More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1506 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  100 
 
 
301 aa  594  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  46.31 
 
 
302 aa  281  9e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  44.63 
 
 
301 aa  275  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  46.84 
 
 
303 aa  272  6e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  44.78 
 
 
301 aa  271  7e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  44.78 
 
 
301 aa  271  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  44.78 
 
 
301 aa  271  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  44.78 
 
 
301 aa  271  7e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  44.78 
 
 
301 aa  271  7e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  44.78 
 
 
301 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  44.78 
 
 
301 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  44.78 
 
 
301 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  43.24 
 
 
300 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 
301 aa  268  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  44.97 
 
 
302 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  44.11 
 
 
301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  47.46 
 
 
303 aa  265  5.999999999999999e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 
302 aa  265  7e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  41.98 
 
 
299 aa  264  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  41.98 
 
 
299 aa  264  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  46.86 
 
 
310 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  46.53 
 
 
310 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  46.2 
 
 
310 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  40.96 
 
 
299 aa  260  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  43.52 
 
 
303 aa  260  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  41.89 
 
 
297 aa  259  6e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  46.91 
 
 
314 aa  258  7e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 
298 aa  258  8e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  45.03 
 
 
307 aa  258  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  45.3 
 
 
303 aa  257  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  45.85 
 
 
315 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  44.82 
 
 
297 aa  256  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  45.98 
 
 
314 aa  254  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2851  GTP-binding protein Era  48.3 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  47.81 
 
 
311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  44 
 
 
294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  43.92 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  43.96 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  46.62 
 
 
337 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  47.65 
 
 
308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  46.49 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2116  GTP-binding protein Era  45.95 
 
 
310 aa  252  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  41 
 
 
298 aa  251  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  45.57 
 
 
311 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 
302 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 
301 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  43.83 
 
 
322 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  45.58 
 
 
300 aa  250  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  43 
 
 
324 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  45.87 
 
 
303 aa  248  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  45.34 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  45.72 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  43.19 
 
 
298 aa  242  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2203  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 
306 aa  242  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.00609862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  43.32 
 
 
318 aa  242  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  42.33 
 
 
301 aa  242  7e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 
303 aa  242  7e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  43.2 
 
 
297 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 
299 aa  241  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  42.03 
 
 
315 aa  240  2e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  44.59 
 
 
318 aa  240  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  41.69 
 
 
298 aa  240  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 
307 aa  240  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  43.54 
 
 
300 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 
298 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  42.38 
 
 
306 aa  239  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3452  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 
299 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00911502  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  43.2 
 
 
299 aa  239  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3515  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 
299 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 
306 aa  238  5.999999999999999e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  43.96 
 
 
306 aa  238  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 
301 aa  238  6.999999999999999e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 
299 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 
299 aa  237  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  44.82 
 
 
300 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3384  GTP-binding protein Era  43.85 
 
 
308 aa  237  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731226  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  42.9 
 
 
310 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  42.53 
 
 
319 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 
489 aa  236  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  44.3 
 
 
312 aa  236  4e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  45.05 
 
 
468 aa  235  6e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 
314 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2229  GTP-binding protein Era  43.18 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  41.69 
 
 
299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1752  GTP-binding protein Era  44.08 
 
 
312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 
296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  42.09 
 
 
310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  42.09 
 
 
314 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 
294 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12310  GTP-binding protein Era  43.53 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  40.33 
 
 
297 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1271  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 
307 aa  232  7.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1662  GTP-binding protein Era  45.33 
 
 
305 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.438796  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  42.57 
 
 
309 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  44.3 
 
 
314 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  40.2 
 
 
307 aa  229  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  41.5 
 
 
293 aa  228  1e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  39.07 
 
 
305 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 
302 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>