More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2226 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 299 aa  591  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  77.44 
 
 		 298 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  71.04 
 
 		 297 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  69.02 
 
 		 297 aa  421  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  64.04 
 
 		 296 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  58.39 
 
 		 296 aa  348  9e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  53.36 
 
 		 302 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  53.36 
 
 		 301 aa  332  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  54.03 
 
 		 302 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  53.02 
 
 		 301 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  53.36 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  53.36 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  53.36 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  53.36 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  53.36 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  53.02 
 
 		 301 aa  328  7e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  53.02 
 
 		 301 aa  328  7e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  53.02 
 
 		 301 aa  328  7e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  53.02 
 
 		 301 aa  328  9e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  53.08 
 
 		 302 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  52.56 
 
 		 298 aa  325  6e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  53.04 
 
 		 303 aa  322  6e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  52.22 
 
 		 305 aa  318  6e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  53.77 
 
 		 299 aa  317  1e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  51.19 
 
 		 299 aa  311  7.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  51.19 
 
 		 299 aa  311  7.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  51.84 
 
 		 300 aa  310  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  52.74 
 
 		 303 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 		 303 aa  308  5.9999999999999995e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  51.36 
 
 		 297 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  52.35 
 
 		 303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  52.05 
 
 		 299 aa  306  3e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  48.98 
 
 		 299 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  50.17 
 
 		 293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  51.19 
 
 		 303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  49.49 
 
 		 298 aa  301  6.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 		 294 aa  301  7.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  53.29 
 
 		 310 aa  298  8e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  53.29 
 
 		 310 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  52.96 
 
 		 310 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  50.67 
 
 		 303 aa  296  3e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  53.9 
 
 		 301 aa  293  3e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 300 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  48.11 
 
 		 302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 		 297 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 296 aa  279  4e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 296 aa  279  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  47.8 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  48.29 
 
 		 301 aa  275  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  47.95 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  48.82 
 
 		 311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 310 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  46.94 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  48.81 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  46.98 
 
 		 301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  46.94 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 314 aa  266  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  46.78 
 
 		 305 aa  266  2e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2417  GTP-binding protein Era  48.48 
 
 		 312 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.262207 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1064  GTP-binding protein Era  48.49 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0212543  normal  0.0907756 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0994  GTP-binding protein Era  48.49 
 
 		 312 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307835  normal  0.0847852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0929  GTP-binding protein Era  48.49 
 
 		 312 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163867  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  44.7 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  43.62 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  46.92 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  46.44 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  43.88 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  46.8 
 
 		 311 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  46.8 
 
 		 299 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  43.49 
 
 		 311 aa  259  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  46.1 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  46.8 
 
 		 299 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  47.44 
 
 		 306 aa  259  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  46.8 
 
 		 299 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2898  GTP-binding protein Era  47.65 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22233  normal  0.295103 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  46.8 
 
 		 299 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  46.8 
 
 		 299 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  46.8 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  47.14 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  46.08 
 
 		 339 aa  258  6e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  46.08 
 
 		 339 aa  258  6e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  46.08 
 
 		 339 aa  258  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1086  GTP-binding protein Era  47.32 
 
 		 299 aa  258  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 		 334 aa  258  7e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  43.49 
 
 		 311 aa  258  9e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  44.85 
 
 		 299 aa  258  9e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 338 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  46.08 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  45.73 
 
 		 338 aa  257  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  46.46 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  48.83 
 
 		 451 aa  256  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>