More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1062 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 297 aa  598  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  74.75 
 
 		 297 aa  472  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  71.04 
 
 		 298 aa  441  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  69.02 
 
 		 299 aa  421  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  64.67 
 
 		 296 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  60.4 
 
 		 296 aa  361  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  52.92 
 
 		 302 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  52.86 
 
 		 303 aa  319  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  52.53 
 
 		 302 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  52.36 
 
 		 300 aa  315  8e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  53.72 
 
 		 303 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  53.58 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  52.7 
 
 		 305 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  52.53 
 
 		 302 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  51.01 
 
 		 301 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 		 301 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  51.01 
 
 		 301 aa  308  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  51.01 
 
 		 301 aa  308  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  51.01 
 
 		 301 aa  308  5e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  51.01 
 
 		 301 aa  308  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  51.01 
 
 		 301 aa  308  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 		 301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 		 301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 		 301 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 301 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  49.49 
 
 		 300 aa  301  9e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  52.88 
 
 		 307 aa  298  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  53.22 
 
 		 297 aa  297  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  47.26 
 
 		 294 aa  296  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  52.74 
 
 		 299 aa  296  4e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 324 aa  295  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  49.5 
 
 		 303 aa  295  8e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  52.4 
 
 		 299 aa  292  4e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  46.42 
 
 		 298 aa  291  7e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  50.67 
 
 		 303 aa  291  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  49.14 
 
 		 293 aa  288  7e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 		 303 aa  286  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  47.99 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  50.32 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 		 301 aa  281  7.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  49.19 
 
 		 310 aa  281  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  48.87 
 
 		 310 aa  280  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  46.96 
 
 		 299 aa  278  8e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  46.96 
 
 		 299 aa  278  8e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  47.8 
 
 		 302 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  46.92 
 
 		 296 aa  275  7e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  46.92 
 
 		 296 aa  275  7e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  46.42 
 
 		 306 aa  275  8e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  46.26 
 
 		 301 aa  275  9e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  48.46 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  45.95 
 
 		 299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  47.46 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  45.12 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  47.24 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  46.28 
 
 		 310 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  46.05 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  46.05 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  47.1 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  46.05 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  46.05 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  45.97 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  46.05 
 
 		 338 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  46.05 
 
 		 339 aa  262  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  44.86 
 
 		 295 aa  261  6.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  44.56 
 
 		 314 aa  261  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  46.64 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  45.7 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  45.7 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  46.18 
 
 		 305 aa  260  1e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  45.7 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  44.56 
 
 		 314 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  46.05 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  44.9 
 
 		 307 aa  259  3e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  45.79 
 
 		 301 aa  259  4e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  45.82 
 
 		 314 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  46.58 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  46.78 
 
 		 300 aa  258  7e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  46.39 
 
 		 332 aa  258  7e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  45.21 
 
 		 300 aa  258  8e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  44.67 
 
 		 334 aa  258  8e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1055  GTP-binding protein Era  45.36 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.305359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  45.79 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  45.02 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  43.84 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  43.99 
 
 		 329 aa  256  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  47.64 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  44.33 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  43.64 
 
 		 335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  45.12 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  44.22 
 
 		 337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  43.19 
 
 		 311 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  45.21 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  45.76 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  45.24 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3726  GTP-binding protein Era  43.22 
 
 		 340 aa  250  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  45.21 
 
 		 311 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2417  GTP-binding protein Era  45.03 
 
 		 312 aa  248  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.262207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2619  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>