114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2447 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2447  putative ATP/GTP-binding protein  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204882  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2047  putative ATP/GTP-binding protein  85.16 
 
 		 197 aa  315  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0275  protein of unknown function ATP binding protein  77.72 
 
 		 193 aa  311  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3051  protein of unknown function ATP binding protein  73.06 
 
 		 198 aa  295  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02280  predicted GTPase  74.61 
 
 		 197 aa  295  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.650431  normal  0.614387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3811  protein of unknown function ATP binding protein  73.66 
 
 		 197 aa  285  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3802  protein of unknown function ATP binding protein  72.73 
 
 		 202 aa  276  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.575457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0153  hypothetical protein  73.45 
 
 		 191 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1292  protein of unknown function ATP binding  69.4 
 
 		 203 aa  272  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980215  hitchhiker  0.00348486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0359  protein of unknown function ATP binding protein  70.56 
 
 		 191 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3252  hypothetical protein  67.86 
 
 		 195 aa  271  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2069  protein of unknown function ATP binding  67.71 
 
 		 197 aa  270  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3196  GTPase-like protein  68.11 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3340  protein of unknown function ATP binding protein  68.82 
 
 		 193 aa  267  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.294578  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37500  predicted GTPase  68.16 
 
 		 190 aa  267  7e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.287948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3596  protein of unknown function, ATP binding  66.12 
 
 		 199 aa  261  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3123  protein of unknown function ATP binding protein  66.84 
 
 		 199 aa  260  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2803  protein of unknown function ATP binding protein  65.76 
 
 		 204 aa  259  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000564845  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1148  hypothetical protein  65.8 
 
 		 199 aa  258  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371751  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3977  protein of unknown function ATP binding  65.57 
 
 		 200 aa  256  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1430  putative ATP/GTP-binding protein  66.48 
 
 		 190 aa  254  6e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3666  protein of unknown function ATP binding protein  66.86 
 
 		 205 aa  249  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132662  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0819  protein of unknown function, ATP binding  59.7 
 
 		 203 aa  247  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34260  predicted GTPase  60.54 
 
 		 195 aa  247  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0763  protein of unknown function ATP binding  63.13 
 
 		 196 aa  245  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0366  protein of unknown function ATP binding  62.63 
 
 		 211 aa  243  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5416  protein of unknown function ATP binding  62.43 
 
 		 195 aa  241  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5993  protein of unknown function ATP binding  56.77 
 
 		 198 aa  241  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222654  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0641  protein of unknown function, ATP binding  56.25 
 
 		 198 aa  241  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.437609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2857  protein of unknown function, ATP binding  63.01 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0461  protein of unknown function ATP binding  58.92 
 
 		 202 aa  240  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2387  protein of unknown function ATP binding  61.27 
 
 		 207 aa  239  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3316  protein of unknown function ATP binding  61.99 
 
 		 195 aa  239  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7865  protein of unknown function ATP binding  59.89 
 
 		 202 aa  235  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.348128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24580  predicted GTPase  62.13 
 
 		 204 aa  234  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0816  protein of unknown function ATP binding protein  59.65 
 
 		 197 aa  231  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0322936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4263  protein of unknown function ATP binding  60.69 
 
 		 205 aa  231  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1811  hypothetical protein  60 
 
 		 179 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5269  hypothetical protein  61.05 
 
 		 197 aa  229  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5185  protein of unknown function ATP binding  62.57 
 
 		 195 aa  229  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.729225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0275  protein of unknown function ATP binding  58.56 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.550996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0977  hypothetical protein  57.87 
 
 		 208 aa  229  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.235397  normal  0.429497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0943  putative ATP/GTP-binding protein  59.65 
 
 		 195 aa  228  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2203  protein of unknown function ATP binding protein  65.09 
 
 		 191 aa  228  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.000213997 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01830  predicted GTPase  59.68 
 
 		 189 aa  228  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1824  hypothetical protein  58.56 
 
 		 197 aa  227  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0973  hypothetical protein  58.14 
 
 		 194 aa  225  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.617604  normal  0.248176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0392  protein of unknown function ATP binding  58.82 
 
 		 197 aa  225  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.494311  normal  0.506956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1791  hypothetical protein  60.23 
 
