More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_3043 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  57.37 
 
 		 989 aa  750    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  61.43 
 
 		 1045 aa  800    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  63.5 
 
 		 887 aa  836    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  56.81 
 
 		 917 aa  817    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  57.05 
 
 		 990 aa  748    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  59.3 
 
 		 887 aa  750    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  60.09 
 
 		 832 aa  784    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  55.86 
 
 		 959 aa  842    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  59.46 
 
 		 886 aa  772    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  58.54 
 
 		 921 aa  764    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  54.78 
 
 		 856 aa  692    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  55.37 
 
 		 990 aa  844    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1047  translation initiation factor IF-2  58.74 
 
 		 1053 aa  751    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  59.57 
 
 		 1083 aa  796    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  58.36 
 
 		 871 aa  744    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  56.48 
 
 		 926 aa  825    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  59.75 
 
 		 836 aa  759    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  59.15 
 
 		 975 aa  757    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  53.08 
 
 		 848 aa  793    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  54.24 
 
 		 968 aa  639    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  54.84 
 
 		 964 aa  837    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  57.37 
 
 		 989 aa  750    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  50.28 
 
 		 848 aa  826    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2070  translation initiation factor IF-2  57.25 
 
 		 907 aa  743    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  58.87 
 
 		 873 aa  766    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  58.45 
 
 		 886 aa  743    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2490  translation initiation factor IF-2  55.56 
 
 		 875 aa  687    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  59.37 
 
 		 824 aa  760    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  59.03 
 
 		 880 aa  767    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  49.5 
 
 		 883 aa  753    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  58.95 
 
 		 868 aa  746    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  58.15 
 
 		 971 aa  745    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  59.75 
 
 		 835 aa  776    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  55.28 
 
 		 845 aa  679    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  59.39 
 
 		 856 aa  813    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  63.16 
 
 		 917 aa  824    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 861 aa  1712    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  59.43 
 
 		 883 aa  748    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  59.75 
 
 		 836 aa  759    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  59.15 
 
 		 981 aa  755    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  59.91 
 
 		 838 aa  758    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  50.92 
 
 		 922 aa  634  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  53.92 
 
 		 894 aa  633  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  52.69 
 
 		 907 aa  635  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  53.51 
 
 		 979 aa  633  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 896 aa  632  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  45.57 
 
 		 854 aa  634  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  54.93 
 
 		 965 aa  635  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 885 aa  634  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  53.8 
 
 		 969 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  53.66 
 
 		 896 aa  631  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 975 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 975 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  53.65 
 
 		 972 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  44.86 
 
 		 884 aa  628  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 975 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  54.76 
 
 		 882 aa  628  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  54.84 
 
 		 975 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  53.74 
 
 		 971 aa  628  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  54.84 
 
 		 976 aa  628  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  53.74 
 
 		 971 aa  628  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 975 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  53.65 
 
 		 971 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  54.84 
 
 		 975 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  53.74 
 
 		 971 aa  628  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  53.02 
 
 		 949 aa  628  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  54.84 
 
 		 975 aa  629  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  47.35 
 
 		 892 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  47.35 
 
 		 892 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  53.41 
 
 		 895 aa  622  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  46.02 
 
 		 831 aa  625  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  53.75 
 
 		 912 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  53.23 
 
 		 880 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  54.86 
 
 		 901 aa  622  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  53.41 
 
 		 972 aa  622  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  53.21 
 
 		 920 aa  619  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  53.23 
 
 		 880 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  53.23 
 
 		 880 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  52.2 
 
 		 884 aa  620  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  52.55 
 
 		 843 aa  619  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  53.23 
 
 		 880 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  53.57 
 
 		 880 aa  620  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  51.79 
 
 		 894 aa  622  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  53.4 
 
 		 885 aa  618  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0585  translation initiation factor IF-2  54.1 
 
 		 899 aa  615  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 		 848 aa  617  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0808  translation initiation factor IF-2  52.19 
 
 		 900 aa  615  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.925902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3465  translation initiation factor IF-2  46.73 
 
 		 905 aa  617  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  53.4 
 
 		 885 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  53.4 
 
 		 885 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42820  translation initiation factor IF-2  53.06 
 
 		 836 aa  617  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914178  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  53.4 
 
 		 889 aa  617  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  44.2 
 
 		 890 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  44.2 
 
 		 890 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  44.2 
 
 		 890 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4489  translation initiation factor IF-2  44.2 
 
 		 890 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02986  hypothetical protein  44.2 
 
 		 890 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.201323  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  44.2 
 
 		 890 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  44.2 
 
 		 890 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  44.2 
 
 		 890 aa  613  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>