More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4618 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  54.19 
 
 		 883 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  80.72 
 
 		 989 aa  1148    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  60.03 
 
 		 838 aa  766    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  60.85 
 
 		 1045 aa  770    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  95.43 
 
 		 981 aa  1302    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  80.03 
 
 		 990 aa  1153    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  56.25 
 
 		 959 aa  931    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  62.13 
 
 		 832 aa  773    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  57.44 
 
 		 964 aa  936    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2070  translation initiation factor IF-2  55.71 
 
 		 907 aa  733    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  75.28 
 
 		 883 aa  949    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  67.53 
 
 		 917 aa  875    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1047  translation initiation factor IF-2  68.17 
 
 		 1053 aa  989    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  80.27 
 
 		 971 aa  1172    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  61.31 
 
 		 848 aa  869    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  72.4 
 
 		 871 aa  944    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  60.03 
 
 		 836 aa  765    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  55.8 
 
 		 947 aa  644    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  57.28 
 
 		 848 aa  754    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  54.21 
 
 		 884 aa  653    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  68.47 
 
 		 887 aa  872    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  56.99 
 
 		 986 aa  655    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 975 aa  1907    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  56.99 
 
 		 980 aa  654    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  57.82 
 
 		 873 aa  776    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  53.57 
 
 		 885 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  74.33 
 
 		 886 aa  938    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2490  translation initiation factor IF-2  52.75 
 
 		 875 aa  650    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  55.46 
 
 		 926 aa  859    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  59.23 
 
 		 824 aa  753    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  48.77 
 
 		 882 aa  637    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  71.3 
 
 		 880 aa  948    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  51.61 
 
 		 907 aa  654    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  74.33 
 
 		 883 aa  937    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  72.85 
 
 		 868 aa  946    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  74.3 
 
 		 1083 aa  999    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  56.14 
 
 		 990 aa  926    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  62.05 
 
 		 835 aa  781    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  53.86 
 
 		 845 aa  648    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  80.72 
 
 		 989 aa  1149    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  63.16 
 
 		 921 aa  1039    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  68.01 
 
 		 856 aa  858    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  72.66 
 
 		 886 aa  1009    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  58.65 
 
 		 887 aa  754    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  59.15 
 
 		 861 aa  768    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  60.18 
 
 		 836 aa  766    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  67.07 
 
 		 917 aa  868    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  63.46 
 
 		 885 aa  876    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  55.25 
 
 		 949 aa  668    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  54.26 
 
 		 856 aa  701    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  54.15 
 
 		 882 aa  634  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  52.8 
 
 		 985 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  56.05 
 
 		 822 aa  633  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  53.74 
 
 		 881 aa  635  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  47.38 
 
 		 921 aa  634  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  54.42 
 
 		 895 aa  632  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  53.81 
 
 		 880 aa  630  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  45.34 
 
 		 894 aa  629  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  53.73 
 
 		 885 aa  629  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  54.38 
 
 		 922 aa  629  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  54.95 
 
 		 902 aa  632  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  51.9 
 
 		 903 aa  630  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  53.68 
 
 		 896 aa  630  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  55.1 
 
 		 992 aa  629  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  53.73 
 
 		 889 aa  630  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  53.3 
 
 		 880 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  55.35 
 
 		 949 aa  627  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  53.3 
 
 		 880 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  53.33 
 
 		 894 aa  629  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  55.08 
 
 		 989 aa  626  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  52.89 
 
 		 884 aa  626  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  53.3 
 
 		 880 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  52.82 
 
 		 896 aa  627  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  55.21 
 
 		 831 aa  628  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  53.73 
 
 		 885 aa  629  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  53.73 
 
 		 885 aa  629  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  53.3 
 
 		 880 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  55.27 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3581  translation initiation factor IF-2  55.1 
 
 		 892 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  55.44 
 
 		 890 aa  624  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  54.9 
 
 		 975 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  55.27 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3475  translation initiation factor IF-2  55.1 
 
 		 892 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  54.9 
 
 		 975 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  55.08 
 
 		 965 aa  625  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3643  translation initiation factor IF-2  55.1 
 
 		 892 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  52.9 
 
 		 891 aa  622  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  46.98 
 
 		 888 aa  623  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  55.27 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02986  hypothetical protein  55.27 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.201323  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3476  translation initiation factor IF-2  55.1 
 
 		 892 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  53.89 
 
 		 979 aa  624  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  54.83 
 
 		 898 aa  624  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  54.9 
 
 		 975 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  54.22 
 
 		 875 aa  624  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  55.27 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  54.22 
 
 		 875 aa  624  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  55.27 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 920 aa  622  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  54.9 
 
 		 975 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>