More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3074 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 298 aa  612  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  59.06 
 
 		 306 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  60.47 
 
 		 308 aa  363  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  57.29 
 
 		 295 aa  355  5.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2142  GTP-binding protein Era  57.34 
 
 		 299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  53.56 
 
 		 296 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  54.27 
 
 		 293 aa  330  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  52.72 
 
 		 295 aa  324  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  53.42 
 
 		 294 aa  322  5e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  48.1 
 
 		 289 aa  293  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  46.6 
 
 		 311 aa  279  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1731  GTP-binding protein Era  44.84 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  decreased coverage  0.0035862 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  42.41 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  40.34 
 
 		 301 aa  248  7e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  45.05 
 
 		 306 aa  248  9e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  44.86 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 		 299 aa  245  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  43.3 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  38.85 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  40.6 
 
 		 302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  41.1 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  42.57 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0569  GTP-binding protein Era  43.79 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  39.59 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0456  GTP-binding protein Era  43.23 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  39.46 
 
 		 300 aa  238  9e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  39.26 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43907  predicted protein  44.41 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  41.53 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0864  GTP-binding protein Era  44 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1008  GTP-binding protein Era  44 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  43.84 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  38.18 
 
 		 302 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  43.2 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  38.46 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  42.23 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1754  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.141942  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 298 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 298 aa  231  9e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  40.54 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  38.36 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  40 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  42.05 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0350  GTP-binding protein Era  41.45 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000177967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1793  GTP-binding protein Era  40.65 
 
 		 307 aa  226  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375473  normal  0.0439993 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0419  GTP-binding protein Era  43.37 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000385747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  37.63 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  40.67 
 
 		 314 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  38.91 
 
 		 307 aa  225  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  40.67 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  36.79 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  40.6 
 
 		 320 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  38.78 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  41.3 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  37.29 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  36.95 
 
 		 301 aa  222  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  36.95 
 
 		 301 aa  222  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  37.29 
 
 		 301 aa  222  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  38.23 
 
 		 293 aa  222  7e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  38.31 
 
 		 296 aa  221  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  36.95 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  38.44 
 
 		 299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  36.95 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  36.95 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  38 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  36.95 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  36.95 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  37.42 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  41.2 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  41.64 
 
 		 299 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  40.6 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  40.47 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21922  predicted protein  41.58 
 
 		 306 aa  218  7e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  38.78 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  42.91 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0375  GTP-binding protein Era  40.2 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.426985  hitchhiker  0.000823221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2417  GTP-binding protein Era  41.02 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.262207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  41.98 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  41.98 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  42.05 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  39.73 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2038  GTP-binding protein Era  40.88 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.655908  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  39.31 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0368  GTP-binding protein Era  41.37 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  41.28 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  37.33 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  42.05 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  42.05 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  42.05 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0334  GTP-binding protein Era  41.5 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.94828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>