More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0031 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  56.44 
 
 		 883 aa  689    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2070  translation initiation factor IF-2  56.18 
 
 		 907 aa  713    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  73.52 
 
 		 981 aa  961    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  80.37 
 
 		 921 aa  1338    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  60.96 
 
 		 926 aa  924    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  56.78 
 
 		 848 aa  919    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  60.92 
 
 		 959 aa  959    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  56.2 
 
 		 882 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  58.35 
 
 		 887 aa  759    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  67.17 
 
 		 989 aa  902    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  58.25 
 
 		 917 aa  925    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  56.54 
 
 		 986 aa  669    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  68.31 
 
 		 886 aa  1113    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  73.21 
 
 		 975 aa  955    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  55.09 
 
 		 949 aa  645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  46.46 
 
 		 922 aa  651    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  93.46 
 
 		 871 aa  1409    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  56.54 
 
 		 980 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  61.91 
 
 		 836 aa  768    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  55.28 
 
 		 947 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  48.23 
 
 		 885 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  53 
 
 		 848 aa  778    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  56.44 
 
 		 884 aa  687    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  61.45 
 
 		 964 aa  948    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  61.2 
 
 		 990 aa  959    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  54.29 
 
 		 856 aa  708    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  81.98 
 
 		 883 aa  1326    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  58.15 
 
 		 873 aa  788    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  82.34 
 
 		 886 aa  1313    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2490  translation initiation factor IF-2  51.74 
 
 		 875 aa  655    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  51.28 
 
 		 824 aa  741    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  71.12 
 
 		 1083 aa  1060    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  85.57 
 
 		 880 aa  1396    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  44.49 
 
 		 907 aa  660    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  42.86 
 
 		 891 aa  638    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  81.72 
 
 		 883 aa  1345    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 868 aa  1731    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  69 
 
 		 885 aa  922    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  58.63 
 
 		 835 aa  762    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  53.94 
 
 		 845 aa  670    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  58.33 
 
 		 1045 aa  764    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  62.67 
 
 		 856 aa  962    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  63.51 
 
 		 832 aa  790    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  68.44 
 
 		 917 aa  895    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1047  translation initiation factor IF-2  71.57 
 
 		 1053 aa  1025    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  55.49 
 
 		 861 aa  768    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  46.24 
 
 		 894 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  71 
 
 		 971 aa  939    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  67.17 
 
 		 990 aa  900    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  67.17 
 
 		 989 aa  902    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  59.8 
 
 		 887 aa  918    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  54.67 
 
 		 949 aa  648    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  62.07 
 
 		 836 aa  770    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  54.33 
 
 		 921 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  52.78 
 
 		 895 aa  631  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  54.4 
 
 		 898 aa  631  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  49.17 
 
 		 903 aa  630  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  45.95 
 
 		 881 aa  630  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  46.2 
 
 		 902 aa  629  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 896 aa  627  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  53.29 
 
 		 968 aa  626  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  49.48 
 
 		 985 aa  628  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  51.84 
 
 		 882 aa  625  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  47.29 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  47.29 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  47.29 
 
 		 890 aa  622  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  47.29 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3581  translation initiation factor IF-2  47.8 
 
 		 892 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  47.29 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  53.89 
 
 		 975 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  47.29 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  53.89 
 
 		 975 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02986  hypothetical protein  47.29 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.201323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3544  translation initiation factor IF-2  47.8 
 
 		 892 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3476  translation initiation factor IF-2  47.8 
 
 		 892 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  54.15 
 
 		 989 aa  625  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3475  translation initiation factor IF-2  47.8 
 
 		 892 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  47.29 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 896 aa  624  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3643  translation initiation factor IF-2  47.8 
 
 		 892 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.102541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  51.51 
 
 		 894 aa  623  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4489  translation initiation factor IF-2  47.29 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  53.89 
 
 		 975 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  53.89 
 
 		 975 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  52.52 
 
 		 868 aa  621  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  51.82 
 
 		 868 aa  619  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  53.2 
 
 		 992 aa  621  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  53.89 
 
 		 969 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  53.89 
 
 		 976 aa  620  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  47.12 
 
 		 880 aa  620  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  46.98 
 
 		 880 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  52.12 
 
 		 875 aa  622  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 		 1161 aa  620  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  47.27 
 
 		 885 aa  622  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  47.27 
 
 		 885 aa  622  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  46.98 
 
 		 880 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  46.98 
 
 		 880 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  53.72 
 
 		 975 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  46.98 
 
 		 889 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  53.72 
 
 		 975 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>