114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5269 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5269  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  403  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0763  protein of unknown function ATP binding  79.59 
 
 
196 aa  315  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0819  protein of unknown function, ATP binding  77.55 
 
 
203 aa  309  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24580  predicted GTPase  71.43 
 
 
204 aa  265  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0461  protein of unknown function ATP binding  68.75 
 
 
202 aa  265  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7865  protein of unknown function ATP binding  68.13 
 
 
202 aa  264  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0641  protein of unknown function, ATP binding  69.71 
 
 
198 aa  262  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.437609  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5416  protein of unknown function ATP binding  71.26 
 
 
195 aa  261  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34260  predicted GTPase  65.96 
 
 
195 aa  261  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63353  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5993  protein of unknown function ATP binding  67.96 
 
 
198 aa  260  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222654  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0977  hypothetical protein  66.48 
 
 
208 aa  257  8e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.235397  normal  0.429497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1824  hypothetical protein  67.22 
 
 
197 aa  254  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4263  protein of unknown function ATP binding  65.91 
 
 
205 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0816  protein of unknown function ATP binding protein  64.89 
 
 
197 aa  252  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0322936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0973  hypothetical protein  65.61 
 
 
194 aa  252  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.617604  normal  0.248176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1791  hypothetical protein  66.85 
 
 
195 aa  252  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0943  putative ATP/GTP-binding protein  66.67 
 
 
195 aa  250  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1811  hypothetical protein  66.67 
 
 
179 aa  249  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3872  protein of unknown function, ATP binding  64.2 
 
 
205 aa  245  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.21835  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3316  protein of unknown function ATP binding  61.38 
 
 
195 aa  245  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4886  protein of unknown function, ATP binding  65.56 
 
 
192 aa  244  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5992  normal  0.0181219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2006  protein of unknown function ATP binding  64.97 
 
 
186 aa  243  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.959688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2857  protein of unknown function, ATP binding  67.63 
 
 
206 aa  242  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1539  protein of unknown function, ATP binding  65.52 
 
 
188 aa  241  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37500  predicted GTPase  65.14 
 
 
190 aa  241  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.287948  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5185  protein of unknown function ATP binding  63.69 
 
 
195 aa  240  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.729225  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2387  protein of unknown function ATP binding  67.63 
 
 
207 aa  239  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1806  protein of unknown function ATP binding protein  64.89 
 
 
192 aa  238  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0392  protein of unknown function ATP binding  62.78 
 
 
197 aa  238  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.494311  normal  0.506956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1192  protein of unknown function, ATP binding protein  62.15 
 
 
193 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1209  protein of unknown function, ATP binding  62.15 
 
 
193 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.762798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1219  protein of unknown function, ATP binding  62.15 
 
 
193 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5473  protein of unknown function ATP binding  63.64 
 
 
204 aa  236  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  0.984202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3340  protein of unknown function ATP binding protein  61.8 
 
 
193 aa  235  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.294578  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02280  predicted GTPase  60.96 
 
 
197 aa  234  8e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.650431  normal  0.614387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3051  protein of unknown function ATP binding protein  60.22 
 
 
198 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2447  putative ATP/GTP-binding protein  61.05 
 
 
195 aa  229  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3666  protein of unknown function ATP binding protein  60.33 
 
 
205 aa  229  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132662  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13398  ATP/GTP-binding protein  63.22 
 
 
193 aa  228  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00758  normal  0.0959612 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1292  protein of unknown function ATP binding  57.75 
 
 
203 aa  228  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980215  hitchhiker  0.00348486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3811  protein of unknown function ATP binding protein  60.11 
 
 
197 aa  227  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0275  protein of unknown function ATP binding protein  61.18 
 
 
193 aa  225  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0153  hypothetical protein  60.75 
 
 
191 aa  224  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3802  protein of unknown function ATP binding protein  57.73 
 
 
202 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.575457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3196  GTPase-like protein  59.78 
 
 
207 aa  224  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2069  protein of unknown function ATP binding  61.49 
 
 
197 aa  222  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2803  protein of unknown function ATP binding protein  61.99 
 
