121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3230 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3230  small GTP-binding protein  100 
 
 		 177 aa  362  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.137976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3915  protein of unknown function, ATP binding  87.01 
 
 		 177 aa  318  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0379  small GTP-binding protein  64.67 
 
 		 191 aa  218  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  57.06 
 
 		 176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  55.93 
 
 		 176 aa  191  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0846  small GTP-binding protein  54.8 
 
 		 176 aa  191  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  55.37 
 
 		 176 aa  189  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0080  small GTP-binding protein  52.91 
 
 		 177 aa  175  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0120715  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1323  small GTP-binding protein  52.84 
 
 		 193 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.415004  normal  0.083818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0275  protein of unknown function ATP binding protein  45.25 
 
 		 193 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2447  putative ATP/GTP-binding protein  47.73 
 
 		 195 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4502  small GTP-binding protein  39.29 
 
 		 172 aa  134  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.475752  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1430  putative ATP/GTP-binding protein  44.77 
 
 		 190 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3225  protein of unknown function ATP binding  42.39 
 
 		 201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2069  protein of unknown function ATP binding  44.38 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5269  hypothetical protein  40.56 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3607  protein of unknown function ATP binding protein  41.01 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2803  protein of unknown function ATP binding protein  42.13 
 
 		 204 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000564845  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3340  protein of unknown function ATP binding protein  42.7 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.294578  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34260  predicted GTPase  41.08 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0819  protein of unknown function, ATP binding  43.43 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02280  predicted GTPase  43.35 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.650431  normal  0.614387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0763  protein of unknown function ATP binding  43.43 
 
 		 196 aa  124  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2857  protein of unknown function, ATP binding  41.62 
 
 		 206 aa  124  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3172  protein of unknown function ATP binding protein  42.54 
 
 		 203 aa  124  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216462  normal  0.253397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3196  GTPase-like protein  41.01 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0313  protein of unknown function ATP binding  41.49 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0533217  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3123  protein of unknown function ATP binding protein  42.39 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2531  protein of unknown function ATP binding  43.71 
 
 		 213 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0174  protein of unknown function ATP binding protein  40.86 
 
 		 310 aa  123  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3051  protein of unknown function ATP binding protein  41.99 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0973  hypothetical protein  40.88 
 
 		 194 aa  121  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.617604  normal  0.248176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0760  putative ATP/GTP-binding protein  39.66 
 
 		 196 aa  120  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0253  protein of unknown function, ATP binding  39.88 
 
 		 182 aa  120  9e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0153  hypothetical protein  43.09 
 
 		 191 aa  120  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3596  protein of unknown function, ATP binding  39.89 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1292  protein of unknown function ATP binding  39.01 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980215  hitchhiker  0.00348486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2006  protein of unknown function ATP binding  41.86 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.959688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7865  protein of unknown function ATP binding  41.01 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.348128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37500  predicted GTPase  40.45 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.287948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0275  protein of unknown function ATP binding  41.67 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.550996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5185  protein of unknown function ATP binding  41.9 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.729225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01830  predicted GTPase  40.32 
 
 		 189 aa  118  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1192  protein of unknown function, ATP binding protein  42.11 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1209  protein of unknown function, ATP binding  42.11 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.762798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1219  protein of unknown function, ATP binding  42.11 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2401  protein of unknown function ATP binding  40.35 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.37736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5416  protein of unknown function ATP binding  40.34 
 
 		 195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3811  protein of unknown function ATP binding protein  39.89 
 
 		 197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2047  putative ATP/GTP-binding protein  42.7 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13398  ATP/GTP-binding protein  40.57 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00758  normal  0.0959612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0977  hypothetical protein  39.77 
 
 		 208 aa  117  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.235397  normal  0.429497 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0656  small GTP-binding protein  40.36 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24580  predicted GTPase  39.55 
 
 		 204 aa  117  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2387  protein of unknown function ATP binding  38.15 
 
 		 207 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3977  protein of unknown function ATP binding  39.77 
 
 		 200 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06970  predicted GTPase  40.8 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0253092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0359  protein of unknown function ATP binding protein  41.01 
 
 		 191 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1148  hypothetical protein  40.66 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371751  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0943  putative ATP/GTP-binding protein  39.25 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3845  protein of unknown function ATP binding  41.71 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  37.28 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2203  protein of unknown function ATP binding protein  43.03 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.000213997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4813  protein of unknown function ATP binding  42.7 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4886  protein of unknown function, ATP binding  41.76 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5992  normal  0.0181219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4263  protein of unknown function ATP binding  38.76 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0816  protein of unknown function ATP binding protein  38.46 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0322936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3252  hypothetical protein  40.46 
 
 		 195 aa  114  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2752  protein of unknown function ATP binding protein  40.66 
 
 		 218 aa  114  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3802  protein of unknown function ATP binding protein  40.46 
 
 		 202 aa  114  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.575457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1811  hypothetical protein  38.25 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3316  protein of unknown function ATP binding  39.66 
 
 		 195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5250  protein of unknown function ATP binding  39.87 
 
 		 180 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0366  protein of unknown function ATP binding  41.48 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3666  protein of unknown function ATP binding protein  39.66 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5473  protein of unknown function ATP binding  38.6 
 
 		 204 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  0.984202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5489  protein of unknown function ATP binding  41.48 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448291  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2448  protein of unknown function ATP binding  37.78 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0641  protein of unknown function, ATP binding  38.73 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.437609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1791  hypothetical protein  40.35 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33540  predicted GTPase  38.07 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168507  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1539  protein of unknown function, ATP binding  40.35 
 
 		 188 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0392  protein of unknown function ATP binding  36.31 
 
 		 197 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.494311  normal  0.506956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0461  protein of unknown function ATP binding  38.07 
 
 		 202 aa  110  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2206  small GTP-binding protein  33.88 
 
 		 188 aa  110  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  normal  0.0744426 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2576  small GTP-binding protein  33.88 
 
 		 188 aa  110  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2804  putative ATP/GTP-binding protein  39.78 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197811  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4333  protein of unknown function, ATP binding  40.91 
 
 		 214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1824  hypothetical protein  39.77 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1063  protein of unknown function ATP binding  44.51 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3872  protein of unknown function, ATP binding  37.08 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.21835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5993  protein of unknown function ATP binding  37.57 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222654  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4183  protein of unknown function ATP binding  37.85 
 
 		 197 aa  107  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.578204  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1141  protein of unknown function ATP binding protein  40.56 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0492  protein of unknown function ATP binding protein  41.81 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1434  protein of unknown function ATP binding protein  39.47 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473916  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1806  protein of unknown function ATP binding protein  37.97 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0776  protein of unknown function ATP binding  50 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0133  ATP binding protein  32.93 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3042  small GTP-binding protein  38.71 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110468  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>