More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1934 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 571 aa  1146    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1473  translation initiation factor IF-2  78.47 
 
 		 579 aa  873    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147864  unclonable  0.00000476955 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  56.55 
 
 		 601 aa  653    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  46.34 
 
 		 692 aa  509  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  49.6 
 
 		 732 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  45.49 
 
 		 903 aa  498  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  46.65 
 
 		 822 aa  496  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  45.77 
 
 		 739 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  46.75 
 
 		 686 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  46.94 
 
 		 943 aa  483  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  43.62 
 
 		 969 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  46.75 
 
 		 686 aa  482  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  46.94 
 
 		 686 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  46.75 
 
 		 686 aa  481  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  46.75 
 
 		 686 aa  481  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  43.79 
 
 		 975 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  46.75 
 
 		 686 aa  481  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  43.79 
 
 		 975 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  43.79 
 
 		 975 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  46.94 
 
 		 686 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  43.79 
 
 		 975 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  43.48 
 
 		 688 aa  480  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  46.17 
 
 		 679 aa  479  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  46.17 
 
 		 679 aa  479  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  46.91 
 
 		 689 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  43.75 
 
 		 868 aa  476  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  43.81 
 
 		 975 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  43.92 
 
 		 964 aa  477  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  47.09 
 
 		 668 aa  478  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  43.62 
 
 		 975 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  43.45 
 
 		 972 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  46.35 
 
 		 688 aa  477  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  43.99 
 
 		 972 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  43.45 
 
 		 976 aa  475  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  43.45 
 
 		 971 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  43.45 
 
 		 971 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  43.62 
 
 		 971 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  43.62 
 
 		 975 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  43.45 
 
 		 971 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  48.29 
 
 		 928 aa  475  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  45.8 
 
 		 1079 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  43.73 
 
 		 883 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  44.81 
 
 		 991 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  43.03 
 
 		 774 aa  475  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  47.39 
 
 		 946 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0222  translation initiation factor IF-2  43.58 
 
 		 877 aa  474  1e-132  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0273572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  48.5 
 
 		 924 aa  472  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3221  translation initiation factor IF-2  49.7 
 
 		 815 aa  474  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.109257 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  43.11 
 
 		 884 aa  472  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  49 
 
 		 970 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  48.18 
 
 		 845 aa  472  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  44.96 
 
 		 945 aa  474  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  43.4 
 
 		 964 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  46.79 
 
 		 951 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  44.02 
 
 		 984 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  43.48 
 
 		 720 aa  472  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  43.5 
 
 		 986 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  43.3 
 
 		 904 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  45.53 
 
 		 705 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  44.83 
 
 		 997 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0248  translation initiation factor IF-2  43.43 
 
 		 888 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346086  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  43.33 
 
 		 989 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  46.32 
 
 		 956 aa  470  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  46.55 
 
 		 689 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  45.53 
 
 		 705 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  43.46 
 
 		 980 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  43.23 
 
 		 964 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  43.92 
 
 		 1005 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  44.64 
 
 		 885 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  47.07 
 
 		 854 aa  466  9.999999999999999e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  48.17 
 
 		 1029 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  43.33 
 
 		 965 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  43.89 
 
 		 953 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  44.27 
 
 		 985 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  46.72 
 
 		 1059 aa  466  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  43.71 
 
 		 986 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  42.41 
 
 		 882 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  44.35 
 
 		 968 aa  468  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  47.87 
 
 		 888 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  43.01 
 
 		 992 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  43.31 
 
 		 1161 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  44.54 
 
 		 1161 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0983  translation initiation factor IF-2  43.06 
 
 		 593 aa  463  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  44.02 
 
 		 948 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  44.27 
 
 		 880 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  43.3 
 
 		 922 aa  463  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1867  translation initiation factor IF-2  43.94 
 
 		 1038 aa  462  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  43.65 
 
 		 1058 aa  465  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  43.11 
 
 		 882 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  43.08 
 
 		 979 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0874  translation initiation factor IF-2  42.88 
 
 		 593 aa  462  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0133057  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  44.64 
 
 		 885 aa  465  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  44.64 
 
 		 885 aa  465  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  44.27 
 
 		 880 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  44.27 
 
 		 880 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  44.64 
 
 		 889 aa  464  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  42.91 
 
 		 971 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  44.27 
 
 		 880 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  43.75 
 
 		 882 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  44.44 
 
 		 880 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>