More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01555 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  100 
 
 		 294 aa  600  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  81.44 
 
 		 295 aa  500  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  80.28 
 
 		 293 aa  491  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2142  GTP-binding protein Era  58.28 
 
 		 299 aa  350  1e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  54.95 
 
 		 308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  56.55 
 
 		 296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  55.93 
 
 		 295 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  53.58 
 
 		 306 aa  332  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  53.42 
 
 		 298 aa  329  3e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  47.4 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  46.58 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  45.58 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  43.84 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  43.84 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 		 299 aa  256  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  43.88 
 
 		 299 aa  252  6e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  42.66 
 
 		 302 aa  251  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  41.38 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  42.07 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  41.5 
 
 		 302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  41.58 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  39.04 
 
 		 301 aa  241  7.999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21922  predicted protein  41.72 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0569  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  42.76 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  39.86 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 314 aa  239  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  41.1 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  42.03 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  40.28 
 
 		 489 aa  239  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  42.61 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 		 297 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  41.16 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  41.24 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  43.1 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  44.01 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0456  GTP-binding protein Era  41.28 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371329  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43907  predicted protein  41.64 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  42.18 
 
 		 299 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  40.89 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  40.34 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  42.18 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  38.7 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1731  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  decreased coverage  0.0035862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  38.97 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  42.21 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  39.31 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  37.84 
 
 		 300 aa  232  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  41.36 
 
 		 298 aa  232  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  37.54 
 
 		 298 aa  232  6e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  38.57 
 
 		 308 aa  231  8.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  38.62 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  42.76 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  38.7 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  39.18 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  38.38 
 
 		 298 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  38.28 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  42.18 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1793  GTP-binding protein Era  40.8 
 
 		 307 aa  229  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375473  normal  0.0439993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1476  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  39.38 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  39.38 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  39.38 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  38.36 
 
 		 315 aa  228  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  41.33 
 
 		 307 aa  228  8e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  36.39 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  41.3 
 
 		 296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  39.66 
 
 		 312 aa  225  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  36.08 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  41.67 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  40.69 
 
 		 451 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  38.36 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  39.04 
 
 		 301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  39.46 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  38.49 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2203  GTP-binding protein Era  35.95 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.00609862 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  38.97 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  38.78 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  39.45 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  40.41 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>