More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0419 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0419  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 305 aa  622  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000385747  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0350  GTP-binding protein Era  74.75 
 
 		 305 aa  479  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000177967  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0456  GTP-binding protein Era  73.77 
 
 		 306 aa  474  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371329  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1731  GTP-binding protein Era  69.84 
 
 		 305 aa  454  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  decreased coverage  0.0035862 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0569  GTP-binding protein Era  66.89 
 
 		 305 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  66.12 
 
 		 306 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1793  GTP-binding protein Era  64.26 
 
 		 307 aa  420  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375473  normal  0.0439993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  47.21 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  45.7 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  40.33 
 
 		 298 aa  232  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 		 289 aa  232  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  39.34 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  40.66 
 
 		 299 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  38.36 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  43.37 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  41.53 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  42.9 
 
 		 296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  40.53 
 
 		 295 aa  225  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  39.74 
 
 		 301 aa  225  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  39.74 
 
 		 301 aa  225  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  39.74 
 
 		 301 aa  225  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  39.74 
 
 		 301 aa  225  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  39.74 
 
 		 301 aa  225  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  39.41 
 
 		 301 aa  224  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  40.27 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  39.74 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  39.74 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  39.09 
 
 		 301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  38.03 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  39.34 
 
 		 297 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  40.2 
 
 		 299 aa  222  7e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  39.54 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  40.26 
 
 		 302 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  38.76 
 
 		 296 aa  219  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  40.45 
 
 		 297 aa  219  7e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  41.2 
 
 		 305 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  38.61 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43907  predicted protein  42.44 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  39.67 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  38.44 
 
 		 303 aa  212  7e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  39.67 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  37.05 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  40.79 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  40.82 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  40.79 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  38.16 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  37.21 
 
 		 298 aa  208  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2142  GTP-binding protein Era  39.03 
 
 		 299 aa  208  9e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  38.54 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  37.13 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  38.94 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  39.27 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  40.33 
 
 		 301 aa  205  9e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  36.42 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2898  GTP-binding protein Era  39.54 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22233  normal  0.295103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 489 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  38.89 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  38 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  38.56 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  37.83 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  38.56 
 
 		 299 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  38.56 
 
 		 299 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  38.16 
 
 		 303 aa  203  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0994  GTP-binding protein Era  37.58 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307835  normal  0.0847852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0929  GTP-binding protein Era  37.58 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163867  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  37.75 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  38.89 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  38.16 
 
 		 299 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  38.56 
 
 		 311 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  38.56 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  38.56 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  38.56 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  38.56 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  38.56 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1064  GTP-binding protein Era  36.27 
 
 		 298 aa  201  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0212543  normal  0.0907756 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  38.24 
 
 		 299 aa  201  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  40.2 
 
 		 307 aa  201  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1086  GTP-binding protein Era  38.89 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  38.24 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  37.91 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  38.24 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  37.58 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  39.06 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  38.64 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  38.64 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2417  GTP-binding protein Era  37.46 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.262207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  36.81 
 
 		 311 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1271  GTP-binding protein Era  37.38 
 
 		 307 aa  198  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  37.66 
 
 		 311 aa  198  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  37.79 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>