More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_12510 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  100 
 
 
294 aa  593  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  51.2 
 
 
302 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  53.08 
 
 
300 aa  320  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  51.2 
 
 
293 aa  317  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  49.66 
 
 
302 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 
301 aa  316  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 
301 aa  316  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  48.64 
 
 
298 aa  315  6e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  49.49 
 
 
301 aa  314  9e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 
298 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 
301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 
301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 
301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 
301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 
301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 
301 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 
301 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  48.46 
 
 
301 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  50.52 
 
 
303 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 
302 aa  309  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  50 
 
 
303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 
298 aa  306  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  47.42 
 
 
299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  47.42 
 
 
299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  47.08 
 
 
299 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 
299 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  50 
 
 
301 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  49.49 
 
 
305 aa  300  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  47.6 
 
 
300 aa  299  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  47.6 
 
 
308 aa  298  6e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  48.3 
 
 
299 aa  298  8e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 
301 aa  298  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  47.26 
 
 
297 aa  296  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  47.8 
 
 
299 aa  295  8e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  47.6 
 
 
297 aa  295  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  48.31 
 
 
297 aa  294  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 
303 aa  292  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  48.98 
 
 
302 aa  291  8e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  47.26 
 
 
303 aa  291  8e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  46.58 
 
 
296 aa  288  8e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  46.58 
 
 
296 aa  288  9e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  48.29 
 
 
297 aa  285  5e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  50.52 
 
 
301 aa  285  5e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  51.72 
 
 
300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 
306 aa  281  6.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  47.46 
 
 
300 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  51.38 
 
 
301 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  44.07 
 
 
303 aa  277  1e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  47.28 
 
 
296 aa  276  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  47.55 
 
 
299 aa  275  7e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  45.05 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  44.48 
 
 
296 aa  273  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  44.56 
 
 
311 aa  272  5.000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  48.45 
 
 
293 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  47.46 
 
 
305 aa  271  7e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  46.36 
 
 
313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  46.36 
 
 
313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  43.54 
 
 
324 aa  265  8e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 
303 aa  263  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  48.11 
 
 
449 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  45.3 
 
 
307 aa  261  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 
307 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 
310 aa  259  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  45.05 
 
 
314 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  47.42 
 
 
451 aa  258  9e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  46 
 
 
303 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  42.9 
 
 
314 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  45.05 
 
 
314 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 
468 aa  255  7e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  44 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  42.91 
 
 
298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  45.3 
 
 
303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  44.67 
 
 
303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 
318 aa  253  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 
489 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  42.43 
 
 
343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  43.39 
 
 
311 aa  251  7e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  43.39 
 
 
311 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  44.33 
 
 
303 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 
307 aa  250  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  44.86 
 
 
315 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 
299 aa  247  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 
305 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 
303 aa  247  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  41.36 
 
 
303 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  39.4 
 
 
310 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  43.96 
 
 
299 aa  246  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  39.86 
 
 
300 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  42.33 
 
 
311 aa  246  4e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 
300 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1511  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 
319 aa  245  8e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 
304 aa  245  8e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  41.36 
 
 
300 aa  244  9e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 
293 aa  244  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  38.74 
 
 
310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  40.82 
 
 
298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  38.74 
 
 
310 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  40.96 
 
 
315 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  40 
 
 
305 aa  242  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>