118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0776 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0776  protein of unknown function ATP binding  100 
 
 		 182 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0656  small GTP-binding protein  42.53 
 
 		 178 aa  153  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0133  ATP binding protein  41.62 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2206  small GTP-binding protein  39.77 
 
 		 188 aa  134  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  normal  0.0744426 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2576  small GTP-binding protein  39.77 
 
 		 188 aa  134  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3682  protein of unknown function ATP binding  39.66 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0370  protein of unknown function, ATP binding  38.95 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.610277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  40.59 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  37.08 
 
 		 176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0846  small GTP-binding protein  39.87 
 
 		 176 aa  111  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  40.35 
 
 		 176 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1323  small GTP-binding protein  40.24 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.415004  normal  0.083818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0379  small GTP-binding protein  37.91 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5269  hypothetical protein  36.41 
 
 		 197 aa  101  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3845  protein of unknown function ATP binding  48.54 
 
 		 203 aa  100  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0153  hypothetical protein  41.3 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3051  protein of unknown function ATP binding protein  39.47 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34260  predicted GTPase  37.42 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3915  protein of unknown function, ATP binding  41.41 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3230  small GTP-binding protein  50 
 
 		 177 aa  99.8  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.137976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5473  protein of unknown function ATP binding  36.81 
 
 		 204 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  0.984202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3666  protein of unknown function ATP binding protein  37.36 
 
 		 205 aa  99.4  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0275  protein of unknown function ATP binding protein  40.56 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5250  protein of unknown function ATP binding  54.64 
 
 		 180 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2203  protein of unknown function ATP binding protein  39.64 
 
 		 191 aa  98.2  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.000213997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2401  protein of unknown function ATP binding  38.8 
 
 		 185 aa  98.2  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.37736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0359  protein of unknown function ATP binding protein  40.68 
 
 		 191 aa  98.6  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3196  GTPase-like protein  40.48 
 
 		 207 aa  98.2  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0392  protein of unknown function ATP binding  42.22 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.494311  normal  0.506956 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0080  small GTP-binding protein  36.47 
 
 		 177 aa  98.2  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0120715  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3340  protein of unknown function ATP binding protein  51.49 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.294578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2448  protein of unknown function ATP binding  38.1 
 
 		 194 aa  97.4  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1148  hypothetical protein  40.33 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371751  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3607  protein of unknown function ATP binding protein  37.17 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1192  protein of unknown function, ATP binding protein  38.42 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1209  protein of unknown function, ATP binding  38.42 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.762798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3123  protein of unknown function ATP binding protein  38.86 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1219  protein of unknown function, ATP binding  38.42 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24580  predicted GTPase  35.79 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2803  protein of unknown function ATP binding protein  38.76 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000564845  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3811  protein of unknown function ATP binding protein  40.35 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1791  hypothetical protein  49.04 
 
 		 195 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0943  putative ATP/GTP-binding protein  37.22 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4886  protein of unknown function, ATP binding  37.57 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5992  normal  0.0181219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3252  hypothetical protein  40.49 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2857  protein of unknown function, ATP binding  37.43 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0816  protein of unknown function ATP binding protein  46.15 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0322936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2047  putative ATP/GTP-binding protein  38.33 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2447  putative ATP/GTP-binding protein  48.51 
 
 		 195 aa  95.5  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2387  protein of unknown function ATP binding  36.7 
 
 		 207 aa  95.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5416  protein of unknown function ATP binding  36.9 
 
 		 195 aa  95.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0763  protein of unknown function ATP binding  36.26 
 
 		 196 aa  94.7  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0366  protein of unknown function ATP binding  36.61 
 
 		 211 aa  94.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1539  protein of unknown function, ATP binding  36.9 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0819  protein of unknown function, ATP binding  35.71 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0977  hypothetical protein  45.19 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.235397  normal  0.429497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0973  hypothetical protein  36.81 
 
 		 194 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.617604  normal  0.248176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5993  protein of unknown function ATP binding  35.39 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222654  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4263  protein of unknown function ATP binding  36.02 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13398  ATP/GTP-binding protein  37.58 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00758  normal  0.0959612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2069  protein of unknown function ATP binding  36.17 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2752  protein of unknown function ATP binding protein  46.53 
 
 		 218 aa  92.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1811  hypothetical protein  44.23 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0760  putative ATP/GTP-binding protein  48 
 
 		 196 aa  92  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3802  protein of unknown function ATP binding protein  40.36 
 
 		 202 aa  92  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.575457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1824  hypothetical protein  36.26 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1430  putative ATP/GTP-binding protein  35.52 
 
 		 190 aa  91.7  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0641  protein of unknown function, ATP binding  34.83 
 
 		 198 aa  91.7  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.437609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7865  protein of unknown function ATP binding  47.57 
 
 		 202 aa  91.3  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.348128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3872  protein of unknown function, ATP binding  36.41 
 
 		 205 aa  90.9  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.21835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0461  protein of unknown function ATP binding  41.44 
 
 		 202 aa  91.3  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5185  protein of unknown function ATP binding  36.92 
 
 		 195 aa  90.9  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.729225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3596  protein of unknown function, ATP binding  38.42 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5489  protein of unknown function ATP binding  46.53 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448291  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2394  ATP binding protein  35.63 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06970  predicted GTPase  32.47 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0253092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37500  predicted GTPase  43.69 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.287948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3172  protein of unknown function ATP binding protein  35.48 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216462  normal  0.253397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3225  protein of unknown function ATP binding  41.75 
 
 		 201 aa  88.2  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3977  protein of unknown function ATP binding  37.85 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2006  protein of unknown function ATP binding  37.79 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.959688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3316  protein of unknown function ATP binding  35.14 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2531  protein of unknown function ATP binding  44.33 
 
 		 213 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01830  predicted GTPase  33.7 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0174  protein of unknown function ATP binding protein  32.07 
 
 		 310 aa  84.3  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0556  Miro domain-containing protein  36.2 
 
 		 187 aa  84.3  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02280  predicted GTPase  44.66 
 
 		 197 aa  84.3  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.650431  normal  0.614387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0492  protein of unknown function ATP binding protein  48.24 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4813  protein of unknown function ATP binding  34.2 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33540  predicted GTPase  42.31 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168507  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0313  protein of unknown function ATP binding  35.33 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0533217  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4502  small GTP-binding protein  44.66 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.475752  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0275  protein of unknown function ATP binding  32.79 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.550996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1806  protein of unknown function ATP binding protein  43.48 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110416  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2804  putative ATP/GTP-binding protein  46.53 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1292  protein of unknown function ATP binding  44.55 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980215  hitchhiker  0.00348486 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0253  protein of unknown function, ATP binding  38.64 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1141  protein of unknown function ATP binding protein  38.32 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4183  protein of unknown function ATP binding  34.22 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.578204  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  31.71 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>