 
204 aa  222  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000564845  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3607  protein of unknown function ATP binding protein  57.95 
 
 
204 aa  221  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3252  hypothetical protein  56.02 
 
 
195 aa  221  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129642  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0492  protein of unknown function ATP binding protein  60.85 
 
 
201 aa  221  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5489  protein of unknown function ATP binding  58.96 
 
 
206 aa  220  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448291  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3123  protein of unknown function ATP binding protein  59.12 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0760  putative ATP/GTP-binding protein  55.98 
 
 
196 aa  218  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3225  protein of unknown function ATP binding  58.56 
 
 
201 aa  217  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0359  protein of unknown function ATP binding protein  59.54 
 
 
191 aa  216  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635716  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3596  protein of unknown function, ATP binding  59.2 
 
 
199 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1148  hypothetical protein  58.19 
 
 
199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371751  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0366  protein of unknown function ATP binding  56.76 
 
 
211 aa  214  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3977  protein of unknown function ATP binding  58.52 
 
 
200 aa  212  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1430  putative ATP/GTP-binding protein  57.06 
 
 
190 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2047  putative ATP/GTP-binding protein  56.25 
 
 
197 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0174  protein of unknown function ATP binding protein  57.78 
 
 
310 aa  210  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3172  protein of unknown function ATP binding protein  58.56 
 
 
203 aa  209  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216462  normal  0.253397 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0275  protein of unknown function ATP binding  59.02 
 
 
205 aa  209  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.550996 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33540  predicted GTPase  56.98 
 
 
199 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168507  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0313  protein of unknown function ATP binding  59.09 
 
 
207 aa  205  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0533217  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01830  predicted GTPase  56.83 
 
 
189 aa  205  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06970  predicted GTPase  55.37 
 
 
191 aa  204  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0253092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2203  protein of unknown function ATP binding protein  61.25 
 
 
191 aa  201  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.000213997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2448  protein of unknown function ATP binding  56 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4813  protein of unknown function ATP binding  56.99 
 
 
202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2752  protein of unknown function ATP binding protein  57.23 
 
 
218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1063  protein of unknown function ATP binding  53.37 
 
 
186 aa  191  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4183  protein of unknown function ATP binding  56.98 
 
 
197 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.578204  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3845  protein of unknown function ATP binding  55.68 
 
 
203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2531  protein of unknown function ATP binding  49.71 
 
 
213 aa  179  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1141  protein of unknown function ATP binding protein  54.09 
 
 
236 aa  178  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289074  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4333  protein of unknown function, ATP binding  57.23 
 
 
214 aa  177  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1434  protein of unknown function ATP binding protein  53.85 
 
 
213 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473916  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2804  putative ATP/GTP-binding protein  52.17 
 
 
188 aa  175  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197811  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1323  small GTP-binding protein  44.75 
 
 
193 aa  142  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.415004  normal  0.083818 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  43.82 
 
 
176 aa  135  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  42.31 
 
 
176 aa  134  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0846  small GTP-binding protein  44.51 
 
 
176 aa  134  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0080  small GTP-binding protein  43.68 
 
 
177 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0120715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  42.31 
 
 
176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3230  small GTP-binding protein  40.56 
 
 
177 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.137976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3915  protein of unknown function, ATP binding  39.66 
 
 
177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  35.91 
 
 
187 aa  101  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0776  protein of unknown function ATP binding  37.87 
 
 
182 aa  100  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4502  small GTP-binding protein  38.92 
 
 
172 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.475752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0379  small GTP-binding protein  36.21 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0253  protein of unknown function, ATP binding  35.36 
 
 
182 aa  92.8  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2401  protein of unknown function ATP binding  37.08 
 
 
185 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.37736  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0656  small GTP-binding protein  34.08 
 
 
178 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2206  small GTP-binding protein  32.04 
 
 
188 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  normal  0.0744426 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2576  small GTP-binding protein  32.04 
 
 
188 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3682  protein of unknown function ATP binding  34.94 
 
 
182 aa  84.7  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.109872  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0133  ATP binding protein  32.42 
 
 
181 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5250  protein of unknown function ATP binding  32.22 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>