More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0563 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1318  translation initiation factor IF-2  44.83 
 
 		 774 aa  649    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0467  translation initiation factor IF-2  83.49 
 
 		 848 aa  1368    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.323718  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0563  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 830 aa  1669    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.114537  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  49.49 
 
 		 856 aa  571  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  47.75 
 
 		 990 aa  566  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  47.75 
 
 		 959 aa  567  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  47.63 
 
 		 964 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  49.4 
 
 		 887 aa  564  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  45.35 
 
 		 1083 aa  555  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  48.3 
 
 		 848 aa  552  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  47.44 
 
 		 917 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  48.08 
 
 		 926 aa  549  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  47.49 
 
 		 886 aa  549  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  47.62 
 
 		 917 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  49 
 
 		 921 aa  548  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  47.01 
 
 		 971 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  48.7 
 
 		 885 aa  547  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  47.84 
 
 		 873 aa  547  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  48.44 
 
 		 880 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  49.08 
 
 		 832 aa  545  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  46.14 
 
 		 922 aa  541  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  45.48 
 
 		 981 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  45.65 
 
 		 975 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  43.72 
 
 		 861 aa  540  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  47 
 
 		 887 aa  536  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  48.49 
 
 		 883 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  48.1 
 
 		 868 aa  534  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2070  translation initiation factor IF-2  48.29 
 
 		 907 aa  532  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1047  translation initiation factor IF-2  46.83 
 
 		 1053 aa  533  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  46.3 
 
 		 990 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  46.79 
 
 		 882 aa  529  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  48.29 
 
 		 836 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  45.79 
 
 		 989 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  46.83 
 
 		 886 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  45.77 
 
 		 835 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  48.29 
 
 		 836 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  45.79 
 
 		 989 aa  525  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  48.46 
 
 		 838 aa  525  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  47.21 
 
 		 871 aa  523  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  44.7 
 
 		 824 aa  522  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  46.36 
 
 		 907 aa  525  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  46.42 
 
 		 883 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  44.82 
 
 		 968 aa  524  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  45.18 
 
 		 1045 aa  521  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  45.2 
 
 		 885 aa  519  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  45.37 
 
 		 880 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  46.9 
 
 		 894 aa  522  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  45.37 
 
 		 885 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  45.37 
 
 		 885 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  45.9 
 
 		 949 aa  519  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  45.37 
 
 		 889 aa  522  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  47.3 
 
 		 885 aa  522  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  45.04 
 
 		 880 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  45.9 
 
 		 984 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  45.04 
 
 		 880 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  45.04 
 
 		 880 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  45.04 
 
 		 880 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  47.24 
 
 		 902 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  44.95 
 
 		 881 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  46.09 
 
 		 896 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  42.4 
 
 		 856 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  46.18 
 
 		 1161 aa  514  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  44.31 
 
 		 971 aa  515  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  48.51 
 
 		 986 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  44.86 
 
 		 896 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  46.22 
 
 		 860 aa  513  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  46.1 
 
 		 868 aa  512  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  48.51 
 
 		 980 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  47.28 
 
 		 884 aa  514  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  43.39 
 
 		 979 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  45.9 
 
 		 943 aa  514  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  45.9 
 
 		 943 aa  514  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  46.98 
 
 		 898 aa  515  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  48.21 
 
 		 848 aa  512  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  44.3 
 
 		 975 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  44.3 
 
 		 975 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  45.03 
 
 		 889 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  44.3 
 
 		 975 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  44.3 
 
 		 975 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  44.3 
 
 		 975 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  45.01 
 
 		 894 aa  512  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  45.7 
 
 		 972 aa  512  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  46.61 
 
 		 895 aa  512  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  45.56 
 
 		 943 aa  511  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  44.37 
 
 		 884 aa  511  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  44.3 
 
 		 975 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  40.66 
 
 		 880 aa  509  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  46.17 
 
 		 891 aa  509  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  44.3 
 
 		 975 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  42.31 
 
 		 897 aa  509  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  44.17 
 
 		 972 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  44 
 
 		 903 aa  508  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  43.96 
 
 		 976 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2490  translation initiation factor IF-2  46.17 
 
 		 875 aa  508  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  44.92 
 
 		 969 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  45.36 
 
 		 971 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  45.84 
 
 		 920 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  44.17 
 
 		 971 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  45.83 
 
 		 992 aa  508  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  45.36 
 
 		 971 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>