More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1017 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1017  small GTP-binding protein  100 
 
 		 158 aa  315  1e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0990  small GTP-binding protein  77.22 
 
 		 157 aa  244  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1691  small GTP-binding protein  75.95 
 
 		 157 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0956  small GTP-binding protein  75.32 
 
 		 157 aa  236  9e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740927  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0457  small GTP-binding protein  40.16 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0486938 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2190  small GTP-binding protein  40.71 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  34.72 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  34.72 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  34.03 
 
 		 176 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4263  protein of unknown function ATP binding  36.81 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0846  small GTP-binding protein  35.71 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3872  protein of unknown function, ATP binding  36.11 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.21835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2803  protein of unknown function ATP binding protein  31.58 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000564845  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1430  putative ATP/GTP-binding protein  38.1 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1192  protein of unknown function, ATP binding protein  32.19 
 
 		 193 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1209  protein of unknown function, ATP binding  32.19 
 
 		 193 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.762798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1219  protein of unknown function, ATP binding  32.19 
 
 		 193 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0819  protein of unknown function, ATP binding  35.81 
 
 		 203 aa  67.4  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0275  protein of unknown function ATP binding protein  30.81 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3607  protein of unknown function ATP binding protein  32.39 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2203  protein of unknown function ATP binding protein  34.97 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.000213997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  31.65 
 
 		 1029 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2857  protein of unknown function, ATP binding  29.94 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0763  protein of unknown function ATP binding  35.14 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3340  protein of unknown function ATP binding protein  32.75 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.294578  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1539  protein of unknown function, ATP binding  31.76 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_002936  DET0983  translation initiation factor IF-2  32.08 
 
 		 593 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_855  translation initiation factor 2 (IF-2)  32.08 
 
 		 593 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00962289  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  38.89 
 
 		 874 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  36.07 
 
 		 903 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3196  GTPase-like protein  31.74 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16161  translation initiation factor IF-2  40.18 
 
 		 1113 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.446889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2047  putative ATP/GTP-binding protein  30.41 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3051  protein of unknown function ATP binding protein  30.06 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  37.7 
 
 		 692 aa  64.7  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37500  predicted GTPase  31.08 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.287948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  41.96 
 
 		 1183 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  36.89 
 
 		 971 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  41.96 
 
 		 1183 aa  64.3  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34260  predicted GTPase  34.46 
 
 		 195 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  38.39 
 
 		 1124 aa  64.3  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  37.08 
 
 		 187 aa  63.9  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1323  small GTP-binding protein  32.39 
 
 		 193 aa  63.9  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.415004  normal  0.083818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3225  protein of unknown function ATP binding  26.44 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3681  translation initiation factor IF-2  32.9 
 
 		 753 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00576781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4502  small GTP-binding protein  30.77 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.475752  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  39.81 
 
 		 679 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4183  protein of unknown function ATP binding  40.22 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.578204  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5185  protein of unknown function ATP binding  32.43 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.729225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  35.77 
 
 		 1116 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16851  translation initiation factor IF-2  39.29 
 
 		 1114 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  33.85 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0359  protein of unknown function ATP binding protein  32.92 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  32.03 
 
 		 658 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0760  putative ATP/GTP-binding protein  30.36 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2447  putative ATP/GTP-binding protein  29.65 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3252  hypothetical protein  29.82 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2387  protein of unknown function ATP binding  31.72 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  39.81 
 
 		 679 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0943  putative ATP/GTP-binding protein  32.89 
 
 		 195 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  37.5 
 
 		 1104 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0080  small GTP-binding protein  32.86 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0120715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0816  protein of unknown function ATP binding protein  32.21 
 
 		 197 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0322936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3666  protein of unknown function ATP binding protein  30.41 
 
 		 205 aa  62  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132662  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5250  protein of unknown function ATP binding  30.67 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2069  protein of unknown function ATP binding  31.03 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0874  translation initiation factor IF-2  31.45 
 
 		 593 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0133057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  36.07 
 
 		 985 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0461  protein of unknown function ATP binding  33.12 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  32.74 
 
 		 774 aa  61.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  30.19 
 
 		 856 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0770  translation initiation factor IF-2  35.77 
 
 		 894 aa  61.2  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3977  protein of unknown function ATP binding  31.9 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1292  protein of unknown function ATP binding  29.76 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980215  hitchhiker  0.00348486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3123  protein of unknown function ATP binding protein  29.7 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  39.29 
 
 		 1128 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3316  protein of unknown function ATP binding  32.88 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4886  protein of unknown function, ATP binding  29.45 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5992  normal  0.0181219 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0910  translation initiation factor IF-2  37.96 
 
 		 656 aa  60.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3802  protein of unknown function ATP binding protein  32.43 
 
 		 202 aa  60.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.575457  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  37.74 
 
 		 928 aa  60.8  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5269  hypothetical protein  27.49 
 
 		 197 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  37.5 
 
 		 1176 aa  60.5  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2006  protein of unknown function ATP binding  30.87 
 
 		 186 aa  60.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.959688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0392  protein of unknown function ATP binding  26.99 
 
 		 197 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.494311  normal  0.506956 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  39.29 
 
 		 1161 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  36.13 
 
 		 845 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  36.7 
 
 		 686 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2531  protein of unknown function ATP binding  33.06 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5416  protein of unknown function ATP binding  31.94 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  35.19 
 
 		 732 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  37.04 
 
 		 711 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01830  predicted GTPase  32.88 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02280  predicted GTPase  30.07 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.650431  normal  0.614387 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0563  translation initiation factor IF-2  38.53 
 
 		 830 aa  59.7  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.114537  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  34.43 
 
 		 729 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3825  translation initiation factor IF-2  36.7 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.29796e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  36.7 
 
 		 688 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  38.39 
 
 		 1126 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0313  protein of unknown function ATP binding  31.76 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0533217  normal  0.116256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>