 		 195 aa  225  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2006  protein of unknown function ATP binding  59.66 
 
 		 186 aa  225  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.959688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3172  protein of unknown function ATP binding protein  60.11 
 
 		 203 aa  224  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216462  normal  0.253397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3872  protein of unknown function, ATP binding  58.96 
 
 		 205 aa  224  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.21835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0174  protein of unknown function ATP binding protein  58.96 
 
 		 310 aa  221  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3607  protein of unknown function ATP binding protein  60 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1192  protein of unknown function, ATP binding protein  56.45 
 
 		 193 aa  218  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1209  protein of unknown function, ATP binding  56.45 
 
 		 193 aa  218  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.762798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1219  protein of unknown function, ATP binding  56.45 
 
 		 193 aa  218  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2752  protein of unknown function ATP binding protein  59.44 
 
 		 218 aa  217  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1806  protein of unknown function ATP binding protein  60.76 
 
 		 192 aa  216  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110416  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0760  putative ATP/GTP-binding protein  58.38 
 
 		 196 aa  216  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4886  protein of unknown function, ATP binding  55.96 
 
 		 192 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5992  normal  0.0181219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0313  protein of unknown function ATP binding  57.3 
 
 		 207 aa  214  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0533217  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5489  protein of unknown function ATP binding  60.47 
 
 		 206 aa  214  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448291  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1539  protein of unknown function, ATP binding  56.11 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3225  protein of unknown function ATP binding  57.07 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4813  protein of unknown function ATP binding  62.43 
 
 		 202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4183  protein of unknown function ATP binding  58.01 
 
 		 197 aa  211  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.578204  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13398  ATP/GTP-binding protein  56.98 
 
 		 193 aa  208  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00758  normal  0.0959612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2448  protein of unknown function ATP binding  53.93 
 
 		 194 aa  208  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5473  protein of unknown function ATP binding  58.29 
 
 		 204 aa  208  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  0.984202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06970  predicted GTPase  56.9 
 
 		 191 aa  207  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0253092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33540  predicted GTPase  56.98 
 
 		 199 aa  205  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168507  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2804  putative ATP/GTP-binding protein  57.3 
 
 		 188 aa  201  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197811  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0492  protein of unknown function ATP binding protein  54.5 
 
 		 201 aa  201  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1063  protein of unknown function ATP binding  60.23 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4333  protein of unknown function, ATP binding  57.46 
 
 		 214 aa  197  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3845  protein of unknown function ATP binding  55 
 
 		 203 aa  192  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1141  protein of unknown function ATP binding protein  56.41 
 
 		 236 aa  191  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2531  protein of unknown function ATP binding  52.15 
 
 		 213 aa  187  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1434  protein of unknown function ATP binding protein  51.01 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473916  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1323  small GTP-binding protein  48.86 
 
 		 193 aa  145  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.415004  normal  0.083818 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  46.37 
 
 		 176 aa  141  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  46.37 
 
 		 176 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  46.37 
 
 		 176 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3230  small GTP-binding protein  47.73 
 
 		 177 aa  134  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.137976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0846  small GTP-binding protein  44.13 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3915  protein of unknown function, ATP binding  43.48 
 
 		 177 aa  128  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0080  small GTP-binding protein  41.24 
 
 		 177 aa  125  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0120715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0379  small GTP-binding protein  39.66 
 
 		 191 aa  104  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2401  protein of unknown function ATP binding  37.36 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.37736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0776  protein of unknown function ATP binding  48.51 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  33.15 
 
 		 187 aa  94.7  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0656  small GTP-binding protein  34.68 
 
 		 178 aa  94  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4502  small GTP-binding protein  32.74 
 
 		 172 aa  89.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.475752  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5250  protein of unknown function ATP binding  33.15 
 
 		 180 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3682  protein of unknown function ATP binding  36.22 
 
 		 182 aa  87  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2206  small GTP-binding protein  29.83 
 
 		 188 aa  85.1  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  normal  0.0744426 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2576  small GTP-binding protein  29.83 
 
 		 188 aa  85.1  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01160  small GTP-binding protein domain protein  34.52 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0133  ATP binding protein  30.16 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>