More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2490 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  50.69 
 
 		 1045 aa  674    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  57.34 
 
 		 838 aa  723    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  56.86 
 
 		 887 aa  733    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  45.94 
 
 		 917 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  49.26 
 
 		 959 aa  714    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  53.96 
 
 		 885 aa  704    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  52.75 
 
 		 981 aa  646    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  52.98 
 
 		 989 aa  662    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1047  translation initiation factor IF-2  51.13 
 
 		 1053 aa  658    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  53.52 
 
 		 871 aa  649    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  58.14 
 
 		 836 aa  720    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  53.05 
 
 		 990 aa  658    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 971 aa  661    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  54.32 
 
 		 887 aa  661    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  57.34 
 
 		 832 aa  730    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  49.04 
 
 		 964 aa  706    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  48.22 
 
 		 886 aa  708    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  52.53 
 
 		 873 aa  689    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  49.14 
 
 		 990 aa  711    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  52.98 
 
 		 886 aa  650    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2490  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 875 aa  1719    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  57.43 
 
 		 824 aa  715    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  52.9 
 
 		 883 aa  646    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  49.86 
 
 		 975 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  45.67 
 
 		 880 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  46.73 
 
 		 883 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 		 868 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  56.76 
 
 		 835 aa  736    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  76.69 
 
 		 845 aa  998    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  53.58 
 
 		 917 aa  700    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2070  translation initiation factor IF-2  49.06 
 
 		 907 aa  637    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  52.91 
 
 		 856 aa  684    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  70.57 
 
 		 856 aa  933    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  52.35 
 
 		 926 aa  719    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  55.92 
 
 		 861 aa  691    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  58.29 
 
 		 836 aa  721    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  44.94 
 
 		 921 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  52.18 
 
 		 1083 aa  679    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  44.87 
 
 		 848 aa  710    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  52.98 
 
 		 989 aa  662    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  50.29 
 
 		 848 aa  741    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  50.15 
 
 		 907 aa  634  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  46.86 
 
 		 881 aa  624  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  52.29 
 
 		 897 aa  619  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  51.33 
 
 		 882 aa  620  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  52.69 
 
 		 885 aa  620  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  53.45 
 
 		 853 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  52.7 
 
 		 896 aa  616  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  53.11 
 
 		 876 aa  617  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  52.36 
 
 		 943 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  53.22 
 
 		 894 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  52.07 
 
 		 949 aa  615  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  52.19 
 
 		 943 aa  610  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  49.24 
 
 		 880 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  44.4 
 
 		 854 aa  609  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  50.46 
 
 		 922 aa  610  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  49.24 
 
 		 880 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  52.09 
 
 		 953 aa  611  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  48.53 
 
 		 880 aa  611  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  49.24 
 
 		 880 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  49.24 
 
 		 880 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  50.84 
 
 		 889 aa  606  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 885 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  51.8 
 
 		 896 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 895 aa  608  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  54.17 
 
 		 831 aa  607  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  51.89 
 
 		 943 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 885 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 885 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 889 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  53.64 
 
 		 948 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  47.9 
 
 		 843 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  46.01 
 
 		 901 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  50.23 
 
 		 964 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 964 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  52.23 
 
 		 880 aa  601  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  52.6 
 
 		 884 aa  601  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  46.42 
 
 		 892 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  51.73 
 
 		 989 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  48.91 
 
 		 884 aa  600  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  51.08 
 
 		 979 aa  600  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  46.42 
 
 		 884 aa  601  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  44.64 
 
 		 894 aa  600  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  46.42 
 
 		 892 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  52.39 
 
 		 883 aa  598  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  46.37 
 
 		 882 aa  596  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  52.45 
 
 		 975 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  49.76 
 
 		 904 aa  596  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  52.53 
 
 		 890 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  51.72 
 
 		 845 aa  596  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  52.45 
 
 		 975 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  52.28 
 
 		 975 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  52.45 
 
 		 975 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 		 875 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  52.45 
 
 		 975 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  52.68 
 
 		 883 aa  598  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  51.24 
 
 		 986 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  50.16 
 
 		 875 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  52.36 
 
 		 890 aa  594  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  52.28 
 
 		 975 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>