More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3235 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  100 
 
 
489 aa  995    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  48.39 
 
 
468 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  48.45 
 
 
451 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  47.62 
 
 
449 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  47.99 
 
 
302 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  47.26 
 
 
298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  46.02 
 
 
301 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  49.5 
 
 
300 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  44.64 
 
 
298 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  45.33 
 
 
301 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  44.64 
 
 
301 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  44.98 
 
 
301 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  44.98 
 
 
301 aa  264  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  44.98 
 
 
301 aa  264  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  44.98 
 
 
301 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  47.24 
 
 
302 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  44.98 
 
 
301 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  44.98 
 
 
301 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  44.98 
 
 
301 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  44.64 
 
 
301 aa  262  8e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  47.93 
 
 
302 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  45.76 
 
 
299 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  45.76 
 
 
299 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  45.55 
 
 
293 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  44.26 
 
 
298 aa  256  8e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  45.05 
 
 
303 aa  256  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 
294 aa  253  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  46.05 
 
 
299 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  45.58 
 
 
302 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  44.07 
 
 
299 aa  250  5e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  43.92 
 
 
337 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  48.07 
 
 
300 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  43.18 
 
 
314 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  44.86 
 
 
308 aa  247  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  47.72 
 
 
301 aa  246  6e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  44.08 
 
 
303 aa  246  6e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 
303 aa  246  6.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 
311 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  44.67 
 
 
297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  44.26 
 
 
300 aa  244  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  43.79 
 
 
296 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  43.79 
 
 
296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 
299 aa  243  6e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2116  GTP-binding protein Era  45.51 
 
 
310 aa  242  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  42.61 
 
 
298 aa  242  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  45.82 
 
 
306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  43.92 
 
 
297 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  41.35 
 
 
310 aa  240  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  43.34 
 
 
299 aa  240  4e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  42.23 
 
 
297 aa  239  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  41.83 
 
 
313 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  43.1 
 
 
300 aa  239  9e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  41.58 
 
 
297 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  45.02 
 
 
301 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  45.02 
 
 
311 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 
303 aa  238  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 
303 aa  237  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  46.67 
 
 
301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 
301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 
303 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  44.86 
 
 
297 aa  236  8e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  42.23 
 
 
318 aa  235  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 
293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  39.59 
 
 
295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  41.5 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  42.61 
 
 
307 aa  233  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  41.33 
 
 
303 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 
315 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  42.22 
 
 
322 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  40.28 
 
 
294 aa  232  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  41.69 
 
 
305 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 
312 aa  229  8e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  47.24 
 
 
301 aa  229  9e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  43.49 
 
 
296 aa  229  9e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  43.1 
 
 
307 aa  229  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  44.87 
 
 
314 aa  229  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  42.09 
 
 
303 aa  228  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  41.64 
 
 
314 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  40.53 
 
 
305 aa  228  3e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 
308 aa  227  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  40.94 
 
 
303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  41.64 
 
 
314 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  40.74 
 
 
299 aa  226  6e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  40.8 
 
 
303 aa  226  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  42.76 
 
 
296 aa  226  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0569  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 
305 aa  224  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  41.12 
 
 
343 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1743  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 
293 aa  225  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  43 
 
 
310 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  45.91 
 
 
299 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  40.6 
 
 
303 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  42.67 
 
 
310 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  42.43 
 
 
315 aa  223  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  43.33 
 
 
310 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  40.34 
 
 
315 aa  222  9e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 
318 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  42.38 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1271  GTP-binding protein Era  41.25 
 
 
307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 
300 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 
307 aa  220  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>