More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3535 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  100 
 
 
324 aa  662    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  53.02 
 
 
303 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 
297 aa  295  6e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  51.36 
 
 
298 aa  295  8e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 
297 aa  291  7e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  46.94 
 
 
298 aa  282  6.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  47.2 
 
 
303 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  47.8 
 
 
299 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  47.95 
 
 
300 aa  275  5e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  46.42 
 
 
293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  50.71 
 
 
296 aa  273  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  48.06 
 
 
302 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  46.45 
 
 
301 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  46.45 
 
 
301 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  46.45 
 
 
301 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  46.45 
 
 
301 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  46.45 
 
 
301 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  47.78 
 
 
303 aa  270  2e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  46.45 
 
 
301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  46.45 
 
 
301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  46.45 
 
 
301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  45.02 
 
 
299 aa  269  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  45.02 
 
 
299 aa  269  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  46.1 
 
 
301 aa  268  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  46.76 
 
 
306 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  44.67 
 
 
299 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  45.74 
 
 
301 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  47.62 
 
 
296 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  47.35 
 
 
302 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 
301 aa  265  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  43.54 
 
 
294 aa  265  8.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  45.52 
 
 
302 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  43.39 
 
 
303 aa  263  4e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  46.1 
 
 
301 aa  262  6e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  45.73 
 
 
293 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  43.49 
 
 
300 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  47.55 
 
 
298 aa  259  4e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 
298 aa  258  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  45.55 
 
 
305 aa  258  8e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  47.04 
 
 
299 aa  258  9e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  46.83 
 
 
298 aa  256  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  47.2 
 
 
298 aa  256  4e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  46.69 
 
 
299 aa  256  4e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  45.99 
 
 
308 aa  256  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  43.62 
 
 
311 aa  255  7e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  47.28 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  44.59 
 
 
314 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  44.59 
 
 
314 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  47.69 
 
 
303 aa  252  7e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 
310 aa  251  9.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  43.62 
 
 
297 aa  250  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  43 
 
 
301 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  47.87 
 
 
301 aa  249  5e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 
294 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  42.37 
 
 
302 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  42.27 
 
 
305 aa  247  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  43.43 
 
 
303 aa  247  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 
295 aa  246  3e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  45.58 
 
 
296 aa  246  3e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  44.56 
 
 
309 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  47.39 
 
 
318 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  43.77 
 
 
300 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  43.3 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  41.16 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  43.14 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  41.16 
 
 
296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 
307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  45.07 
 
 
318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 
337 aa  241  9e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  43.77 
 
 
307 aa  241  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 
306 aa  241  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 
295 aa  240  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 
300 aa  240  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  42.32 
 
 
300 aa  240  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  42.05 
 
 
301 aa  240  2.9999999999999997e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 
306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0656  GTP-binding protein Era  45.52 
 
 
311 aa  239  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2142  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 
299 aa  239  5.999999999999999e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  42.32 
 
 
301 aa  238  8e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2626  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 
311 aa  238  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303676  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  43.54 
 
 
310 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  40.94 
 
 
305 aa  238  9e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0663  GTP-binding protein Era  45.52 
 
 
311 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.747923  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 
318 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  42.33 
 
 
303 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  43.2 
 
 
310 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  43.79 
 
 
289 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  40.48 
 
 
308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  43.2 
 
 
310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  41.02 
 
 
295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  43.11 
 
 
297 aa  235  6e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  43 
 
 
310 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  41.28 
 
 
320 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 
297 aa  235  9e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  42.91 
 
 
312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  42.66 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2613  GTP-binding protein Era  42.7 
 
 
307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>