More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1731 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1731  GTP-binding protein Era  100 
 
 
305 aa  629  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  decreased coverage  0.0035862 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0456  GTP-binding protein Era  75.41 
 
 
306 aa  489  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371329  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0350  GTP-binding protein Era  72.46 
 
 
305 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000177967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0419  GTP-binding protein Era  69.84 
 
 
305 aa  454  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000385747  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  69.64 
 
 
306 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0569  GTP-binding protein Era  68.2 
 
 
305 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1793  GTP-binding protein Era  67.55 
 
 
307 aa  438  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375473  normal  0.0439993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  48.84 
 
 
311 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 
295 aa  255  5e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  44.84 
 
 
298 aa  251  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  42.3 
 
 
295 aa  247  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  45.18 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  43.93 
 
 
306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  43.75 
 
 
308 aa  242  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  40.91 
 
 
296 aa  238  9e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  41.12 
 
 
303 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  40.78 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  40.94 
 
 
294 aa  222  6e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  39.74 
 
 
296 aa  222  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  40 
 
 
298 aa  222  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 
293 aa  222  7e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43907  predicted protein  43.09 
 
 
351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  40.66 
 
 
297 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 
299 aa  219  5e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  40 
 
 
299 aa  218  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  40.26 
 
 
297 aa  218  8.999999999999998e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  41.21 
 
 
303 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  37.94 
 
 
302 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  37.7 
 
 
301 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  37.38 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  40.46 
 
 
306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  38.87 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  37.95 
 
 
301 aa  215  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  38.87 
 
 
294 aa  215  8e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  39.34 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  38.69 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  37.7 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  37.7 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  37.7 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  37.7 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  37.7 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  37.7 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  39.26 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  41.14 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  37.7 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  37.7 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  40.82 
 
 
301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  38.24 
 
 
308 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  37.38 
 
 
301 aa  211  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  38.19 
 
 
307 aa  211  9e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  37.87 
 
 
302 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  39.67 
 
 
299 aa  210  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  40 
 
 
300 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  40.94 
 
 
300 aa  210  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  41.28 
 
 
301 aa  210  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  38.08 
 
 
299 aa  210  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  38.08 
 
 
299 aa  210  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 
303 aa  209  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  39.93 
 
 
293 aa  209  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  37.38 
 
 
293 aa  208  8e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  39.67 
 
 
305 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  39.22 
 
 
303 aa  206  4e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  40 
 
 
301 aa  206  5e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  37.7 
 
 
303 aa  205  8e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  37.25 
 
 
305 aa  204  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  37.1 
 
 
308 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 
307 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1754  GTP-binding protein Era  38.16 
 
 
302 aa  203  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.141942  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  39.14 
 
 
303 aa  204  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2142  GTP-binding protein Era  39.09 
 
 
299 aa  202  4e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  37.09 
 
 
300 aa  202  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  38.11 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  39.47 
 
 
311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  39.22 
 
 
449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  36.16 
 
 
300 aa  199  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  35.88 
 
 
298 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  38.96 
 
 
312 aa  200  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  37.16 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  39.4 
 
 
294 aa  199  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  38.89 
 
 
451 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  39.81 
 
 
308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  36.84 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  39.74 
 
 
293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  39.87 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2203  GTP-binding protein Era  39.02 
 
 
306 aa  196  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.00609862 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  38.62 
 
 
324 aa  195  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  37.5 
 
 
310 aa  195  8.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  38.87 
 
 
489 aa  195  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  37.34 
 
 
322 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  36.33 
 
 
296 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  40 
 
 
307 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  36.84 
 
 
298 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  36.33 
 
 
296 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  38.11 
 
 
299 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  37.46 
 
 
314 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  35.28 
 
 
301 aa  193  4e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  37.3 
 
 
299 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  37.79 
 
 
299 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  37.3 
 
 
299 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>