More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0668 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  100 
 
 
299 aa  608  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  89.3 
 
 
299 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  74.75 
 
 
303 aa  477  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  64.65 
 
 
302 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  64.31 
 
 
301 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  64.65 
 
 
301 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  64.31 
 
 
301 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  64.65 
 
 
301 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  64.65 
 
 
301 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  64.31 
 
 
301 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  64.65 
 
 
301 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  63.3 
 
 
302 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  64.65 
 
 
301 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  63.97 
 
 
301 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  63.97 
 
 
301 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  62.63 
 
 
301 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  60.67 
 
 
303 aa  380  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  61.02 
 
 
299 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  61.02 
 
 
299 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  62.75 
 
 
301 aa  372  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  62.5 
 
 
303 aa  369  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  59.32 
 
 
299 aa  362  5.0000000000000005e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  56.86 
 
 
305 aa  354  1e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  53.9 
 
 
303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  53.38 
 
 
302 aa  332  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  52.72 
 
 
300 aa  325  7e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  50 
 
 
298 aa  323  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  52.03 
 
 
300 aa  322  6e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 
301 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  53.77 
 
 
299 aa  317  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  52.35 
 
 
305 aa  317  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  53.24 
 
 
298 aa  316  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  53.9 
 
 
297 aa  315  7e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  52.05 
 
 
293 aa  315  8e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  52.38 
 
 
298 aa  309  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  53.08 
 
 
297 aa  309  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  51.71 
 
 
308 aa  308  9e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 
297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 
302 aa  298  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  48.3 
 
 
294 aa  298  8e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 
303 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  52.74 
 
 
297 aa  296  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  47.95 
 
 
296 aa  288  8e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  47.6 
 
 
296 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  48.14 
 
 
303 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  49.49 
 
 
296 aa  286  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  49.33 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  48.84 
 
 
300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 
300 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 
311 aa  281  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  48.3 
 
 
307 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  45.61 
 
 
315 aa  280  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  50.53 
 
 
301 aa  280  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 
314 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  47.04 
 
 
310 aa  275  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  48.78 
 
 
301 aa  275  5e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 
314 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  48.44 
 
 
306 aa  275  9e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 
296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  48.33 
 
 
318 aa  273  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  46.86 
 
 
313 aa  270  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  46.67 
 
 
313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  47.22 
 
 
299 aa  268  7e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  48.46 
 
 
315 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 
300 aa  266  4e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  48.17 
 
 
310 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  48.5 
 
 
310 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  47.84 
 
 
310 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  45.76 
 
 
307 aa  264  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  44.93 
 
 
301 aa  261  1e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  47.32 
 
 
318 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  44.7 
 
 
314 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  45.24 
 
 
305 aa  259  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  44.08 
 
 
343 aa  258  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 
320 aa  258  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  44.78 
 
 
293 aa  257  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  45.79 
 
 
295 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  43.81 
 
 
314 aa  257  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2038  GTP-binding protein Era  45.21 
 
 
324 aa  257  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.655908  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  42.37 
 
 
300 aa  256  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  46.69 
 
 
324 aa  256  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  44.18 
 
 
320 aa  256  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 
322 aa  255  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  44.07 
 
 
315 aa  255  8e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  45.58 
 
 
294 aa  255  8e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  44.59 
 
 
303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 
303 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  44.97 
 
 
300 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 
311 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12390  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 
300 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196376  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  43.77 
 
 
307 aa  251  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 
311 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0507  GTP-binding protein Era  43.67 
 
 
301 aa  251  1e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000333853  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 
303 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  45 
 
 
303 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  43.88 
 
 
300 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 
310 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 
297 aa  249  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>