More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0038 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  52.61 
 
 		 883 aa  641    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  47.81 
 
 		 896 aa  635    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  57.18 
 
 		 926 aa  804    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  58.27 
 
 		 921 aa  745    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  58.92 
 
 		 887 aa  735    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  80.21 
 
 		 836 aa  1030    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  56.65 
 
 		 959 aa  826    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  50.07 
 
 		 885 aa  649    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  51.96 
 
 		 897 aa  648    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  61.44 
 
 		 971 aa  761    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 880 aa  640    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  60.66 
 
 		 989 aa  750    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  53.39 
 
 		 882 aa  658    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2070  translation initiation factor IF-2  56.34 
 
 		 907 aa  694    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  55.98 
 
 		 1083 aa  765    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  60.28 
 
 		 871 aa  730    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 880 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  50.41 
 
 		 912 aa  667    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  80.06 
 
 		 836 aa  1030    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  60.66 
 
 		 989 aa  749    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  49.61 
 
 		 883 aa  740    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  81.53 
 
 		 838 aa  1027    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 880 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  56.59 
 
 		 964 aa  824    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1047  translation initiation factor IF-2  57.34 
 
 		 1053 aa  748    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  52.57 
 
 		 848 aa  818    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  53.22 
 
 		 875 aa  635    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  60.32 
 
 		 873 aa  744    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  60.94 
 
 		 981 aa  747    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 		 880 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  59.97 
 
 		 886 aa  731    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 824 aa  1634    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  54.37 
 
 		 1045 aa  723    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  49.32 
 
 		 880 aa  739    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  48.95 
 
 		 907 aa  655    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01303  translation initiation factor IF-2  46.69 
 
 		 904 aa  653    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273892  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  50.7 
 
 		 884 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  50.68 
 
 		 883 aa  741    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  50.79 
 
 		 886 aa  760    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  60.22 
 
 		 868 aa  730    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  57.18 
 
 		 990 aa  745    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  77.39 
 
 		 835 aa  1167    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  57.25 
 
 		 845 aa  717    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  45.34 
 
 		 894 aa  638    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  55.83 
 
 		 856 aa  796    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  53.22 
 
 		 875 aa  635    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  76.65 
 
 		 832 aa  1148    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2815  translation initiation factor IF-2  55.03 
 
 		 883 aa  638    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  49.93 
 
 		 885 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  49.93 
 
 		 885 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  53.1 
 
 		 883 aa  641    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  48.25 
 
 		 881 aa  653    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 880 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  56.67 
 
 		 861 aa  773    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  55.78 
 
 		 853 aa  651    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  56.43 
 
 		 990 aa  822    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 885 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  55.6 
 
 		 856 aa  732    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  53.73 
 
 		 949 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  52.6 
 
 		 889 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  60.47 
 
 		 975 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  75.3 
 
 		 848 aa  1135    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0179  translation initiation factor IF-2  45.69 
 
 		 892 aa  633  1e-180  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.61877  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  53.22 
 
 		 868 aa  633  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  53.39 
 
 		 868 aa  634  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  54.41 
 
 		 922 aa  635  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  44.98 
 
 		 880 aa  634  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  54.33 
 
 		 848 aa  634  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  56.73 
 
 		 890 aa  634  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  45.41 
 
 		 901 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  52.89 
 
 		 889 aa  631  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 		 894 aa  631  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0203  translation initiation factor IF-2  51.08 
 
 		 892 aa  631  1e-179  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.665385  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  47.12 
 
 		 884 aa  630  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  49.78 
 
 		 968 aa  631  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  51 
 
 		 895 aa  630  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  50.47 
 
 		 979 aa  631  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  45.39 
 
 		 890 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  45.39 
 
 		 890 aa  627  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  45.39 
 
 		 890 aa  627  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 992 aa  625  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  53.08 
 
 		 884 aa  628  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4489  translation initiation factor IF-2  45.39 
 
 		 890 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02986  hypothetical protein  45.39 
 
 		 890 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.201323  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  45.39 
 
 		 890 aa  626  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  45.39 
 
 		 890 aa  627  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  45.39 
 
 		 890 aa  627  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  53.17 
 
 		 896 aa  626  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  45.39 
 
 		 890 aa  627  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  50.39 
 
 		 965 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  51.08 
 
 		 975 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  46.6 
 
 		 892 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  51.08 
 
 		 975 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  46.6 
 
 		 892 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  52.74 
 
 		 882 aa  624  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  51.08 
 
 		 975 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 		 971 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  55.12 
 
 		 984 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 		 971 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  51.08 
 
 		 975 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>