More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1377 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 303 aa  617  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  90.76 
 
 		 303 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  90.43 
 
 		 303 aa  567  1e-161  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  81.19 
 
 		 303 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  57.1 
 
 		 343 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  59.93 
 
 		 313 aa  352  4e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  59.6 
 
 		 313 aa  349  3e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  56.86 
 
 		 311 aa  346  3e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1511  GTP-binding protein Era  55.85 
 
 		 319 aa  335  5e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  52.98 
 
 		 314 aa  330  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  52.84 
 
 		 314 aa  318  7e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  52.84 
 
 		 314 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  51.99 
 
 		 311 aa  306  3e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  51.83 
 
 		 310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  51.18 
 
 		 337 aa  302  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  52.68 
 
 		 318 aa  300  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  53.2 
 
 		 318 aa  295  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  52.51 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  45.15 
 
 		 301 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  45.48 
 
 		 302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  45.48 
 
 		 301 aa  265  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  45.48 
 
 		 301 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  45.48 
 
 		 301 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  45.48 
 
 		 301 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  45.48 
 
 		 301 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  45.48 
 
 		 301 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  45.48 
 
 		 301 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  45.48 
 
 		 301 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  45.15 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 		 299 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  45.15 
 
 		 301 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  44.82 
 
 		 302 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 		 299 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  45.36 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  46.38 
 
 		 301 aa  262  4.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  42.72 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  46 
 
 		 294 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  44.78 
 
 		 308 aa  256  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 298 aa  255  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  45.3 
 
 		 293 aa  255  5e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 		 299 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  44.41 
 
 		 303 aa  252  5.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 		 315 aa  251  9.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  45.48 
 
 		 299 aa  248  6e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  43.81 
 
 		 300 aa  248  7e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  44.74 
 
 		 301 aa  248  8e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  45 
 
 		 300 aa  248  9e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  44.48 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  45.97 
 
 		 451 aa  246  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  45.12 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 		 305 aa  245  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  42.23 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  45.3 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  42.05 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  45.64 
 
 		 449 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  41.28 
 
 		 298 aa  242  5e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  41.89 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  42.57 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  43.43 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  42.33 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  41.89 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  42.09 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  42.05 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  40.27 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  39.06 
 
 		 303 aa  228  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  42.52 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  42.67 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  41.28 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  41.28 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 		 468 aa  226  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  40.8 
 
 		 489 aa  226  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  41.12 
 
 		 306 aa  223  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  40.4 
 
 		 303 aa  222  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  38.38 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  39.67 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  39.14 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  41.18 
 
 		 324 aa  215  8e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  38.49 
 
 		 315 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  37.87 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  40.26 
 
 		 293 aa  211  9e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  40.79 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  37.54 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  39 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  36.72 
 
 		 318 aa  209  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  39.33 
 
 		 307 aa  208  7e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  41.08 
 
 		 297 aa  208  9e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  37.54 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  38.21 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  37.75 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  35.57 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1793  GTP-binding protein Era  35.97 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375473  normal  0.0439993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3452  GTP-binding protein Era  37.54 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00911502  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3515  GTP-binding protein Era  37.54 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>