More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3856 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 308 aa  625  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  66.1 
 
 		 306 aa  418  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  60.47 
 
 		 298 aa  363  2e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  55.56 
 
 		 295 aa  340  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  55.07 
 
 		 295 aa  334  9e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  54.95 
 
 		 294 aa  330  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  55.63 
 
 		 293 aa  328  5.0000000000000004e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2142  GTP-binding protein Era  56 
 
 		 299 aa  322  4e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  53.4 
 
 		 296 aa  316  3e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  47.12 
 
 		 311 aa  278  9e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  45.08 
 
 		 289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  45.15 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 		 301 aa  249  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  44.15 
 
 		 301 aa  249  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0456  GTP-binding protein Era  44.26 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371329  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0419  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000385747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  42.03 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  42.23 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 		 301 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 		 303 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  44.59 
 
 		 296 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  42 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  41.41 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  44.93 
 
 		 298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1731  GTP-binding protein Era  43.75 
 
 		 305 aa  242  6e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  decreased coverage  0.0035862 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0350  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000177967  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0569  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  41.89 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  43.96 
 
 		 299 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  43.14 
 
 		 303 aa  236  2e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  42.23 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  41.81 
 
 		 302 aa  235  7e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  41.47 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1793  GTP-binding protein Era  42.31 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375473  normal  0.0439993 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 		 324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  41.23 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  41.36 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  41.81 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  41.81 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1754  GTP-binding protein Era  41.69 
 
 		 302 aa  229  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.141942  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  42.67 
 
 		 297 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  42.21 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 		 293 aa  228  7e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  43.43 
 
 		 299 aa  228  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  40.4 
 
 		 302 aa  228  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  41.99 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 		 489 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43907  predicted protein  40.33 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  43.62 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  39.39 
 
 		 298 aa  225  8e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  42.24 
 
 		 311 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  39.74 
 
 		 305 aa  225  9e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  43.4 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2619  GTP-binding protein Era  42.39 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3266  GTP-binding protein Era  42.39 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0242334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1197  GTP-binding protein Era  43.19 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3060  GTP-binding protein Era  41.55 
 
 		 357 aa  222  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  41.08 
 
 		 294 aa  222  8e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3634  GTP-binding protein Era  41.08 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.407522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  41.33 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  41.84 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1744  GTP-binding protein Era  40.39 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000728906  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  40.74 
 
 		 300 aa  219  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5260  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 		 344 aa  218  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.678388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  39.4 
 
 		 303 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0994  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307835  normal  0.0847852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0929  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163867  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2417  GTP-binding protein Era  43.77 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.262207 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  38.87 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  36.93 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1064  GTP-binding protein Era  42 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0212543  normal  0.0907756 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  40.97 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  41.5 
 
 		 299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  40.27 
 
 		 306 aa  215  7e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  40.88 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  40.88 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>