More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2190 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2190  small GTP-binding protein  100 
 
 		 161 aa  327  5.0000000000000004e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0457  small GTP-binding protein  48.1 
 
 		 168 aa  166  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0486938 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1691  small GTP-binding protein  38.52 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0990  small GTP-binding protein  37.4 
 
 		 157 aa  87.4  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1017  small GTP-binding protein  40.71 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0080  small GTP-binding protein  37.28 
 
 		 177 aa  86.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0120715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4502  small GTP-binding protein  34.94 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.475752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  38.41 
 
 		 176 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3230  small GTP-binding protein  36.26 
 
 		 177 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.137976 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0956  small GTP-binding protein  37.4 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  37.8 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0846  small GTP-binding protein  47.92 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  35.06 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13398  ATP/GTP-binding protein  34.32 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00758  normal  0.0959612 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0253  protein of unknown function, ATP binding  31.58 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  34.78 
 
 		 387 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0379  small GTP-binding protein  35.51 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1323  small GTP-binding protein  36.76 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.415004  normal  0.083818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3915  protein of unknown function, ATP binding  36.3 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  40.91 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1192  protein of unknown function, ATP binding protein  36.69 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1209  protein of unknown function, ATP binding  36.69 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.762798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1219  protein of unknown function, ATP binding  36.69 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2401  protein of unknown function ATP binding  32.75 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.37736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1539  protein of unknown function, ATP binding  33.9 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2531  protein of unknown function ATP binding  36.07 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2006  protein of unknown function ATP binding  39.42 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.959688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01160  small GTP-binding protein domain protein  40.57 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0275  protein of unknown function ATP binding protein  42.86 
 
 		 193 aa  67.4  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1430  putative ATP/GTP-binding protein  40.82 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0776  protein of unknown function ATP binding  39.33 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5250  protein of unknown function ATP binding  34.88 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4886  protein of unknown function, ATP binding  32.93 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5992  normal  0.0181219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2203  protein of unknown function ATP binding protein  41.84 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.000213997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4183  protein of unknown function ATP binding  41.24 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.578204  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5185  protein of unknown function ATP binding  35.16 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.729225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1824  hypothetical protein  34.32 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24580  predicted GTPase  39.18 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0392  protein of unknown function ATP binding  33.08 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.494311  normal  0.506956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1791  hypothetical protein  35.16 
 
 		 195 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3252  hypothetical protein  37.76 
 
 		 195 aa  63.9  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5473  protein of unknown function ATP binding  38.78 
 
 		 204 aa  63.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  0.984202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0760  putative ATP/GTP-binding protein  39.8 
 
 		 196 aa  63.9  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0973  hypothetical protein  35.16 
 
 		 194 aa  63.9  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.617604  normal  0.248176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1292  protein of unknown function ATP binding  37.39 
 
 		 203 aa  63.9  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980215  hitchhiker  0.00348486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3607  protein of unknown function ATP binding protein  33.59 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1811  hypothetical protein  42.27 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3196  GTPase-like protein  39.8 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3051  protein of unknown function ATP binding protein  39.8 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2752  protein of unknown function ATP binding protein  31.74 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0943  putative ATP/GTP-binding protein  30.77 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5489  protein of unknown function ATP binding  32.06 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448291  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0641  protein of unknown function, ATP binding  32.39 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.437609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2857  protein of unknown function, ATP binding  34.11 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0174  protein of unknown function ATP binding protein  40.4 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34260  predicted GTPase  39.62 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2387  protein of unknown function ATP binding  34.15 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3845  protein of unknown function ATP binding  38.78 
 
 		 203 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3172  protein of unknown function ATP binding protein  40.4 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216462  normal  0.253397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3123  protein of unknown function ATP binding protein  37.76 
 
 		 199 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0275  protein of unknown function ATP binding  40.4 
 
 		 205 aa  62  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.550996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7865  protein of unknown function ATP binding  34.62 
 
 		 202 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.348128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0461  protein of unknown function ATP binding  40.38 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01830  predicted GTPase  40.4 
 
 		 189 aa  62  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0313  protein of unknown function ATP binding  39.39 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0533217  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06970  predicted GTPase  33.33 
 
 		 191 aa  62  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0253092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0763  protein of unknown function ATP binding  31.76 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5269  hypothetical protein  39.18 
 
 		 197 aa  62  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  31.41 
 
 		 1161 aa  61.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0819  protein of unknown function, ATP binding  31.18 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0359  protein of unknown function ATP binding protein  39.39 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0977  hypothetical protein  34.1 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.235397  normal  0.429497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1148  hypothetical protein  35.71 
 
 		 199 aa  60.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371751  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2047  putative ATP/GTP-binding protein  37.86 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5416  protein of unknown function ATP binding  32.35 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2447  putative ATP/GTP-binding protein  39.8 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2069  protein of unknown function ATP binding  38.38 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3811  protein of unknown function ATP binding protein  37.76 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3340  protein of unknown function ATP binding protein  36.63 
 
 		 193 aa  60.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.294578  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2803  protein of unknown function ATP binding protein  32.16 
 
 		 204 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000564845  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1141  protein of unknown function ATP binding protein  37.89 
 
 		 236 aa  60.5  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3802  protein of unknown function ATP binding protein  37.76 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.575457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5993  protein of unknown function ATP binding  31.52 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222654  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3225  protein of unknown function ATP binding  29.55 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4263  protein of unknown function ATP binding  35.16 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3977  protein of unknown function ATP binding  35.71 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37500  predicted GTPase  34.69 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.287948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  32.7 
 
 		 571 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02280  predicted GTPase  33.67 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.650431  normal  0.614387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0816  protein of unknown function ATP binding protein  36.73 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0322936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3596  protein of unknown function, ATP binding  35.71 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  29.94 
 
 		 693 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3316  protein of unknown function ATP binding  37.11 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4333  protein of unknown function, ATP binding  35.71 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3666  protein of unknown function ATP binding protein  33.33 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132662  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33540  predicted GTPase  33.58 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168507  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  29.94 
 
 		 690 aa  58.9  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0153  hypothetical protein  37.76 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0366  protein of unknown function ATP binding  38 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3872  protein of unknown function, ATP binding  34.92 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.21835  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>