100 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4813  protein of unknown function ATP binding  68.69 
 
 		 202 aa  258  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2804  putative ATP/GTP-binding protein  73.4 
 
 		 188 aa  256  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5489  protein of unknown function ATP binding  68.28 
 
 		 206 aa  254  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448291  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06970  predicted GTPase  64.48 
 
 		 191 aa  241  6e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0253092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1141  protein of unknown function ATP binding protein  63.45 
 
 		 236 aa  221  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0153  hypothetical protein  62.57 
 
 		 191 aa  218  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3977  protein of unknown function ATP binding  61.05 
 
 		 200 aa  217  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3596  protein of unknown function, ATP binding  61.17 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3340  protein of unknown function ATP binding protein  63.13 
 
 		 193 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.294578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2447  putative ATP/GTP-binding protein  60.92 
 
 		 195 aa  215  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02280  predicted GTPase  62.21 
 
 		 197 aa  214  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.650431  normal  0.614387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0275  protein of unknown function ATP binding protein  62.79 
 
 		 193 aa  214  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0359  protein of unknown function ATP binding protein  60.11 
 
 		 191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2803  protein of unknown function ATP binding protein  61.24 
 
 		 204 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000564845  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3252  hypothetical protein  62.57 
 
 		 195 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3051  protein of unknown function ATP binding protein  62.21 
 
 		 198 aa  210  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3666  protein of unknown function ATP binding protein  60.11 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132662  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4333  protein of unknown function, ATP binding  65.41 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3123  protein of unknown function ATP binding protein  58.66 
 
 		 199 aa  208  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3196  GTPase-like protein  56.84 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3802  protein of unknown function ATP binding protein  57.95 
 
 		 202 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.575457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2069  protein of unknown function ATP binding  56.08 
 
 		 197 aa  205  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3316  protein of unknown function ATP binding  61.99 
 
 		 195 aa  205  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2857  protein of unknown function, ATP binding  55.96 
 
 		 206 aa  204  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3811  protein of unknown function ATP binding protein  57.29 
 
 		 197 aa  204  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2203  protein of unknown function ATP binding protein  62.94 
 
 		 191 aa  202  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.000213997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1430  putative ATP/GTP-binding protein  58.47 
 
 		 190 aa  202  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37500  predicted GTPase  56.5 
 
 		 190 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.287948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2387  protein of unknown function ATP binding  56.99 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24580  predicted GTPase  56.76 
 
 		 204 aa  201  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34260  predicted GTPase  59.88 
 
 		 195 aa  200  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5416  protein of unknown function ATP binding  60.36 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0366  protein of unknown function ATP binding  54.31 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1811  hypothetical protein  58.96 
 
 		 179 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0461  protein of unknown function ATP binding  55.44 
 
 		 202 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0819  protein of unknown function, ATP binding  55.85 
 
 		 203 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1148  hypothetical protein  56.91 
 
 		 199 aa  198  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371751  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2047  putative ATP/GTP-binding protein  58.14 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0763  protein of unknown function ATP binding  56.45 
 
 		 196 aa  197  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1292  protein of unknown function ATP binding  57.31 
 
 		 203 aa  197  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980215  hitchhiker  0.00348486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2006  protein of unknown function ATP binding  60.95 
 
 		 186 aa  194  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.959688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5269  hypothetical protein  57.23 
 
 		 197 aa  194  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5993  protein of unknown function ATP binding  56.32 
 
 		 198 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222654  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0943  putative ATP/GTP-binding protein  57.14 
 
 		 195 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7865  protein of unknown function ATP binding  57.31 
 
 		 202 aa  192  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.348128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5185  protein of unknown function ATP binding  59.65 
 
 		 195 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.729225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0392  protein of unknown function ATP binding  55.43 
 
 		 197 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.494311  normal  0.506956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2531  protein of unknown function ATP binding  55.56 
 
 		 213 aa  191  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0641  protein of unknown function, ATP binding  55.17 
 
 		 198 aa  191  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.437609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1192  protein of unknown function, ATP binding protein  57.31 
 
 		 193 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1209  protein of unknown function, ATP binding  57.31 
 
 		 193 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.762798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1219  protein of unknown function, ATP binding  57.31 
 
 		 193 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1791  hypothetical protein  58.82 
 
 		 195 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3872  protein of unknown function, ATP binding  56.21 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.21835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33540  predicted GTPase  55.14 
 
 		 199 aa  188  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168507  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0977  hypothetical protein  52.36 
 
 		 208 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.235397  normal  0.429497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3607  protein of unknown function ATP binding protein  56.9 
 
 		 204 aa  188  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0275  protein of unknown function ATP binding  55.38 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.550996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5473  protein of unknown function ATP binding  57.47 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  0.984202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0816  protein of unknown function ATP binding protein  56.14 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0322936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4263  protein of unknown function ATP binding  55.03 
 
 		 205 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0973  hypothetical protein  55.31 
 
 		 194 aa  185  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.617604  normal  0.248176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1824  hypothetical protein  57.99 
 
 		 197 aa  185  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1539  protein of unknown function, ATP binding  57.4 
 
 		 188 aa  185  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3225  protein of unknown function ATP binding  55.93 
 
 		 201 aa  184  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0760  putative ATP/GTP-binding protein  51.04 
 
 		 196 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1806  protein of unknown function ATP binding protein  56.17 
 
 		 192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110416  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01830  predicted GTPase  56.18 
 
 		 189 aa  182  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4886  protein of unknown function, ATP binding  56.63 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5992  normal  0.0181219 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0174  protein of unknown function ATP binding protein  55.75 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3172  protein of unknown function ATP binding protein  56.8 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216462  normal  0.253397 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13398  ATP/GTP-binding protein  52.54 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00758  normal  0.0959612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1063  protein of unknown function ATP binding  53.14 
 
 		 186 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2448  protein of unknown function ATP binding  51.18 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1434  protein of unknown function ATP binding protein  53.89 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473916  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0313  protein of unknown function ATP binding  54.12 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0533217  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4183  protein of unknown function ATP binding  50.84 
 
 		 197 aa  164  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.578204  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0492  protein of unknown function ATP binding protein  54.12 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3845  protein of unknown function ATP binding  50.28 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1323  small GTP-binding protein  46.55 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.415004  normal  0.083818 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3230  small GTP-binding protein  40.66 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.137976 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0080  small GTP-binding protein  38.04 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0120715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3915  protein of unknown function, ATP binding  39.89 
 
 		 177 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  39.66 
 
 		 176 aa  105  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  39.08 
 
 		 176 aa  105  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0846  small GTP-binding protein  39.53 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  37.93 
 
 		 176 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0379  small GTP-binding protein  35.39 
 
 		 191 aa  95.9  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0776  protein of unknown function ATP binding  46.53 
 
 		 182 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0656  small GTP-binding protein  34.68 
 
 		 178 aa  88.2  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3682  protein of unknown function ATP binding  36.67 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  29.89 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2206  small GTP-binding protein  29.32 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  normal  0.0744426 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2576  small GTP-binding protein  29.32 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2401  protein of unknown function ATP binding  36 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.37736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5250  protein of unknown function ATP binding  31.43 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4502  small GTP-binding protein  30.95 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.475752  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0133  ATP binding protein  30.11 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0253  protein of unknown function, ATP binding  42.59 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>