More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0808 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 299 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  69.7 
 
 		 301 aa  447  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  66.11 
 
 		 300 aa  413  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  66.11 
 
 		 301 aa  413  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  57.88 
 
 		 306 aa  341  9e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  52.3 
 
 		 302 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  48.99 
 
 		 302 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  48.81 
 
 		 300 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  47.8 
 
 		 300 aa  292  4e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 301 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 301 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 301 aa  291  8e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 301 aa  291  8e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 301 aa  291  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 301 aa  291  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 301 aa  291  8e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  48.14 
 
 		 301 aa  291  9e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 301 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  48.31 
 
 		 301 aa  290  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  48.14 
 
 		 301 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  47.97 
 
 		 302 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  47.96 
 
 		 293 aa  287  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  47.77 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  48.46 
 
 		 298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  47.12 
 
 		 303 aa  281  9e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  48.98 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  47.55 
 
 		 294 aa  275  7e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  47.22 
 
 		 299 aa  268  7e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  47.39 
 
 		 299 aa  265  5e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  45.12 
 
 		 299 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  45.12 
 
 		 299 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  46.13 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  46.62 
 
 		 305 aa  264  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  47.1 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  46.94 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  51.06 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  45.94 
 
 		 297 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  44.33 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  46.74 
 
 		 303 aa  258  7e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  44.85 
 
 		 299 aa  258  9e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  46.45 
 
 		 296 aa  257  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  44.17 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  44.25 
 
 		 298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 		 303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  43.97 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  45.7 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  45.05 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  46.13 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  44.72 
 
 		 303 aa  247  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  43.1 
 
 		 311 aa  247  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  44.67 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  42.2 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  45.7 
 
 		 303 aa  245  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  43.42 
 
 		 303 aa  244  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  45.45 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  47.9 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  43.2 
 
 		 318 aa  241  7.999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  43.34 
 
 		 310 aa  239  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  43.46 
 
 		 301 aa  236  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  46.62 
 
 		 449 aa  235  6e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  42.66 
 
 		 303 aa  235  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 		 313 aa  235  8e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  46.98 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  40.4 
 
 		 343 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  43.96 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  46.74 
 
 		 289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1511  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 		 319 aa  231  9e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  41.52 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  41.34 
 
 		 315 aa  225  8e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  43.4 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  44.07 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  45.91 
 
 		 489 aa  223  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  40.94 
 
 		 303 aa  222  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1743  GTP-binding protein Era  45.29 
 
 		 293 aa  222  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 322 aa  222  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  41.58 
 
 		 307 aa  222  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  42.76 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  42.61 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  43.88 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  39.44 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  40.34 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  38.01 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  43.84 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3384  GTP-binding protein Era  37.71 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731226  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  38.51 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 		 312 aa  219  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  41.58 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  41.03 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  40.7 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  39.58 
 
 		 302 aa  219  6e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  39.13 
 
 		 303 aa  218  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>