More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0251 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 311 aa  632  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43907  predicted protein  49.66 
 
 		 351 aa  288  8e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  47.96 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  45.67 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  48.11 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  46.6 
 
 		 298 aa  279  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  47.12 
 
 		 308 aa  278  9e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  47.96 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  49.01 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  46.26 
 
 		 295 aa  265  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  46.94 
 
 		 294 aa  265  8.999999999999999e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  46.44 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  47.45 
 
 		 315 aa  262  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  46.1 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  44.22 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  44.22 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  45.73 
 
 		 293 aa  258  6e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1793  GTP-binding protein Era  48 
 
 		 307 aa  258  9e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375473  normal  0.0439993 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0569  GTP-binding protein Era  47.39 
 
 		 305 aa  258  9e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  44.86 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  46.05 
 
 		 293 aa  258  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  47.08 
 
 		 289 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  46.76 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  46.46 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1731  GTP-binding protein Era  48.84 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  decreased coverage  0.0035862 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  43.2 
 
 		 299 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0350  GTP-binding protein Era  47.21 
 
 		 305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000177967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  40.27 
 
 		 298 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  45 
 
 		 307 aa  252  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  44.33 
 
 		 296 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0419  GTP-binding protein Era  47.21 
 
 		 305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000385747  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  45.52 
 
 		 303 aa  252  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  43.92 
 
 		 308 aa  252  6e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  42.66 
 
 		 301 aa  252  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  44.07 
 
 		 297 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 		 296 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2142  GTP-binding protein Era  45.89 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  42.66 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  44.9 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  42.43 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  41.98 
 
 		 298 aa  249  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0375  GTP-binding protein Era  44.13 
 
 		 339 aa  249  4e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.426985  hitchhiker  0.000823221 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 		 302 aa  248  9e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  45.05 
 
 		 303 aa  247  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  46.78 
 
 		 301 aa  247  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0456  GTP-binding protein Era  47.19 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371329  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  45.42 
 
 		 307 aa  246  4e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  45.36 
 
 		 306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  44.83 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  42.61 
 
 		 296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  43.34 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  38.83 
 
 		 314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  43.64 
 
 		 306 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  44.86 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  42.37 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  42.91 
 
 		 305 aa  239  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  43.73 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  45.02 
 
 		 489 aa  238  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  41.44 
 
 		 293 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  43.34 
 
 		 299 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  40.34 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  43.19 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  41.45 
 
 		 314 aa  235  7e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1754  GTP-binding protein Era  41.47 
 
 		 302 aa  235  8e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.141942  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  43.34 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  42.23 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  43.2 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  40.86 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  42.27 
 
 		 298 aa  232  6e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  45.61 
 
 		 449 aa  232  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2038  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 		 324 aa  232  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.655908  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0334  GTP-binding protein Era  43.59 
 
 		 330 aa  232  7.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.94828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  43.82 
 
 		 324 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  39.73 
 
 		 298 aa  231  9e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0864  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 		 296 aa  231  9e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1008  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 		 296 aa  231  9e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  41.33 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0368  GTP-binding protein Era  43.71 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  42.72 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  38.36 
 
 		 329 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  43.71 
 
 		 451 aa  229  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>