119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3915 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3915  protein of unknown function, ATP binding  100 
 
 		 177 aa  363  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3230  small GTP-binding protein  87.01 
 
 		 177 aa  318  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.137976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0379  small GTP-binding protein  63.58 
 
 		 191 aa  223  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  57.63 
 
 		 176 aa  200  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  56.5 
 
 		 176 aa  197  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  55.93 
 
 		 176 aa  195  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0846  small GTP-binding protein  55.37 
 
 		 176 aa  194  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1323  small GTP-binding protein  53.98 
 
 		 193 aa  175  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.415004  normal  0.083818 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0080  small GTP-binding protein  51.16 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0120715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0275  protein of unknown function ATP binding protein  44.32 
 
 		 193 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3225  protein of unknown function ATP binding  43.89 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4502  small GTP-binding protein  39.29 
 
 		 172 aa  135  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.475752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3607  protein of unknown function ATP binding protein  43.86 
 
 		 204 aa  131  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1430  putative ATP/GTP-binding protein  42.31 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3172  protein of unknown function ATP binding protein  43.32 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216462  normal  0.253397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0819  protein of unknown function, ATP binding  42.46 
 
 		 203 aa  128  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3596  protein of unknown function, ATP binding  41.53 
 
 		 199 aa  128  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0313  protein of unknown function ATP binding  42.78 
 
 		 207 aa  128  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0533217  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2531  protein of unknown function ATP binding  43.82 
 
 		 213 aa  128  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2447  putative ATP/GTP-binding protein  43.48 
 
 		 195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0763  protein of unknown function ATP binding  42.46 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0943  putative ATP/GTP-binding protein  40.54 
 
 		 195 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5269  hypothetical protein  39.66 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2069  protein of unknown function ATP binding  42.7 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2047  putative ATP/GTP-binding protein  43.48 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0153  hypothetical protein  44.38 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3977  protein of unknown function ATP binding  41.44 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0275  protein of unknown function ATP binding  43.32 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.550996 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37500  predicted GTPase  40.32 
 
 		 190 aa  124  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.287948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0174  protein of unknown function ATP binding protein  42.62 
 
 		 310 aa  124  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5416  protein of unknown function ATP binding  42.13 
 
 		 195 aa  124  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34260  predicted GTPase  40 
 
 		 195 aa  124  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7865  protein of unknown function ATP binding  39.89 
 
 		 202 aa  124  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.348128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3051  protein of unknown function ATP binding protein  41.71 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2006  protein of unknown function ATP binding  41.01 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.959688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3196  GTPase-like protein  39.89 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02280  predicted GTPase  41.57 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.650431  normal  0.614387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24580  predicted GTPase  38.12 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3811  protein of unknown function ATP binding protein  40.54 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06970  predicted GTPase  42.53 
 
 		 191 aa  122  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0253092 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0760  putative ATP/GTP-binding protein  40.56 
 
 		 196 aa  121  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13398  ATP/GTP-binding protein  40.57 
 
 		 193 aa  121  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00758  normal  0.0959612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0973  hypothetical protein  40.56 
 
 		 194 aa  121  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.617604  normal  0.248176 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01830  predicted GTPase  40.64 
 
 		 189 aa  121  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0359  protein of unknown function ATP binding protein  42.13 
 
 		 191 aa  121  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2857  protein of unknown function, ATP binding  40.45 
 
 		 206 aa  120  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5185  protein of unknown function ATP binding  41.85 
 
 		 195 aa  121  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.729225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2803  protein of unknown function ATP binding protein  41.01 
 
 		 204 aa  121  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000564845  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3666  protein of unknown function ATP binding protein  41.01 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3123  protein of unknown function ATP binding protein  42.93 
 
 		 199 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3802  protein of unknown function ATP binding protein  40.88 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.575457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2203  protein of unknown function ATP binding protein  42.94 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.000213997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0461  protein of unknown function ATP binding  39.89 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3316  protein of unknown function ATP binding  41.48 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4886  protein of unknown function, ATP binding  38.8 
 
 		 192 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5992  normal  0.0181219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3845  protein of unknown function ATP binding  41.11 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5489  protein of unknown function ATP binding  42.46 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448291  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1292  protein of unknown function ATP binding  38.38 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980215  hitchhiker  0.00348486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3340  protein of unknown function ATP binding protein  41.01 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.294578  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4263  protein of unknown function ATP binding  38.59 
 
 		 205 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1192  protein of unknown function, ATP binding protein  38.86 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1209  protein of unknown function, ATP binding  38.86 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.762798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1219  protein of unknown function, ATP binding  38.86 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3252  hypothetical protein  39.78 
 
 		 195 aa  117  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0641  protein of unknown function, ATP binding  39.13 
 
 		 198 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.437609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5473  protein of unknown function ATP binding  38.6 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  0.984202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5993  protein of unknown function ATP binding  38.59 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222654  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1539  protein of unknown function, ATP binding  37.7 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3872  protein of unknown function, ATP binding  38.04 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.21835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2387  protein of unknown function ATP binding  38.2 
 
 		 207 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2401  protein of unknown function ATP binding  39.18 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.37736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0977  hypothetical protein  36.76 
 
 		 208 aa  115  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.235397  normal  0.429497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1791  hypothetical protein  39.55 
 
 		 195 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0816  protein of unknown function ATP binding protein  37.02 
 
 		 197 aa  114  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0322936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1148  hypothetical protein  38.67 
 
 		 199 aa  114  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371751  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0253  protein of unknown function, ATP binding  36.78 
 
 		 182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0366  protein of unknown function ATP binding  39.23 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1811  hypothetical protein  38.62 
 
 		 179 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4333  protein of unknown function, ATP binding  43.18 
 
 		 214 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33540  predicted GTPase  38.07 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168507  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0392  protein of unknown function ATP binding  37.64 
 
 		 197 aa  111  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.494311  normal  0.506956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1063  protein of unknown function ATP binding  43.78 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1824  hypothetical protein  37.84 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0656  small GTP-binding protein  37.95 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2752  protein of unknown function ATP binding protein  39.89 
 
 		 218 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2448  protein of unknown function ATP binding  37.78 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2206  small GTP-binding protein  36.07 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  normal  0.0744426 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2576  small GTP-binding protein  36.07 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5250  protein of unknown function ATP binding  40.56 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  35.5 
 
 		 187 aa  106  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0492  protein of unknown function ATP binding protein  40.22 
 
 		 201 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4813  protein of unknown function ATP binding  43.82 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4183  protein of unknown function ATP binding  35.91 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.578204  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1434  protein of unknown function ATP binding protein  35.26 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0776  protein of unknown function ATP binding  41.41 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1806  protein of unknown function ATP binding protein  38.46 
 
 		 192 aa  99  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110416  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2804  putative ATP/GTP-binding protein  40.12 
 
 		 188 aa  98.6  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197811  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1141  protein of unknown function ATP binding protein  37.7 
 
 		 236 aa  94.7  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0133  ATP binding protein  32.93 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01160  small GTP-binding protein domain protein  35.87 
 
 		 191 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>